TRANSKRIPSI Agustina Setiawati, M.Sc., Apt Replikasi Transkripsi

Presentasi berjudul: "TRANSKRIPSI Agustina Setiawati, M.Sc., Apt Replikasi Transkripsi"— Transcript presentasi:

1 TRANSKRIPSI Agustina Setiawati, M.Sc., Apt Replikasi Transkripsi
Translasi Protein RNA DNA Agustina Setiawati, M.Sc., Apt

2 REFERENSI/PUSTAKA Albert, B., Bray, D., Lewis, J., Rarr, M., Roberts, K. and Watson, J. O., 1994, Molecular Biology of The Cell, 3rd Ed., Garland Publishing, Inc., New York. Lodish, H., Arnold, B., Zipursky, S. L., Matsudara, P., David, B. and Darnell, J. E., 2000, Molecular Cell Biology, W. H. Freeman and Company, London.

3 Double Helix STRUKTUR DNA “Rungs of ladder” Nitrogenous
Base (A,T,G or C) “Rungs of ladder” “Legs of ladder” Phosphate & Sugar Backbone

4 UNIT FUNGSIONAL DNA/RNA

5 Perbedaan struktur gula antara RNA dan DNA

6 BASA DNA PURIN 1. Adenine (A) 2. Guanine (G) PIRIMIDIN 3. Thymine (T)
4. Cytosine (C) A or G T or C

7 Chargaff’s Rule Adenine berpasangan Thymine
Guanine berpasangan Cytosine T A G C

8 BASE-PAIRINGS C G H-bonds T A

9 IKATAN RANTAI DNA

10 IKATAN FOSFODIESTER

11 RANTAI DNA BERSIFAT ANTIPARALEL

12 DNA vs. RNA RNA DNA Rantai tunggal Double Helix Gula ribosa
Adenin berpasangan Uracil! Ditransport ke sitoplasma DNA Double Helix Gula deoksiribosa Adenine berpasangan Thymine (A-T) Tetap ada di nukleus

13 Pendahuluan DOGMA SENTRAL

14 TRANSKRIPSI Proses sintesis RNA (mRNA, t-RNA atau r- RNA)

15 Table 14.2 Types of RNA Type of RNA Functions in Function
Messenger RNA (mRNA) Nucleus, migrates to ribosomes in cytoplasm Carries DNA sequence information to ribosomes Transfer RNA (tRNA) Cytoplasm Provides linkage between mRNA and amino acids; transfers amino acids to ribosomes Figure: Table 14.2 Title: Types of RNA. Caption: Ribosomal RNA (rRNA) Cytoplasm Structural component of ribosomes

16 PRINSIP TRANSKRIPSI TRANSKRIPSI = SINTESIS RNA (mRNA, tRNA, rRNA)
Prekursor : ATP CTP GTP UTP Membutuhkan enzim RNA Polimerase Urutan RNA ditentukan DNA Salah satu untai DNA sebagai cetakan Untai RNA tumbuh dengan arah 5’-3’ Polimerase mulai sintesis tanpa primer

17 Urutan basa RNA ditentukan oleh DNA
CCCTTTGGGAAA DNA Ikatan hidrogen GGGAAACCCUUU RNA TB 15

18 RNA polymerase gene,or operon complementary RNA DNA template TB 41

19 POLIMERASE RNA ( kD) ' holoenzyme ' core enzyme TB 52

20 Langkah pengabungan holo enzim
a a2 a2b a2bb’ = core enzyme aI b b’ aII CORE ENZYME + SIGMA SUBUNIT vegetative (principal s) s70

21 Fungsi Sub Unit RNA Polimerase
aI b b’ aII s70 ' mengikat DNA template  mengikat perkusor RNA (ATP CTP GTP UTP)  penting untuk penggabungan sub unit dan aktivasi enzim s mengenali sekuen promotor pada DNA

22 Promotor Bagian DNA dimana RNA polimerase menempel untuk memulai transkripsi Daerah up stream Daerah down stream Daerah yg ditranskripsikan gene dsDNA promoter Transkripsi mulai Daerah terminasi TB 43

23 Tahap-tahap transkripsi
Inisiasi Elongasi Terminasi

24 Transkripsi pd prokariot - INISIASI
Tdr atas 2 tahap : Holoenzim mengenal dan menempel pd promoter spesifik Terbentuk kompleks terbuka & proses inisiasi baru blgs. Penempelan RNA polimerase pd promoter spesifik yaitu untai 10 nukleotida pd sisi 5’ (rantai -10, dikenal sbg Pribnow Box yg berisi rantai TATAAT & rantai -35 adl TTGACA)

