HAPLOGROUP mtDNA RFLP MANUSIA LOSS DAN GAIN YANG DITENTUKAN ATAS DASAR URUTAN NUKLEOTIDA LENGKAP GENOM MASTURA NIM : 20504017
Agenda Penelitian Latar Belakang Tujuan Metodologi Hasil dan Pembahasan Kesimpulan
Latar Belakang Peneliti terdahulu telah menentukan Haplogroup mtDNA manusia dengan metode RFLP berdasarkan sisi yang hilang (Loss) dan sisi yang yang diperoleh (Gain) dari enzim restriksi endonuklease Dengan mengetahui posisi mutasi dari urutan nukleotida lengkap genom dari mtDNA manusia maka informasi posisi mutasi tersebut dapat dikaitkan dengan sisi loss dan gain dari metode RFLP
Tujuan Penelitian Untuk melihat keterkaitan posisi mutasi urutan nukleotida lengkap genom dengan sisi Loss dan Gain berdasarkan metode RFLP sehingga akan peroleh haplogroup-haplogroup tertentu dari mtDNA manusia
Metodologi Metode RFLP 1 Loss (-) Gain (+) Haplogroup 2 Urutan Nukleotida Lengkap mtDNA Program MMA Jenis dan posisi mutasi Informasi RFLP Haplogroup teoritis
Hasil dan Pemhasan Individu yang memiliki satu haplogroup berjumlah 133 individu, haplogroup H dan F, haplogruop H sebanyak 120 individu dan haplogroup F, 13 individu. Pada haplogroup satu, jumlah haplogroup yang sama dengan metode RFLP adalah 132 individu yaitu haplogroup H,120 individu dan 12 individu untuk haplogroup F. Haplogroup yang tidak sesuai dengan metode RFLP berjumlah 8 individu, tujuh untuk haplogroup H dan satu untuk haplogroup F.
Kelompok yang memiliki dua haplogroup berjumlah 129 individu, yaitu haplogroup EH, HL, HV, HI, HU, HX, FH, dan DE, masing-masing secara berturut-turut berjumlah 48, 46, 21, 5, 2, 2, 2, 2 dan 1. Untuk haplogroup EH yang sesuai dengan metode RFLP sebanyak 45 individu, 28 individu untuk haplogroup E dan 17 individu untuk haplogroup H, yang tidak sama dengan haplogroup RFLP berjumlah tiga individu. Untuk HL yang sesuai dengan metode RFLP berjumlah 33 individu, terdiri dari haplogroup L 11 individu dan 22 individu untuk H dan sisanya tidak sesuai dengan metode RFLP. Haplogroup HI, HU, FH, DE semuanya sama dengan haplogroup RFLP, untuk AH hanya satu yang sama dan HX tidak terdapat kesamaan dengan haplogroup RFLP.
Individu yang termasuk kedalam tiga haplogroup berjumlah 117 individu yaitu HJT, HIL, EHL, DEH, CEH dan FHI, masing-masing berjumlah 80, 16, 15, 5, 2 dan 1. Untuk haplogroup HJT dari 80 individu, yang sama dengan haplogroup RFLP 78 individu, hanya 2 individu yang haplogroupnya tidak sama dengan RFLP. Untuk haplogroup HIL semuanya sama dengan metode RFLP, sebanyak 5 individu termasuk kedalam haplogroup L, yang tergolong haplogroup HI, enam individu dan 5 individu masuk ke haplogroup IL. Terdapat 14 individu untuk haplogroup EHL yang sama dengan metode RFLP, sedangkan sisanya tidak sama. Untuk individu yang memiliki haplogroup DEH, yang sama dengan metode RFLP sebanyak 3 individu dan sisanya tidak sama, pada haplogroup CEH, hanya satu individu yang sama dan sisa tidak sama, untuk FHI haplogroupnya sesuai dengan metode RFLP.
Kelompok individu yang memiliki empat haplogroup berjumlah 29 individu, terdiri dari haplogroup FHJT, HJLT, EHIL masing-masing berjumlah 19, 4, 3, sedangkan EHJT, AEHL dan FHIL masing-masing berjumlah 1. Untuk haplogroup FHJT, semuanya sesuai dengan haplogroup RFLP, kecuali F. Individu yang memiliki haplogroup HJLT juga sama dengan haplogroup RFLP, kecuali haplogroup L, sedangkan untuk haplogroup EHJT, yang sama dengan RFLP hanya E, haplogroup AEHL hanya AE yang sama dengan RFLP dan FHIL yang sama dengan RFLP adalah F.