Presentasi sedang didownload. Silahkan tunggu

Presentasi sedang didownload. Silahkan tunggu

SELAMAT DATANG DI PERKULIAHAN BIOKIMIA Tujuan Perkuliahan Mengenalkan dan memahamkan bahasa biokimia : Kosakata (istilah dan struktur kimia), tatabahasa.

Presentasi serupa


Presentasi berjudul: "SELAMAT DATANG DI PERKULIAHAN BIOKIMIA Tujuan Perkuliahan Mengenalkan dan memahamkan bahasa biokimia : Kosakata (istilah dan struktur kimia), tatabahasa."— Transcript presentasi:

1

2 SELAMAT DATANG DI PERKULIAHAN BIOKIMIA

3 Tujuan Perkuliahan Mengenalkan dan memahamkan bahasa biokimia : Kosakata (istilah dan struktur kimia), tatabahasa (reaksi- reaksi kimia), struktur kalimat (Jalur metabolisme) dan arti (keterkaitan metabolik)

4 Apa itu Biokimia? Definisi: –Webster’s dictionary: Bios = Yunani, artinya “hidup” “Kimia mahluk hidup; Kimia yang terjadi dan menjadi ciri kehidupan.” –WebNet dictionary: “Biokimia adalah kimia dari bahan-bahan dan proses-proses yang terjadi dalam tubuh mahluk hidup; sebagai upaya untuk memahami proses kehidupan dari sisi kimia.“

5 Apa itu biokimia?  Pemahaman bentuk dan fungsi biologis dari sudut pandang kimia  Bertujuan untuk memahami interaksi molekul-molekul tak hidup yang menghasilkan fenomena kompleks dan efisien yang menjadi ciri-ciri kehidupan serta menjelaskan keseragaman kimia dari kehidupan yang beragam.

6 Hal-hal yang dipelajari  Struktur kimia dan bentuk tiga dimensi molekul biologi  Interaksi antar biomolekul  Sintesis dan degradasi biomolekul dalam sel  Perolehan dan pemanfaatan energi oleh sel  Mekanisme pengorganisasian biomolekul dan pengkoordinasian aktifitasnya  Penyimpanan, pemindahan dan ekspresi informasi genetika

7 Sejarah Biokimia  Pertama, identifikasi unsur kimia penyusun mahluk hidup. Enam unsur utama penyusun sel hidup adalah: C, H, N, O, P, dan S. Unsur kimia utama penyusun mahluk hidup adalah bahan minor penyusun kerak bumi (kandungan utama 47% O, 28% Si, 7.9% Al, 4.5% Fe, dan 3.5% Ca). 99% penyusun sel adalah H, O, N, dan C UnsurElektron bebasJumlah Fraksi H12/3 O21/4 N31/70 C41/10

8 Unsur dengan berat atom paling ringan membentuk ikatan paling kuat Sebagian besar unsur penyusun bahan hidup memiliki berat atom yang rendah; H, O, N dan C adalah unsur dengan berat atom relatif paling kecil yang masing- masing mampu membentuk ikatan tunggal, rangkap, rangkap 3 dan rangkap 4.

9 Sejarah Biokimia Kemudian, identifikasi tipe molekul yang ditemukan dalam mahluk hidup Asam Amino Nukleotida Karbohidrat Lipida

10 Sejarah Biokimia  Selanjutnya memahami mekanisme biomolekul membuat mahluk hidup menjadi hidup

11 Hubungan antara Biokimia dan ilmu lainnya  Kimia Organik yang mempelajari sifat-sifat biomolekul.  Biofisika, yang memanfaatkan teknik-teknik fisika untuk mempelajari struktur biomolekul.  Nutrisi, yang memanfaatkan pengetahuan tentang metabolisme untuk menjelaskan kebutuhan makanan bagi mahluk hidup mempertahankan kehidupan normalnya.  Kesehatan, yang mencari pemahaman tentang keadaan sakit dari sudut pandang molekular.

