Metabolisme asam nukleat dan nukleotida

Presentasi berjudul: "Metabolisme asam nukleat dan nukleotida"— Transcript presentasi:

1 Metabolisme asam nukleat dan nukleotida
Di susun oleh : Tsania zuyyina Intan ayu elisa Tundiyati

2 Nukleosida Nukleotida Asam nukleat ?

3 a) Menyimpan informasi genetik b) Proses replikasi dan transkripsi
Asam nukleat merupakan makromolekul dlm inti sel yg mengandung semua informasi untuk aktivitas maupun reproduksi sel. Berperan: a) Menyimpan informasi genetik b) Proses replikasi dan transkripsi DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

4 FUNGSI NUKLEOTIDA Penting untuk semua sel Komponen cofaktor enzim :
CoA; FAD; NAD; NADP Pembawa energi kimia (Energy Carriers): ATP, ADP, GTP Precursor sintesis DNA Precursor sintesis RNA

5 Nukleotida Asam nukleat dibentuk dari nukleotida yg memiliki suatu gula, basa nitrogen, dan fosfat. Sugar Base PO4 Nukleosida DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

6 Molekul Gula pada Nukleotida
Ribosa merupakan molekul gula pada RNA 2-Deoksiribosa merupakan molekul gula pada DNA Perhatikan: Ikatan gula ribosa dengan basa nitrogen (pada atom karbon nomor 1). Ikatan gula ribosa dengan gugus fosfat (pada atom karbon nomor 5). Gugus hidroksil pada atom karbon nomor 2 DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

7

8 Penamaan Nukleotida: DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

9 Struktur Primer DNA dan RNA
A, G, T, C  DNA A, G, U, C  RNA DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

10 “ Two strands” harus saling komplementer satu sama lain
Pasangan Basa A-T dan G-C yang Berikatan Hidrogen A-T memiliki 2 ikt. Hidrogen G-C memiliki 3 Ikt. Hidrogen DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

11 Knowing sequence of one strand, we will know the
sequence of the other strand. e.g. 5’-GCATCGACCTTT-3’ 3’-?????????????????-5’ if 5’-GCATCGACCTTT-3’ ---- Sense, (+), nontemplate, coding strand 3’-CGTAGCTGGAAA-5’ --- Nonsense, (-), template, noncoding strand transcription RNA 5’-GCAUCGACCUUU-3’ DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

12 Model struktur DNA Watson-Crick
DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

13 Molekul DNA sirkular dan superkoil
supercoiled relaxed DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

14 RNA mRNA (messenger RNA) rRNA (ribosomal RNA) tRNA (transfer RNA)
Membawa informasi genetik dari DNA ke ribosom untuk sintesis protein rRNA (ribosomal RNA) Penyusun 65 % ribosom, sisanya protein Mengenali mRNA tRNA (transfer RNA) Menterjemahkan kode genetik dari mRNA menjadi asam amino tertentu

15 RNA

16

17 Replikasi DNA Semikonservatif
DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

18 Proses Replikasi DNA DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

19 Struktur ribosom pada prokariot dan eukariot
DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

20 Metabolisme Asam Nukleat
1. Anabolisme Asam Nukleat Biosintesis Purin Biosintesis Pirimidin 2. Katabolisme Asam Nukleat Degradasi Purin Degradasi Pirimidin DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB Created by WARAS NURCHOLIS

21 Hampir semua organisme mampu mensintesis nukleotida dr prekursor yg lebih sederhana  jalur de novo untuk nukleotida  mirip utk setiap organisme Nukleotida juga dapat disintesis dari hasil pemecahan nukleotida yang telah ada  salvage pathway (recycle) yaitu dari degradasi pirimidin dan purin  dari sel yang mati (regenerasi) atau dari makanan

22

23 Degradasi nukleotida Di dalam usus halus tjd pemutusan ikatan fosfodiester oleh endonuklease (pankreas)  oligonukleotida Dipecah lebih lanjut dg fosfodiesterase (ensim exonuclease non spesifik)  monofosfat Dipecah lbh lanjut fosfomonoesterase dikenal sebagai nukleotidase  menghasilkan nukleosida and orthophosphate. Nucleosida phosphorylase menghasilkan basa dan and ribose-1-phosphate.

24 Jika basa atau nukleosida tidak digunakan kembali utk salvage pathways, basa akan lebih lanjut didegradasi asam urat ureidopropionat (purin) (pyrimidine).

25

26 5-Phospho- -D-ribosyl-1-pyrophosphate (PRPP)
Intermediet untuk baik proses de novo and salvage pathway Berasal dari ribosa 5 phosphat

27 Biosintesis De Novo Purines

28

29

30 GAR synthetase IMP synthase AICAR transformylase GAR transformylase
SAICAR lyase FGAR amidotransferase SAICAR synthetase FGAM cyclase AIR karboksilase

31 Hal-hal penting dalam sintesis de novo purin:
Sangat tergantung pada “pool” ribosa Gugus amina  didonor oleh glutamin dgn enzim amidotransferase Glisin dan fumarat  donor ring dlm nukleotida Daur reaksi  dikontrol secara alosterik dgn AMP, ADP, GMP dan GDP.  bekerja pada PRPP amidotransferase

32 Daur diawali dgn perubahan PRPP  IMP
IMP = Inosine monofosfat mrpkn bentuk nukleotida purin yang pertama dibentuk dlm daur ini Sebagai basa adalah hypoxanthin

33 DAUR dr IMP  AMP & GMP Adenilosuksinat synthetase IMP dehidrogenase
XMP aminase Adenilosuksinat lyase DAUR dr IMP  AMP & GMP

34 Metabolisme de novo nukleotida pirimidine
CP synthetase Aspartat transcarbomoylase Dihidrooratate DH dihydrorotase

35 Degradasi purine Produk akhir katabolisme purin : asam urat

36 Vertebrata terestrial  urea  ureotelic
Burung & reptil  asam urat  uricotelic Binatang di air  ammonia ammonotelic

37 Degradasi pirimidin

38 “ Two strands” harus saling komplementer satu sama lain
Pasangan Basa A-T dan G-C yang Berikatan Hidrogen A-T memiliki 2 ikt. Hidrogen G-C memiliki 3 Ikt. Hidrogen DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

39