Presentasi sedang didownload. Silahkan tunggu

Presentasi sedang didownload. Silahkan tunggu

Contoh: Lama Penyembuhan dari uji klinis bagi pasien leukemia akut (Klein & Moeschberger, 2003) Ada dua kelompok: 6-mercaptopurine (6-MP) dan placebo dengan.

Presentasi serupa


Presentasi berjudul: "Contoh: Lama Penyembuhan dari uji klinis bagi pasien leukemia akut (Klein & Moeschberger, 2003) Ada dua kelompok: 6-mercaptopurine (6-MP) dan placebo dengan."— Transcript presentasi:

1 Contoh: Lama Penyembuhan dari uji klinis bagi pasien leukemia akut (Klein & Moeschberger, 2003) Ada dua kelompok: 6-mercaptopurine (6-MP) dan placebo dengan total 42 anak pengidap leukemia akut. Pasen tsb diamati sampai leukemianya kambuh atau sampai berhentinya penelitian (dalam minggu). Grup1 6666+79+1010+11+1316 17+19+20+222325+32+ 34+35+ Grup2 11223445588 8811 12 15172223 + Pengamatan tersensor

2 2 Cara paling sederhana membandingkan waktu ketahanan hidup dari dua kelompok individu adalah dengan memplot taksiran dua fungsi ketahanan pada satu gambar. Plot ini akan sangat informatif. Fungsi ketahanan bagi data leukemia sbb Placebo 6-MP

3 Uji log-rank Group#mati pd t (f) #bertahan melebihi t (f) #berisiko sesaat sblm t (f) Im1fm1f n 1f – m 1f n1fn1f IIm2fm2f n 2f – m 2f n2fn2f Totalmfmf n f – m f nfnf - Gabungkan data dari dua kelompok -Misal ada r buah waktu kematian yg berbeda dari gabungan dua kelompok tsb, yakni t (1) < t (2) < … t (r) -Utk setiap waktu kematian t (f), f = 1,2,…,r, kita buat tabel berikut dmn, m 1f = #mati pd t (f) dlm group I m 2f = #mati pd t (f) dlm group II n 1f = #berisiko mati sesaat sebelum t (f) dlm group I n 2f = #berisiko mati sesaat sebelum t (f) dlm group II

4 Pada minggu ke-4, tak ada yg kambuh di grup 1 sedangkan 2 kambuh di grup 2. Pada minggu ke-4, risk set pada grup 1 berjumlah 21 pasien, sedangkan pd grup 2 berisi 16 pasien. Pada minggu ke-10, 1 yg kambuh di grup 1 sedangkan 2 kambuh di grup 2. Pada minggu ke-10, risk set pada grup 1 berjumlah 15 pasien, sedangkan pd grup 2 berisi 8 pasien.

5 i = 1,2

6 H 0 : Kedua kurva fungsi survivor adalah sama Statistik log-rank akan berdistribusi

7 Data leukemia; input weeks status group; cards; 10 1 1 7 1 1 32 0 1 /*data for 6-MP group */ etc 10 0 1 1 1 0 22 1 0 3 1 0 /*data for control group*/ etc 8 1 0; PROC LIFETEST data=leukemia; time weeks*status(0); strata group; RUN; Test of Equality over Strata Pr > Test Chi-Square DF Chi-Square Log-Rank 16.7929 1 <.0001 Wilcoxon 13.4579 1 0.0002 -2Log(LR) 16.4852 1 <.0001

8 group <- rep(c(1,0),c(21,21)) #group: 1=MP6,0=placebo time <- c(10,7,32,23,22,6,16,34,32,25,11,20, 19,6,17,35,6,13,9,6,10,1,22,3,12,8,17,2,11, 8,12,2,5,4,15,8,23,5,11,4,1,8) status <- c(c(1,1,0,1,1,1,1,0,0,0,0,0,0, 1,0,0,1,1,0,0,0),rep(1,21)) #all placebos are dead survdiff(Surv(time,status)~group) survdiff(formula = Surv(time, status) ~ group) N Observed Expected (O-E)^2/E (O-E)^2/V group=0 21 21 10.7 9.77 16.8 group=1 21 9 19.3 5.46 16.8 Chisq= 16.8 on 1 degrees of freedom, p= 4.17e-05

9 H 0 : Semua g kurva fungsi survivor adalah sama Statistik log-rank-nya akan melibatkan varians dan kovarians dari O i - E i dan akan berdistribusi

10 Data adalah lamanya waktu yg diperlukan utk menyelesaikan ujian dengan 3 tingkat kebisingan. Semua ujian akan dihentikan pada menit ke 12 Tingkat Kebisingan Group 1Group 2Group 3 9.010.012.0 9.512.012 + 9.012 + 8.511.012 + 10.012.012 + 10.5 12 +

11 DATA noise; input testtime status group; cards; 9 1 1 9.5 1 1 etc 10.0 1 2 12 1 2 etc 12 1 3 12 0 3 etc; proc lifetest data=noise; time testtime*status(0); strata group; run; Test of Equality over Strata Pr > Test Chi-Square DF Chi-Square Log-Rank 20.3844 2 0.0001 Wilcoxon 18.3265 2 0.0001 -2Log(LR) 5.5470 2 0.0624

12 group <- rep(c(1,2,3),c(6,6,6)) #Noise level:1,2,3 testtime <- c(9,9.5,9,8.5,10,10.5,10,12,12,11,12,10.5,12,12, 12,12,12,12) status <- c(1,1,1,1,1,1,1,1,0,1,1,1,1,0,0,0,0,0) survdiff(Surv(testtime,status)~group) N Observed Expected (O-E)^2/E (O-E)^2/V group=1 6 6 1.57 12.4463 17.2379 group=2 6 5 4.53 0.0488 0.0876 group=3 6 1 5.90 4.0660 9.4495 Chisq= 20.4 on 2 degrees of freedom, p= 3.75e-05 p-value dari pengujian sebesar 3.75  10 -5, artinya terdapat perbedaan yang signifikan dalam ketahanan dr tiga group.

13 Uji Alternatif Selain Log-rank Ingat rumus log-rank i : indeks grup (i = 1,2,...) f : indeks terjadinya waktu mati (f = 1,2,...,r) Statistik uji alternatif dimana w(t (f) ) pembobot bagi waktu mati t (f) 1. Uji Wilcoxon, jika w(t (f) ) = n f yaitu banyaknya yg berisiko mati pd t (f) - Kematian yg lebih awal akan mendpt pembobot yg lebih besar - Cocok, jika efek dr perlakuan lebih kuat pd awal-awal perlakuan - Nama lainnya adalah uji Breslow

14

15


Download ppt "Contoh: Lama Penyembuhan dari uji klinis bagi pasien leukemia akut (Klein & Moeschberger, 2003) Ada dua kelompok: 6-mercaptopurine (6-MP) dan placebo dengan."

Presentasi serupa


Iklan oleh Google