Eksplorasi protein dan proteom

Presentasi berjudul: "Eksplorasi protein dan proteom"— Transcript presentasi:

1 Eksplorasi protein dan proteom
Fungsi protein sangat penting dalam semua proses biologi (a.l. biokatalis, transmisi sinyal, pendukung struktur, alat pertahanan, dan sumber pangan) Proteom: protein-protein yang diekspresikan oleh genom Cacing C. elegans: 97×106 basa, gen pengode protein Lalat D. melanogaster: 180×106 basa, gen pengode protein Manusia: 3×109 basa, gen pengode protein Mengekplorasi protein tidak lain mempelajari individu protein

2 Pemurnian protein Mencari cara pengujian untuk mengidentifikasi protein target Kadar protein kurang dari 1% dari materi awal (sel atau organ)

3 Isolasi protein

4 Beberapa tahap pemurnian
Salting out Dialisis Kromatografi filtrasi gel Kromatografi penukar anion Kromatografi afinitas HPLC (Kromatografi cair kinerja tinggi) Elektroforesis 1D Isoelectric focusing Elektroforesis 2D

5 Dialisis

6 Kromatografi filtrasi gel

7 Kromatografi penukar ion

8 Kromatografi afinitas

9 HPLC

10 Elektroforesis

11

12 Isoelectric focusing

13 Elektroforesis 2D

14 Evaluasi kemurnian

15 Penentuan massa

16 Gradien konsentrasi

17 MALDI-TOF

18 Penentuan komposisi asam amino

19 Pembuatan fragmen peptida

20 Membangun urutan residu

21 Pembuatan antibodi klon tunggal
Antibodi untuk - ELISA - Western blot

22 ELISA

23 Western blot

24 Penentuan struktur dengan NMR

25 Penentuan struktur dengan XRD

26