Presentasi sedang didownload. Silahkan tunggu

Presentasi sedang didownload. Silahkan tunggu

IDENTIFIKASI, KLASIFIKASI DAN TAKSONOMI BAKTERI BEBERAPA CARA IDENTIFIKASI DAN KLASIFIKASI 1.KONVENSIONAL TAXONOMY didasarkan pada morfologi, pertumbuhan,

Presentasi serupa


Presentasi berjudul: "IDENTIFIKASI, KLASIFIKASI DAN TAKSONOMI BAKTERI BEBERAPA CARA IDENTIFIKASI DAN KLASIFIKASI 1.KONVENSIONAL TAXONOMY didasarkan pada morfologi, pertumbuhan,"— Transcript presentasi:

1 IDENTIFIKASI, KLASIFIKASI DAN TAKSONOMI BAKTERI BEBERAPA CARA IDENTIFIKASI DAN KLASIFIKASI 1.KONVENSIONAL TAXONOMY didasarkan pada morfologi, pertumbuhan, sifat fisiologi biokimia Fisiologi : uji pH, NaCl, OF, suhu, biovar, bacteriocin Biokimia: uji gram, katalase, oksidase 2. NUMERICAL TAXONOMY didasarkan pd kesamaan dr sejumlah besar karakter fenotipik secara keseluruhan. Metode ini prosesnya lebih lengkap dari pada pd klasifiaksi konvensional, lebih dari 50 karakter fenotipik diuji dan data diprogram di komputer 3.MOLEKULER TAXONOMY didasrkan pada parameter DNA, seperti komposisi dasar guanine cytosine (G+C) homolog, restriksi framen-length polymorphism (RFLP) dan tranfer gen 4.CHEMOTAXONOMY didasarkan pada pembentukan komponen sel, profil metabolik, pigmen misal : komposisi kimia dr peptidoglykan, komponen gula dan asam amino

2 SIFAT- SIFAT AGROBAKTERIUMERWINIAPSEUDOMONASXANTHOMONAS FLAGELcircumtrichperitrichpolarPolar OFOFOO WARNA KOLONI putih Putih beberapa kuning Putih/ fluoresen Kuning/ kadang putih PENGGU NAAN PATI SIFAT-SIFAT PENTING BEBERAPA BAKTERI PATOGEN TANAMAN GRAM NEGATIF

3 Kunci untuk identifikasi bakteri patogen gram negatif 1.Oksidatif …………………………………………………………………………………. 2 fermentatif ……………………………………………………………………………… Erwinia 2.Menghasilkn fluorescen pd medium King’s B ………………………… Pseudomonas tidak menghasilkan ……………………………………………………………… Menghasilkn 3 ketolaktosa pada agar laktosa ………………………… Agrobacterium tidak menghasilkan ……………………………………………………………… Oksidatif + ……………………………………………………………………………. 5 Oksidatif - …………………………………………………………………………… Akumulasi poly-B-hydroxybutirat ( PHB) faktor tumbuh tidak diperlukan …………………………………………………………………… Pseudomonas Tidak tjd akumulasi PHB, biotin diperlukan ………………………... Agrobacterium 6.Koloni kuning ……………………………………………………………………….. Xanthomonas Koloni tidak kuning ……………………………………..Xanthomonas & Pseudomonas

4 TEST YG DIGUNAKAN UNTUK MEMBEDAKAN BEBERAPA SPESIES PSEUDOMONAS PATOGEN TANAMAN Group 1. poly-B-hydroxybutirat tidak terakumulasi, arginin dihydrolase negatif 1. Oxidase negatif …………………………..P. syringae 2. Oxidase positif …………………………… P. cichorii Group 2. Poly-B-hydroxybutirat terakumulasi 1. Arginin dihydrolase positif ………………. P. caryophylii 2. Arginin dihydrolase negatif i. tidak denitrifikasi …………………….... P.cepacia P. gladioli P. solanacearum ii. Denitrifikasi……………………………… P. solanacearum sebagian besar strain

