Presentasi sedang didownload. Silahkan tunggu

Presentasi sedang didownload. Silahkan tunggu

Tujuan Perkuliahan  Mengenalkan dan memahamkan bahasa biokimia : Kosakata (istilah dan struktur kimia), tatabahasa (reaksi-reaksi kimia), struktur.

Presentasi serupa


Presentasi berjudul: "Tujuan Perkuliahan  Mengenalkan dan memahamkan bahasa biokimia : Kosakata (istilah dan struktur kimia), tatabahasa (reaksi-reaksi kimia), struktur."— Transcript presentasi:

1

2

3 Tujuan Perkuliahan  Mengenalkan dan memahamkan bahasa biokimia : Kosakata (istilah dan struktur kimia), tatabahasa (reaksi-reaksi kimia), struktur kalimat (Jalur metabolisme) dan arti (keterkaitan metabolik)

4 Apa itu Biokimia?  Definisi:  Webster’s dictionary: Bios = Yunani, artinya “hidup” “Kimia mahluk hidup; Kimia yang terjadi dan menjadi ciri kehidupan.”  WebNet dictionary: “Biokimia adalah kimia dari bahan-bahan dan proses-proses yang terjadi dalam tubuh mahluk hidup; sebagai upaya untuk memahami proses kehidupan dari sisi kimia.“

5 Apa itu biokimia?  Pemahaman bentuk dan fungsi biologis dari sudut pandang kimia  Bertujuan untuk memahami interaksi molekul- molekul tak hidup yang menghasilkan fenomena kompleks dan efisien yang menjadi ciri-ciri kehidupan serta menjelaskan keseragaman kimia dari kehidupan yang beragam.

6 Hal-hal yang dipelajari  Struktur kimia dan bentuk tiga dimensi molekul biologi  Interaksi antar biomolekul  Sintesis dan degradasi biomolekul dalam sel  Perolehan dan pemanfaatan energi oleh sel  Mekanisme pengorganisasian biomolekul dan pengkoordinasian aktifitasnya  Penyimpanan, pemindahan dan ekspresi informasi genetika

7 Sejarah Biokimia  Pertama, identifikasi unsur kimia penyusun mahluk hidup. 99% penyusun sel adalah H, O, N, dan C Unsur Elektron bebas Jumlah Fraksi H12/3 O21/4 N31/70 C41/10 Enam unsur utama penyusun sel hidup adalah: C, H, N, O, P, dan S. Unsur kimia utama penyusun mahluk hidup adalah bahan minor penyusun kerak bumi (kandungan utama 47% O, 28% Si, 7.9% Al, 4.5% Fe, dan 3.5% Ca).

8 Unsur dengan berat atom paling ringan membentuk ikatan paling kuat Sebagian besar unsur penyusun bahan hidup memiliki berat atom yang rendah; H, O, N dan C adalah unsur dengan berat atom relatif paling kecil yang masing- masing mampu membentuk ikatan tunggal, rangkap, rangkap 3 dan rangkap 4.

9 Sejarah Biokimia  Kemudian, identifikasi tipe molekul yang ditemukan dalam mahluk hidup Asam Amino NukleotidaKarbohidratLipida

10 Sejarah Biokimia  Selanjutnya memahami mekanisme biomolekul membuat mahluk hidup menjadi hidup

11 Hubungan antara Biokimia dan ilmu lainnya  Kimia Organik yang mempelajari sifat-sifat biomolekul.  Biofisika, yang memanfaatkan teknik-teknik fisika untuk mempelajari struktur biomolekul.  Nutrisi, yang memanfaatkan pengetahuan tentang metabolisme untuk menjelaskan kebutuhan makanan bagi mahluk hidup mempertahankan kehidupan normalnya.  Kesehatan, yang mencari pemahaman tentang keadaan sakit dari sudut pandang molekular.

12 Hubungan antara Biokimia dan ilmu lainnya  Mikrobiologi, yang menunjukkan bahwa organisme sel tunggal dan virus cocok untuk digunakan sebagai sarana mempelajari jalur-jalur metabolisme dan mekanisme pengendaliannya.  Fisiologi, yang mempelajari proses kehidupan pada tingkat jaringan dan organisme.  Biologi sel, yang mempelajari pembagian kerja biokimia dalam sel.  Genetika, yang mempelajari mekanisme penyusunan identitas biokimia sel.