25 PREBEDAAN PROMOTER PROKARIOT & EUKARIOT

26

27

28 Elongasi Perpanjangan rantai RNA

29 PERPANJANGAN TRANSKRIPSI

30 TB TERMINASI TRANSKRIPSI
Terminator : Daerah pada DNA dapat menyebabkan terjadinya terminasi (akhir transkripsi). Terminasi DNA dibedakan menjadi 2, yaitu: 1. Terminasi Bebas 2. Terminasi tergantung Faktor UUUU RNA termination site gene dsDNA region where terminators are usually found TB 46 30

31 RNA polymerase terikat pada loop
TERMINASI bebas Terbentuknya rantai RNA dengan bentuk hair pin (stem dan loop) yang kaya akan G-C pada stem dan U pada loop. RNA polymerase terikat pada loop

32

33

34 TERMINASI tergantung faktor
Memerlukan protein rho (faktor ρ) dg BM & bfgs mbtk heksamer yg menempel pd ss RNA sepanjang 72 pasangan basa (setiap subunit protein ρ akan menempel pada 12 nukleotida) Aktivitas ATPase protein ρ akan memungkinkan protein ρ bergerak sepanjang hibrid DNA-RNA dg jalan menarik RNA menjauhi kompleks transkripsi.

35

36

37 Monosistronik & polisistronik
Molekul mRNA eukariot tdr atas rangkaian2 nukleotida yg dpt ditranslasi & tdk dapat ditranslasi. Polipeptida plg banyak hanya tdr atas 500 asam amino yg dpt ditranslasi, dikenal sbg mRNA monosistronik krn hanya mampu mbtk tdk lbh dr 1 mcm polipeptida. Molekul mRNA prokariosit dpt mentranskripsi lebih dr 1 macam polipeptida, dsbt mRNA polisistronik. Contoh : mRNA polisistronik E. coli pbtk triptofan dg pjg 7000 rangkaian basa dpt mbtk 5 mcm enzim.

38

39 Polisistronik

40 Monosistronik

41 Eukaryotic Transcription
DNA Cytoplasm Nucleus Nuclear pores RNA Transcription G AAAAAA RNA Processing mRNA Export G AAAAAA

42 Transkripsi Eukariotik
Butuh faktor transkripsi: Umum (TFIID, TFIIA, TFIIB, TF IIE, TFIIH, TFIIF) Spesifik: Estrogen—sel payudara

43 A “Simple” Eukaryotic Gene
Transcription Start Site 5’ Untranslated Region 3’ Untranslated Region Introns 3’ 5’ Exon 2 Exon 3 Int. 2 Exon 1 Int. 1 Promoter/ Control Region Exons Terminator Sequence RNA Transcript 3’ 5’ Exon 2 Exon 3 Exon 1 Int. 2 Int. 1

44 mRNA maturasi pada Eukariot
3’ Untranslated Region 5’ Untranslated Region Protein Coding Region 3’ 5’ Exon 2 Exon 3 Int. 2 Exon 1 Int. 1 5’ G 5’ Cap 3’ AAAAA 3’ Poly A Tail Exon 2 Exon 3 Exon 1 Int. 2 Int. 1 Setelah selesai disintesis, mRNA mengalami proses-proses sebagai berikut : Capping pada ujung 5’ Tailing pada ujung 3’ Penghilangan Intron (Splicing)

45 mRNA Capping Melindungi mRNA dari degradasi eksonuklease 5’-3
Inisiasi transkripsi

46 Structure of the 5’ cap Triphosphate linkage 2’ ribose methylations
7mG = 7-methyl guanosine Triphosphate linkage 2’ ribose methylations All eukaryotic mRNAs have a 5' cap, which is synthesized co-transcriptionally, that is, immediately following initiation of transcription. It contains a 7-methyl guanosine residue that is coupled to the 5' nucleotide through a 5'-5' triphosphate bond. In addition to the methyl group on the guanine base, there are two other methylations that are on the 2' ribose sugars of the first two nucleotides.

47 mRNA processing

48 Self splicing

49 CPSF (cleavage/polyadenylation specificity factor)
AAAAAAA…..

50 SELESAI !!!!