ASAM NUKLEAT & PROTEIN FARMASI – FMIPA, UHAMKA 2007 Priyo Wahyudi

Bahasan Asam Nukleat: DNA dan RNA Struktur dan fungsional protein

DNA

Asam nukleat DNA RNA

Struktur DNA DNA adalah suatu polinukleotida yang terbangun atas struktur yang berulang dari Nukleotida, tersusun sebagai rantai ganda. Kata kunci: Bentuk polimer yang berantai ganda (double stranded polymer) Monomer disebut Nukleotida (deoksinukleotida) Satu Nukleotida

Struktur Nukleotida DNA Terbangun atas 3 Komponen: Phosfat : Deoksiribosa : Gula beratom C5 siklik, C berlabel 1’ hingga 5’ Basa Nitrogen :

Nukleosida & dNTP Nukleosida dNTP

Basa Nitrogen DNA Gula & Posfat adalah tetap dalam suatu nukleotida, yang bervariasi adalah Basa Nitrogen, yang terdiri atas 4 jenis, yaitu: Cytosin (C) : Timin (T) : Adenin (A) : Guanin (G) : Pirimidin Purin Pirimidin : molekul berbentuk cincin 6 atom, terdiri atas atom C dan N Purin : molekul yang merupakan gabungan molekul bentuk cincin 5 atom dan 6 atom, yang terdiri atas C dan N

Purin Nucleoside Struktur Basa DNA Pyrimidin

Basa Komplemen

Struktur DNA ss Nukleotida terbentuk jika Posfat berikatan pada atom C5’ dari gula deoksiribosa, dan pada atom C1’ berikatan basa Nitrogen Satu pita DNA dibentuk dari nukleotida yang saling bersambung, melalui suatu ikatan Fosfodiester 1 nukleotida Ikatan Fosfodiester

Pita tunggal DNA 5’ end Nukleotida memanjang dari ujung 5’ ke arah ujung 3’ - P04 pada ujung 5’ (atom C5’) - OH pada ujung 3’ (atom C3’) 3’ end

Pita ganda DNA Dikemukakan oleh Watson & Crick (1953) Pita ganda (double stranded) Berpilin spiral (helical structure) Bersifat anti-paralel Gula-fospat menjadi backbone di bagian luar Pasangan basa di bagian dalam Pasangan basa komplementer: A berpasangan dengan T - 2 ikatan Hidrogen G berpasangan dengan C - 3 ikatan Hidrogen

Model pita ganda DNA Basa Nitrogen Gula - Posfat

3’ 5’ 3’ 5’ Anti-paralel

Model DNA ds

Latihan

RNA

Struktur RNA RNA adalah suatu polinukleotida rantai tunggal yang terbangun atas struktur yang berulang dari Nukleotida RNA. Satu Nukleotida RNA RNA berbeda dari DNA pada: Gula ribosa bukan deoksiribosa Basa Nitrogen Pirimidin Timin, diganti Urasil Ribosa Timin Deoksiribosa Urasil

Tiga Macam RNA Messenger RNA (mRNA) Hasil proses transkripsi DNA yang membawa informasi DNA ke ribosom (tempat terjadi proses sintesa protein) Ribosom RNA (rRNA) RNA penyusun ribosom (>60%) Transfer RNA (tRNA) Berperan dalam proses translasi dengan membawa asam amino yang sesuai dengan kodon pada mRNA

Overview: From gene to protein

Protein

PROTEIN Protein adalah makromolekul yang mempunyai banyak peranan dan fungsi dalam sel, seperti: membangun sel, menyimpan, transport, pertahanan diri dan enzim katalisis. Struktur protein terbangun atas unit-unit asam amino Satu Asam amino Satu asam amino terbangun atas: atom Carbon yang berikatan dengan atom Hidrogen, sebuah gugus Carboksil, suatu gugus amino dan suatu rantai samping R

Asam amino Terdapat 20 jenis asam amino. Rantai samping R menjadi bagian variabel yang membuat asam amino satu berbeda dengan asam amino lainnya. Sifat gugus Rantai samping R pula yang menentukan bagaimana asam amino tersebut saling berinteraksi satu sama lain. Asam aspartat : asam Sistein : polar Glisin : non polar

Polipeptida Asam-asam amino bersambungan membentuk suatu polipeptida melalui ikatan peptida. Urutan (sekuens) asam amino dari suatu rantai menjadi struktur primer suatu protein Ikatan Peptida Rantai Polipeptida Ikatan peptida menghubungkan gugus karboksil dari satu asam amino dengan gugus amino dari asam amino lainnya

Ikatan Peptida

Struktur Protein Struktur Primer Struktur Sekunder Struktur Tersier Struktur Kuarterner

Binding of Protein

Selamat Belajar ....