13

14

15

16 (1)ENERGI, hal yang perlu diketahui adalah cara:  Memperolehnya  Mengubahnya  Memanfaatkannya Tiga hal yang dibutuhkan sel

17 metabolism is categorized into two types  Catabolism (biodegradation): larger molecules (nutrients and cell constituents) are broken down (often via exergonic reactions) to salvage (reuse) their components or/and to generate energy.  Anabolism (biosynthesis): The generation of biomolecules from simpler components (often via endergonic reactions).

18 (Fuels) Exergonic Oxidation Complex Metabolites Endergonic Reduction Simpler Metabolites Biodegradation Biosynthesis Output of energy Input of energy

19 (2) MOLEKUL SEDERHANA, hal yang perlu diketahui adalah cara:  Mengubahnya  Mempolimerisasikannya  Mendegradasinya Tiga hal yang dibutuhkan sel

20 (3) MEKANISME KIMIA, untuk:  Memperoleh energi  Menjalankan reaksi kimia secara berurutan  Mensintesis & mendegradasi makromolekul  Mempertahankan suatu keadaan steady state yang dinamis  Swarakit kembali struktur yang kompleks  Menggandakan diri secara akurat dan efisien  Mempertahankan keteraturan proses biokimia

21 Strategi sel #1: makhluk hidup menggunakan sistem reaksi kimia berpasangan untuk mendorong reaksi yang sulit terjadi

22 Strategi sel #2: mahluk hidup menggunakan enzim untuk mempercepat reaksi yang semestinya lambat

23 Bagaimana enzim bisa mempercepat reaksi? Penjelasan termodinamis

24 Bagaimana enzim bisa mempercepat reaksi? Penjelasan mekanistis

25 Atom Karbon yang sangat lentur merupakan tulangpunggung kehidupan

26 Stereoisomers: Sama secara kimia, berbeda secara biologi

27 Konversi isomer kimia membutuhkan pemutusan ikatan kovalen

28 Stereoisomers: Sama secara kimia, berbeda secara biologi

29 Transformasi Biokimia dapat dikelompokkan ke dalam 5 kelompok besar  Reaksi pemindahan Group  Reaksi Oksidasi-reduksi  Penyusunan kembali Rearrangements (isomerizations)  Reaksi pemotongan  Reaksi kondensasi

30 Biomolekul – Struktur  Senyawa Pembangun  Gula sederhana  Asam amino  Nukleotida  Asam lemak Makromolekul Makromolekul Polisakarida Polisakarida Protein (peptida) Protein (peptida) RNA or DNA RNA or DNA Lipid Lipid Anabolic Catabolic

31 Biosintesis Membutuhkan molekul sederhana untuk dirangkai secara kovalen melalui berbagai kombinasi

32 1. Keelektronegatifan kedua atom  O3.5  Cl3.0  N3.0  C2.5 P2.1 P2.1 H2.1 H2.1 Na0.9 Na0.9 K0.8 K0.8 Kekuatan ikatan kimia dipengaruhi oleh Keelectronegatifan tinggi =Kebutuhan akan elektron

33 2. Jumlah elektron yang berikatan

34 Functional Groups

35 Kekuatan beberapa ikatan kimia: Approx. Avg. Triple: 820 kJ/mole Double: 610 kJ/mole Single: 350 kJ/mole

36 Functional Groups

37 Nukleofil Biologi yang Penting: Gugus fungsi yang kaya elektron

38 carbohydrate Amino acids Coenzymes (vitamines) Amino acids hormones nucleotides lipids 22nd edition designed by Dr. Donald E. Nicholson

39


Download ppt "Tujuan Perkuliahan  Mengenalkan dan memahamkan bahasa biokimia : Kosakata (istilah dan struktur kimia), tatabahasa (reaksi-reaksi kimia), struktur."

Presentasi serupa


Iklan oleh Google