5 No.Reaksi positifReaksi negatif 1Larut dlm KOH 3 % (Gram negatif)Pigmen fluoresen 2.katalasePencairan gelatin 3.Kovac’s oksidaseHidrolisis pati 4.Akumulasi PHBHidrolisis esculin 5.Menggunakan sitratProduksi levan 6.Tumbuh pada medium 1% NaClTumbuh pada medium 2% NaCl 7OksidatifDehidrolase arginin Sifat-sifat fenotipik Bakteri R. solanacearum (Hayward, 1994)

6 SPESIESLEVANOXIDASEPOTATO ROT ARGININ DEHIDROLAS E HR TOBACCO P. syringae+---+ P. fluorescens-+-+- P. viridiflava--+-+ TEST LOPAT UNTUK MEMBEDAKAN PSEUDOMONAD FLUORESEN PATOGENIK DAN NON PATOGENIK

7 RAS 1RAS 2RAS 3RAS 4RAS 5 tanaman Solanaceae, Musaceae yang bersifat diploid Tanaman Musaceae pisang, pisang hias/heliconi a yang bersifat triploid KentangJahemulberry PERBEDAAN RALSTONIA SOLANACEARUM DALAM RAS

8 KARAKTER BIOVAR 1 BIOVAR 2 BIOVAR 3 BIOVAR 4 BIOVAR 5 ASAM DARI: Glukosa Sukrosa Laktosa Maltose Selulosa Manitol Sorbitol Dulcitol Gas dr nitrat PERBEDAAN RALSTONIA SOLANACEARUM DALAM BIOVAR

9 IDENTIFIKASI, KLASIFIKASI, DAN TAKSONOMI Identifikasi Bakteri Ciri-ciri utama genus bakteri patogenik tumbuhan : 1.Agrobakterium - berbentuk batang 0,8 x 1,5- 3 um - bergerak dgn 1 – 4 flagel peritrich atau 1 lateral - menghasilkan polisakarida sangat banyak bila pada medium banyak karbohidrat - koloni tidak berwarna dan halus - pada rizosfer dan soil inhabitant - ada 3 spesies 2. Clavibacter (Corynebacterium) - bentuk batang lurus agak sedikit bengkok 0,5 – 0,9 x 1,5 – 4 um - umumnya tidak bergerak, kadang punya 1-2 flagel polar - gram positif - ada 5 spesies

10 3. Erwinia - bentuk batang lurus 0,5-1,0 x 1,0-3,0 um - bergerak dengan bbrp fflagel peritrich - bersifat anaerob fakultatif - bbrp tidak mengasilkan enzim pektik  nekrotik  E. amilovora - bbrp punya aktifitas pektolitik  busuk lunak  E. carotovora - ada 21 spesies 4. Pseudomonas - bentuk batang yang lurus sampai melengkung 0,5-1 x 1,5-4 um - flagel satu- banyak polar -ada yang menghasilkan pigmen fluoresen ada yang tidak - contoh : P. putida dan P. fluorescens  pigmen fluorescens - P. solanacearum (R. solaancearum)  tidak - Ada 17 spesies

11 6. Streptomyces - hifa ramping - bercabang tanpa sekat melintang, diameter 0,5 – 2 um - semua spesies penghuni tanah tetap - gram positif - ada 2 spesies 5. Xanthomonas - berbentuk batang lurus 0,4-1,0 x 1,2-3 um -flagel satu polar - pada medium agar umumnya kuning - pertumbuhan lambat - semua spesies patogen tumbuhan - ada 5 spesies

12

13

14

15

16

17

18

19

20

21

22

23

24


Download ppt "IDENTIFIKASI, KLASIFIKASI DAN TAKSONOMI BAKTERI BEBERAPA CARA IDENTIFIKASI DAN KLASIFIKASI 1.KONVENSIONAL TAXONOMY didasarkan pada morfologi, pertumbuhan,"

Presentasi serupa


Iklan oleh Google