PROSEDUR Deteksi Fragmen Spesifik Gen cyt b Berbagai Jenis Ternak

Presentasi berjudul: "PROSEDUR Deteksi Fragmen Spesifik Gen cyt b Berbagai Jenis Ternak"— Transcript presentasi:

1 PROSEDUR Deteksi Fragmen Spesifik Gen cyt b Berbagai Jenis Ternak
Perancangan Primer Spesifik Tikus Uji Homologi Sekuen cyt b Tikus Uji Fragmen Spesifik Gen cyt b Pembuatan Produk Olahan (Kontrol Positif) Deteksi Cemaran Tikus pada Produk Olahan Gambar 1. Tahapan Prosedur Penelitian.

2 Pembuatan bakso dicemari daging tikus
+ Daging sapi dipotong kecil+daging tikus Ditambahkan es batu dan garam, digiling halus 1’ Ditambahkan tapioka dan bumbu, digiling halus 1’ air panas (100oC); 10’ Dimasukkan ke dalam panci berisi air panas (80oC);15’ Dicetak bulat

3 GeneAmp® PCR System 9700 (Applied Biosystems™)
Annealing 62°C; 0.75 min Extension 72°C; 1 min Denaturation 94°C; 0.5 min Amplifikasi Gen cyt b Initial Denaturation 94°C; 5 min 30 siklus GeneAmp® PCR System 9700 (Applied Biosystems™) Final Extension 72°C; 5 min

4 HASIL YANG TELAH DICAPAI
Pengujian Homologi Tujuh Jenis Ternak Tabel 4. Derajat kesamaan (% homologi) primer spesifik pada beberapa spesies ternak Primer Spesifik % Homology Kambing Ayam Sapi Domba Tikus Babi Kuda Forward (38 bp) 100 (38) 86,8 (38) 92,1 (38) 94,7 (38) 89,5 (38) Kambing (26 bp) 96,2 (26) 64,7 (17) 79,2 (24) 91,7 (24) 100 (6) 83,3 (24) Ayam (27 bp) 66,7 (30) 100 (27) 77,0 (13) 100 (7) 77,8 (27) 70,0 (20) 90,0 (10) Sapi (29 bp) 81,5 (27) 72,2 (18) 100 (29) 72,4 (29) 78,6 (14) 79,3 (29 Domba (26) 96,0 (25) 73,7 (19) 95,0 (20) 100 (26) 100 (8) 61,9 (21) 89,5 (19) Tikus (25 bp) 95,5 (22) 95,8 (24) 95,7 (23) 100 (25) 87,0 (23) Babi (27 bp) 76,9 (13) 71,4 (21) 80,8 (26) 69,2 (13) 84,6 (26) Kuda (26 bp) 84,0 (25) 68,0 (25) 76,0 (25) 80,0 (25) 92,0 (25)

5 HASIL YANG TELAH DICAPAI
Pengujian Homologi Spesies Tikus Sekuen gen cyt b Rattus norvegicus dihomologikan dengan Rattus argentiventer, Rattus rattus dan Mus musculus Tabel 5. Hasil Uji Homologi Sekuen Gen Sitokrom b Rattus norvegicus Spesies No. Akses Derajat Kemiripan Rattus argentiventer AB 88 % Rattus rattus AJ 96 % AB 89 % AB Mus musculus EF 95 % EF 94 % DQ EF AY Sumber : Program BLAST (