Presentasi sedang didownload. Silahkan tunggu

Presentasi sedang didownload. Silahkan tunggu

Created by WARAS NURCHOLIS DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB.

Presentasi serupa


Presentasi berjudul: "Created by WARAS NURCHOLIS DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB."— Transcript presentasi:

1 Created by WARAS NURCHOLIS DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

2 Created by WARAS NURCHOLIS DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB Asam nukleat merupakan makromolekul dlm inti sel yg mengandung semua informasi untuk aktivitas maupun reproduksi sel. Berperan: a) Menyimpan informasi genetik b) Proses replikasi dan transkripsi

3 Created by WARAS NURCHOLIS DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB Nukleotida Asam nukleat dibentuk dari nukleotida yg memiliki suatu gula, basa nitrogen, dan fosfat. Sugar Base PO 4 Nukleosida

4 Created by WARAS NURCHOLIS DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB Molekul Gula pada Nukleotida Ribosa merupakan penyusun utama DNA 2-Deoksiribosa merupakan molekul gula pada DNA Ikatan gula ribosa dengan basa nitrogen (pada atom karbon nomor 1). Ikatan gula ribosa dengan gugus fosfat (pada atom karbon nomor 5). Gugus hidroksil pada atom karbon nomor 2 Perhatikan:

5 Created by WARAS NURCHOLIS DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB Basa Nitrogen Basa nitrogen berikatan dengan ikatan-β pada atom karbon nomor1' dari gula ribosa atau deoksiribosa. Pirimidin berikatan ke gula ribosa pada atom N-1 dari struktur cincinnya. Purin berikatan ke gula ribosa pada atom N-9 dari struktur cincinnya.

6 Created by WARAS NURCHOLIS DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB Ribonukleotida – penyusun RNA Gula ribosa yang berikatan dengan basa nitrogen (dalam contoh di samping adalah suatu pirimidin, urasil dan sitosin) pada atom karbon nomor 1‘nya disebut ribonukleosida (dalam contoh di samping adalah uridin dan sitidin). Ribonukleosida yang terfosforilasi pada atom karbon nomor 5‘nya disebut ribonukleotida (dalam contoh di samping adalah uridilat atau sitidilat) Penyampaian ribonukleotida biasanya dalam bentuk singkatan (misalnya) U, atau UMP (uridin monofosfat)

7 Created by WARAS NURCHOLIS DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB Ribonukleotida utama: Perhatikan atom N9 (pada purin) dan N1 (pada pirimidin) yang berikatan dengan atom C nomor 1’ dari ribosa

8 Created by WARAS NURCHOLIS DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB Deoksiribonukleotida – penyusun DNA Gula 2'-deoksiribosa yang berikatan dengan basa nitrogen (dalam contoh di samping adalah purin; adenin dan guanin) pada atom karbon nomor 1‘nya disebut deoksiribonukleosida (dalam contoh di samping adalah deoksiadenosin dan deoksiguanosine). Deoksiribonukleosida yang terfosforilasi pada atom karbon nomor 5‘nya disebut deoksiribonukleotida (dalam contoh di samping adalah deoksiadenilat dan deoksiguanilat). Penyampaian deoksiribonukleotida biasanya dalam bentuk singkatan (misalnya) A, atau dA (deoksiA), atau dAMP (deoksiadenosin monofosfat)

9 Created by WARAS NURCHOLIS DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB Deoksiribonukleotida Utama: Perhatikan atom N9 (pada purin) dan N1 (pada pirimidin) yang berikatan dengan atom C nomor 1’ dari ribosa

10 Created by WARAS NURCHOLIS DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB Penamaan Nukleotida:

11 Created by WARAS NURCHOLIS DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB Penamaan Nukleotida: Nukleosida Difosfat dan Nukleosida trifosfat

12 Senyawa Siklik AMP, Adenosin 3`-monofosfat, dan Adenosin 2`,3`- monofosfat Created by WARAS NURCHOLIS DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

13 Struktur Primer DNA dan RNA A, G, T, C  DNA A, G, U, C  RNA Created by WARAS NURCHOLIS DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB ikatan phosphodiester Ikatan kovalen yang terjadi antara gugus phosphate pada satu nukleotida, dengan gugus OH pada nukleotida lainnya.

14 Struktur tulang punggung DNA, RNA Created by WARAS NURCHOLIS DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB DNA: 5’-ACGTA-3’ /pApCpGpTpA RNA: 5’-ACGTA-3’ /pApCpGpTpA ??

15 Struktur sekunder DNA dan RNA Created by WARAS NURCHOLIS DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

16 Created by WARAS NURCHOLIS DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

17 ANALISIS DNA

18 Ekstraksi DNA Lisis dinding sel dan membran sentrifugasi Pengendapan DNA oleh isopropanol Sentrifugasi kembali Cuci DNA dengan etanol larutkan DNA

19 Kualitas DNA 1 kbp and 100 bp ladders Genomic DNA of 5 species of cereals Ukuran DNA genom dr beberapa Species (kbp) E. Coli 4,640,000 bp Yeast 12,100,000 bp Fruit Fly 140,000,000 bp Human 3,000,000,000 bp Pea 4,800,000,000 bp Wheat 17,000,000,000 bp 12,000,000bp

20 DNA plasmid

21 A B C D E Ladder Intensitas rendah Jumlah sedikit/tipis Tdk ada pemurnian phenol Kualitas DNA RNA

22 Konsentrasi DNA Spektrofotometer (UV): 260 nm. Optical Density Wave Length 260

23 lane 1: total RNA bag Otak. lane 2: total RNA bag hati lane 3: total RNA bag paru-paru lane 4: total RNA bag limpa Total RNA, diisolasi dari jaringan tikus menggunakan EXT-0003 Total RNA: rRNA, tRNA, dan mRNA Kira-kira 95-98% adalah rRNA Pita rRNA (ada 2, ukuran besar dan kecil), smear kemungkinan mRNA dgn berbagai ukuran. Pita yg Paling bawah tRNA Total RNA terlihat baik, bila proses ekstraksi baik

24 Created by WARAS NURCHOLIS DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB Struktur 3D GFP (Green Fluorescent Protein) Ubur-ubur goresan bakteri mengekspresikan GFP GFP Pada Macaca GFP Pada Mencit Aplikasi DNA


Download ppt "Created by WARAS NURCHOLIS DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB."

Presentasi serupa


Iklan oleh Google