SITE-DIRECTED CROSSING

Presentasi berjudul: "SITE-DIRECTED CROSSING"— Transcript presentasi:

1 SITE-DIRECTED CROSSING
Padi donor disilangkan dengan padi host dan individu turunannya (F1) disilang balik (backcross) dengan host untuk mendapatkan turunan BC1F1. Backcross diulangi empat kali (sampai generasi BC5F1) Donor Tahun ke I Tahun ke II Tahun ke III Silang F1 Backcross BC1F1 BC2F1 BC5F2 Backcross Host Backcross BC3F1 BC4F1 Selfing Backcross BC5F1 Backcross Untuk gen resesif (misalnya sifat aromatik), BC5F1 heterozygot kemudian diselfing (silang dengan dirinya) untuk mendapatkan BC5F2. Marker-assisted backcrossing → BC2F1, BC3F1, BC2F2, dsb.

2 KOMPOSISI GENOM PROGENI
Backcross diulangi empat kali (sampai generasi BC5F1) → komposisi genom progeni mendekati  98,44 % host Sifat-sifat baik host dapat dipertahankan (retensi host maksimal) Introgresi donor minimal (hanya sifat yang diinginkan) Tahun ke I Tahun ke II Tahun ke III Donor 50 % : 50 % Silang F1 75 % : 25 % BC1F1 Backcross BC5F2 87,5 % : 12,5 % BC2F1 Backcross 83,75 % : 6,25 % 96,375 % : 3,625 % Host Backcross BC3F1 BC4F1 Backcross Selfing BC5F1 Backcross 98,44 % : 1,56 %

3 ANIMASI : SITE-DIRECTED CROSSING
Seleksi PCR aromatik badh2 host donor F1 BC1F1 BC2F1 BC3F1 BC4F1 BC5F1 badh2 + 50 % : 50 % 75 % : 25 % 87,5 % : 12,5 % 93,75 % : 6,25 % 96,375 % : 3,625 % 98,44 % : 1,56 % Aa AA aa Aa BC5F1 Selfing Homozygot resesif BC5F2

4 INTROGRESI TERARAH (badh2) PADA SITE-DIRECTED CROSSING
Seleksi PCR aromatik badh2 host donor F1 BC1F1 BC2F1 BC3F1 BC4F1 BC5F1 badh2 + 50 % : 50 % 75 % : 25 % 87,5 % : 12,5 % 93,75 % : 6,25 % 96,375 % : 3,625 % 98,44 % : 1,56 % Aa AA aa Aa BC5F1 Selfing Homozygot resesif BC5F2

5 MANFAAT ANALISIS MOLEKULAR
Tahun ke I Tahun ke II Tahun ke III PCR Donor Selfing Selfing PCR Silang F1 BC1F1 Selfing Backcross BC2F1 PCR Backcross Selfing Host BC3F1 Backcross Selfing BC4F1 Backcross BC5F1 Backcross Selfing diganti dengan seleksi PCR berbasis marka badh2 BC5F2 AA Aa Aa aa Selfing: → mengurangi waktu dan biaya