TRANSKRIPSI Biosintesis RNA

DOGMA SENTRAL

PRINSIP TRANSKRIPSI Biosintesis RNA menggunakan single strand DNA sebagai cetakan Polimerisasi rantai RNA berlangsung dg arah 5’  3’ Rantai RNA yg merupakan pasangan basa komplementer cetakan DNA (A-U, C-T)

Transkripsi 3 tahap utama transkripsi adalah : inisiasi (permulaan transkripsi) elongasi (pemanjangan) terminasi (akhir proses transkripsi).

Transkripsi Beberapa istilah yg dipakai dlm proses transkripsi : Unit transkripsi : segmen DNA yg digunakan utk transkripsi DNA Segmen DNA lain yg non-transkripsi adalah : promotor, enhancer, operator ( berpengaruh pd frekuensi transkripsi) dr unit & gen regulator yg secara independen melakukan transkripsi & menyebabkan tbtknya protein yg jg berpengaruh pd frekuensi transkripsi.

RNA Polimerase prokariot Enzim RNA polimerase adl protein dg BM 450 kd 4 sub unit : α2 β β’ σ (holoenzim) Pd saat isolasi enzim RNA polimerase akan tdr atas core enzim : α2 β β’ tanpa subunit σ (dsbt faktor sigma) Subunit σ (faktor sigma) diperlukan utk menemukan promoter yg digunakan utk mengawali proses transkripsi & melepaskan diri apabila enzim tdk bekerja.

RNA Polimerase Subunit Jumlah Berat mol Peran α2 2 37000 Tidak jelas β 1 151000 Membentuk ikatan fosfodiester β’ 155000 Mengikat cetakan DNA α70 50000 Mengenali promotor dan mengawali sintesis

Transkripsi – RNA Polimerase eukariot Ditemukan pd inti sel, mitokondria, kloroplas RNA Polimerase pd inti dilakukan oleh 3 mcm enzim yaitu polimerase I, II & III. RNA Polimerase I tdpt dlm nukleoli menghasilkan rRNA (50-70% total RNA). RNA Polimerase II tdpt dlm nukleoplasma mensintesis pra-zat mRNA (20-40% total RNA). RNA Polimerase III tdpt dlm nukleoplasma mentranskripsi tRNA, 5SRNA & RNA kecil lain (10% total RNA)

Transkripsi pd prokariot - INISIASI Tdr atas 2 tahap : Holoenzim mengenal & menempel pd promoter spesifik Pbtk kompleks terbuka (bag untai ganda yg mengelokor) & proses inisiasi baru blgs. Penempelan RNA polimerase pd promoter spesifik yaitu untai 10 nukleotida pd sisi 5’ (rantai -10, dikenal sbg Pribnow Box yg berisi rantai TATAAT & rantai -35 adl TTGACA)

PROMOTER PROKARIOT & EUKARIOT

ELONGASI

TERMINASI TRANSKRIPSI Terminasi transkripsi berlangsung krn : Tjd penghentian proses elongasi akibat tdk tbtknya ikatan fosfodiester yg diikuti dg : Disosiasi hibrida RNA – DNA & kmd : Terlepasnya RNA polimerase dr DNA Proses terminasi dpt berlangsung pd tapak ttt DNA & tdr atas 2 pola : terminasi bebas & terminasi tergantung faktor.

TERMINASI bebas Terbentuknya rantai RNA dengan bentuk hair pin (stem dan loop) yang kaya akan G-C pada stem dan U pada loop.

TERMINASI tergantung faktor Memerlukan protein rho (faktor ρ) dg BM 46000 & bfgs mbtk heksamer yg menempel pd ss RNA sepanjang 72 pasangan basa (setiap subunit protein ρ akan menempel pada 12 nukleotida) Aktivitas ATPase protein ρ akan memungkinkan protein ρ bergerak sepanjang hibrid DNA-RNA dg jalan menarik RNA menjauhi kompleks transkripsi.

terima kasih