12 Mikrobiologi, yang menunjukkan bahwa organisme sel tunggal dan virus cocok untuk digunakan sebagai sarana mempelajari jalur-jalur metabolisme dan mekanisme pengendaliannya. Fisiologi, yang mempelajari proses kehidupan pada tingkat jaringan dan organisme. Biologi sel, yang mempelajari pembagian kerja biokimia dalam sel. Genetika, yang mempelajari mekanisme penyusunan identitas biokimia sel. Hubungan antara Biokimia dan ilmu lainnya

13 (1)ENERGI, hal yang perlu diketahui adalah cara:  Memperolehnya  Mengubahnya  Memanfaatkannya Tiga hal yang dibutuhkan sel

14 (2) MOLEKUL SEDERHANA, hal yang perlu diketahui adalah cara: Mengubahnya Mempolimerisasikannya Mendegradasinya Tiga hal yang dibutuhkan sel

15 (3) MEKANISME KIMIA, untuk: Memperoleh energi Menjalankan reaksi kimia secara berurutan Mensintesis & mendegradasi makromolekul Mempertahankan suatu keadaan steady state yang dinamis Swarakit kembali struktur yang kompleks Menggandakan diri secara akurat dan efisien Mempertahankan keteraturan proses biokimia

16 Strategi sel #1: mahluk hidup menggunakan sistem reaksi kimia berpasangan untuk mendorong reaksi yang sulit terjadi

17 Strategi sel #2: mahluk hidup menggunakan enzim untuk mempercepat reaksi yang semestinya lambat

18 Bagaimana enzim bisa mempercepat reaksi? Penjelasan termodinamis

19 Bagaimana enzim bisa mempercepat reaksi? Penjelasan mekanistis

20 Atom Karbon yang sangat lentur merupakan tulangpunggung kehidupan

21 Konversi isomer kimia membutuhkan pemutusan ikatan kovalen

22 Stereoisomers: Sama secara kimia, berbeda secara biologi

23

24 Transformasi Biokimia dapat dikelompokkan ke dalam 5 kelompok besar Reaksi pemindahan Group Reaksi Oksidasi-reduksi Penyusunan kembali Rearrangements (isomerizations) Reaksi pemotongan Reaksi kondensasi

25 Biomolekul – Struktur Senyawa Pembangun Gula sederhana Asam amino Nukleotida Asam lemak Makromolekul Polisakarida Protein (peptida) RNA or DNA Lipid Anabolic Catabolic

26 Biosintesis Membutuhkan molekul sederhana untuk dirangkai secara kovalen melalui berbagai kombinasi

27 1. Keelektronegatifan kedua atom O3.5 Cl3.0 N3.0 C2.5 P2.1 H2.1 Na0.9 K0.8 Kekuatan ikatan kimia dipengaruhi oleh Keelectronegatifan tinggi =Kebutuhan akan elektron

28 2. Jumlah elektron yang berikatan

29 Kekuatan beberapa ikatan kimia: Approx. Avg. Triple: 820 kJ/mole Double: 610 kJ/mole Single: 350 kJ/mole

30 Gugus Fungsi yang Umum

31 Nukleofil Biologi yang Penting: Gugus fungsi yang kaya elektron

32 BIOKIMIA (MKS1002A) drs. Winarto Hariadi, M.Si. Dr. Sedyo Hartono Dr. Irfan D. Prijambada

33 Jadual & SAP No.Topik KuliahTanggalDosen 1.Pendahuluan : - Konsep dasar biokimia - Reaksi-reaksi biokimia Dr. Irfan D. Prijambada 2.Air dan Buffer Drs. Winarto Hariadi, M.Si. 3.Karbohidrat I - Tinjauan umum - Monosakarida - Disakarida - Polisakarida Drs. Winarto Hariadi, M.Si. 4.Karbohidrat II - Reaksi monosakarida - Ikatan glikosida - Fungsi karbohidrat Drs. Winarto Hariadi, M.Si. 5.Asam Amino dan Protein I - Tinjauan umum - Asam Amino - Biosintesis asam amino Drs. Winarto Hariadi, M.Si.

