Presentasi sedang didownload. Silahkan tunggu

Presentasi sedang didownload. Silahkan tunggu

INTERAKSI 6,7,4’-TRIHIDROKSI ISOFLAVON DENGAN ESTROGEN RESEPTOR  Ira handayani 20504007 Pembimbing : Fida M. Warganegara Departemen Kimia Program Pascasarjana.

Presentasi serupa


Presentasi berjudul: "INTERAKSI 6,7,4’-TRIHIDROKSI ISOFLAVON DENGAN ESTROGEN RESEPTOR  Ira handayani 20504007 Pembimbing : Fida M. Warganegara Departemen Kimia Program Pascasarjana."— Transcript presentasi:

1 INTERAKSI 6,7,4’-TRIHIDROKSI ISOFLAVON DENGAN ESTROGEN RESEPTOR  Ira handayani Pembimbing : Fida M. Warganegara Departemen Kimia Program Pascasarjana Institut Teknologi Bandung

2 PENDAHULUAN METODOLOGI PENELITIAN TUJUAN HASIL & PEMBAHASAN TINJAUAN PUSTAKA AGENDA PRESENTASI KESIMPULAN

3 PENDAHULUAN Estrogen Reseptor (ER) merupakan target penting dalam dunia pengobatan sebagai hormon pengganti pada wanita yang menopouse dan sebagai obat kemoterapi melawan kanker Isoflavon kedelai, seperti genistein, daidzein dan glycetein, merupakan fitoestrogen yang terikat dengan afinitas yang rendah terhadap kedua bentuk estrogen reseptor (ER) tetapi cenderung mempunyai afinitas yang lebih tinggi terhadap ER . 6,7,4’-trihidroksi isflavon (faktor 2) merupakan suatu isoflavon yang diisolasi dari tempe kedelai yang difermentasi dengan rhizopus oligosporus. Senyawa ini mempunyai sifat sebagai antioksidan yang lebih tinggi dibandingkan genistein dan daidzein (Murata dkk, 1967 dan Ziliken dkk, 1985). Oleh karena itu diasumsikan bahwa afinitas ikatan faktor 2 dengan estrogen reseptor  jauh lebih tinggi dibandingkan genistein

4 TUJUAN Untuk mengetahui interaksi antara ER  dengan faktor 2 secara komputasi Untuk mengetahui apakah afinitas ikatan faktor 2 dengan estrogen reseptor jauh lebih tinggi dibandingkan isoflavon lainnya sebagai agonis ER 

5 TINJAUAN PUSTAKA

6 Skema Distribusi ER  dan ER 

7 Kode pdb : 1QKM.pdb STRUKTUR ER 

8 Urutan Asam Amino ER  -LBD

9 Skema Interaksi Antara Genistein Dengan ER  -LBD

10  G = K vdw *V vdw + K hb * V hb + K ele * V coul + K tor * V tor + K sol * V sol  G = -RT ln KI KI = e -  G/RT Teori Protein Docking

11 METODOLOGI PENELITIAN Model Ligand Binding Domain ER  Persiapan Database Ligan Docking Reseptor-Ligan dan Virtual Ligan screening.

12 HASIL & PEMBAHASAN Struktur Ligand Binding Domain ER  Database Ligan Docking Reseptor-Ligan dan Virtual Ligan screening.

13 Grafik Energi Minimum Struktur ER  -LBD

14 Sebelum minimisasi & equlibrasi (Biru). Dan setelah minimisasi & equlibrasi (Ungu) Harga RMSD : Stuktur ER  -LBD sebelum dan sesudah minimisasi dan equlibrasi

15 Database Ligan

16 Tabel hasil keluaran Autodock dari docking antara ER  -Faktor 2  = ada - = tidak ada Konform asi Binding Energy (Kcal/mol) Docking energy ( Kcal/mol) Inhib constant Intermol energy ( Kcal/mol) Internal energy ( Kcal/mol) Torsional energy ( Kcal/mol) Ikatan HidrogenHidrogen Lain Glu 305 Arg 346 His e *-Leu339 Gly Trp e  -Gly472 Phe e *  -Phe Ser408 Tyr488 Arg e e  e e Ile e Met473

17 Perbandingan Energi Terendah UrutanLigan Binding energy (Kcal/mol) Docking energy (Kcal/mol) Inhib constant 1Estrogen (E2) e-07 2Faktor e-06 3Genistein e-6 46, 7-dihidroksi-4’- metoksiisoflavon e-06 5Daidzein e-06 6Glycitein e-06 76,4’-dihidroksi- 7- Metoksiisoflavon e-06 8Biochanin A e-06

18 Urutan potensi estrogenik fitoestrogen untuk ER  Menurut Kuiper dkk: E2  genistein = coumestrol  zearalenone  daidzein  biochanin A = apigenin = kaempferol = naringenin  phloretin = quercetin = ipriflavone = formononetin =chrysin Berdasarkan virtual ligan screening: E2 > Faktor 2 > Genistein> 6, 7-dihidroksi-4’- metoksiisoflavon >Daidzein > Glycitein > 6,4’- dihidroksi- 7-Metoksiisoflavon >Biochanin A

19 Interaksi antara ER  dengan faktor 2 merupakan interaksi dengan 4 ikatan hidrogen yaitu interaksi antara gugus O pada faktor 2 dengan gugus H residu Arg346 pada ER . Dan interaksi antara gugus H pada faktor 2 dengan residu Glu305, Gly472, dan Phe356. Afinitas ikatan faktor 2 dengan estrogen reseptor  jauh lebih tinggi dibandingkan genestein, daidzein, biochanin A, glycitein, 6, 7-dihidroksi-4’- metoksiisoflavon dan 6,4’-dihidroksi-7-methoksiisoflavon sebagai agonis ER  Kesimpulan

20 Ucapan Terimakasih Dr. Muhamad A. Martoprawiro (Dosen Kimia Komputasi dan teori) untuk fasilitas komputasi dan diskusi yang membantu penelitian saya

21

22 Model Ligand Binding Domain ER  1QKM.pdb NAMD Energi Minimum Reseptor.pdb T Y

23 Ligan Chemsketch Ligan format 2D Ligan format 3D ACDlabs Molda Ligan.pdb Persiapan Database Ligan

24 Docking Reseptor-ligan Dan Virtual Screening


Download ppt "INTERAKSI 6,7,4’-TRIHIDROKSI ISOFLAVON DENGAN ESTROGEN RESEPTOR  Ira handayani 20504007 Pembimbing : Fida M. Warganegara Departemen Kimia Program Pascasarjana."

Presentasi serupa


Iklan oleh Google