34 Jadual & SAP No.Topik Kuliah TanggalDosen 6.Asam Amino dan Protein II - Peptida - Struktur protein - Fungsi asam amino dan protein - Biosintesis protein Dr. Irfan D. Prijambada 7.Ujian tengah semesterJadual dari Fakultas Topik Kuliah 1 s/d 6 8.Lipida I - Tinjauan umum - Asam lemak jenuh & tak jenuh - Reaksi asam lemak Dr. Irfan D. Prijambada 9.Lipida II - Fungsi asam lemak dan lipid - Biosintesis asam lemak Dr. Irfan D. Prijambada

35 Jadual & SAP No.Topik Kuliah TanggalDosen 10.Asam nukleat I - Tinjauan umum - Nukleosida dan nukleotida Dr. Sedyo Hartono 11.Asam nukleat II - Struktur DNA dan RNA - Informasi genetik Dr. Sedyo Hartono 12.Enzim - Tinjauan umum - Klassifikasi enzim - Koenzim dan kofaktor - Mekanisme dan kinetika kerja enzim - Penghambatan Dr. Sedyo Hartono

36 Jadual & SAP No.Topik KuliahTanggalDosen 13.Metabolisme I - Tinjauan umum - Jalur metabolisme Dr. Sedyo hartono 14.Metabolisme II - Bioenergetika - Kontrol metabolisme Dr. Sedyo Hartono 15.Ujian Akhir SemesterJadual dari Fakultas Topik Kuliah 8 s/d 14

37 Buku Acuan Trudy McKee and James McKee Biochemistry: The Molecular Basis of Life. Third edition. McGraw-Hill, Boston. Lehninger, Nelson, & Cox Principles of Biochemistry.2 nd edition. Worth Publishers. Albert L. Lehninger Dasar-dasar Biokimia. (Alih bahasa: Maggy Thenawidjaja). Penerbit Erlangga, Jakarta. David S. Page Prinsip-prinsip Biokimia. Penerbit Unair, Surabaya. Soeharsono Biokimia I dan II. Gadjah Mada University Press, Yogyakarta.

38 Penilaian  Total Nilai Ujian + Mid + Tugas dari 4 dosen dibagi 4 (Rata-rata dari Nilai Dosen I + II + III + IV)  Pengharkatan A : > rata-rata kelas + 1,5 x stdev B : < rata-rata kelas + 1,5 x stdev & > rata-rata kelas + 0,5 x stdev C : < rata-rata kelas + 0,5 x stdev & > rata-rata kelas – 0,5 x stdev D : < rata-rata kelas – 0,5 x stdev & > rata-rata kelas – 1,5 x stdev E : < rata-rata kelas – 1,5 x stdev

39 Tata Tertib Kuliah  Tepat waktu, toleransi maks. 15 menit  Tidak Berisik  HP tidak diaktifkan  Hadir minimal 70%  Paham bahasa Indonesia & Inggris  Baca salah satu / dua buku acuan  Kerjakan Tugas, Mid, & Ujian

40 Kesimpulan Karbon dengan struktur tetrahedral memiliki sifat ikatan yang luwes Senyawa yang memiliki banyak atom dapat memiliki bentuk isomerik Untuk konversi perlu terjadinya pemecahan ikatan kimia Molekul berukuran besar dibentuk oleh molekul berukuran kecil melalui pembentukan ikatan baru


Download ppt "SELAMAT DATANG DI PERKULIAHAN BIOKIMIA Tujuan Perkuliahan Mengenalkan dan memahamkan bahasa biokimia : Kosakata (istilah dan struktur kimia), tatabahasa."

Presentasi serupa


Iklan oleh Google