KARAKTERISTIK HABITAT & BARCODE DNA UDANG MANTIS (Stomatopoda) DI PERAIRAN PULAU LEMON Jenly Haurissa MSP 2015 30 054 SEMINAR KOLOKIUM.

Presentasi berjudul: "KARAKTERISTIK HABITAT & BARCODE DNA UDANG MANTIS (Stomatopoda) DI PERAIRAN PULAU LEMON Jenly Haurissa MSP 2015 30 054 SEMINAR KOLOKIUM."— Transcript presentasi:

1 KARAKTERISTIK HABITAT & BARCODE DNA UDANG MANTIS (Stomatopoda) DI PERAIRAN PULAU LEMON
Jenly Haurissa MSP SEMINAR KOLOKIUM

2 Tingginya Keanekaragaman Hayati Belum di imbangi dengan
Habitat Characteristics and DNA Barcode of Mantis Shrimp in the Waters of the Lemon Island Pendahuluan Perairan Pulau Lemon Tingginya Keanekaragaman Hayati Belum di imbangi dengan Data yang Valid ??? Salah satu biota asal perairan tersebut adalah Udang mantis (Mantis Shrimp)

3 untuk yang bertipe penghancur (smashers) dapat menghancurkan
Habitat Characteristics and DNA Barcode of Mantis Shrimp in the Waters of the Lemon Island 1. SPEARER 2. SMASHER Ex. Lysiosquilloidae Ex. Gonodactyloidae Untuk udang mantis yang organ berburunya penusuk (spearer) dapat menusuk mangsanya pada bagian tubuh mangsanya yang lunak, untuk yang bertipe penghancur (smashers) dapat menghancurkan mangsanya dengan cara menghantam mangsa yang mempunyai tubuh keras.

4 ………About Mantis Shrimp……….
Habitat Characteristics and DNA Barcode of Mantis Shrimp in the Waters of the Lemon Island ………About Mantis Shrimp………. Umumnya udang mantis hidup didasar perairan laut yang dangkal, iklim tropis maupun sub-tropis Udang mantis sering disebut sebagai Udang ronggeng, Udang Lipan, udang getak dll. Dasar perairan tempat hidup Udang mantis umumnya berlumpur, berpasir dan berkarang. Udang mantis hidup didasar perairan dengan membuat lubang/sarang sebagai rumah mrka. Udang mantis termasuk hewan karnivora dan termasuk hewan yang aktif di siang hari (diurnal), malam hari (nokturnal), (crepuscular). Martin & Davis (2001), menyabutkan bahwa udang mantis masuk dalam sub-filum Crustacea, kelas Malocostraca, sub-kelas Hoplocarida dan ordo Stomatopoda.

5 Habitat Characteristics and DNA Barcode of Mantis Shrimp in the Waters of the Lemon Island
Deskripsi morfologi udang mantis sangat beragam, terdapat ± 450 spesies tersebar diseluruh dunia (Ahyong dkk., 2008) spesies (26%) diantaranya bisa ditemukan di perairan Indonesia (Ahyong dkk , Moosa 2000) Taksonomis tidak cukup mengklasifikasikan secara morfologi, untuk itu Hebert dkk. (2003) memperkenalkan Barcode DNA sebagai sarana untuk mengidentifikiasi semua sepesies hewan, termasuk identifikasi udang mantis.

6 Habitat Characteristics and DNA Barcode of Mantis Shrimp in the Waters of the Lemon Island
Barcode & Barcode DNA Barcode DNA atau DNA barcoding diusulkan pertama kali oleh Hebert dkk. (2003), yang menyatakan bahwa semua spesies organisme dapat diidentifikasi dengan menggunakan sekuen pendek dari sebuah gen yang posisinya di dalam genom yang telah terstandarisasi (disepakati bersama) yang disebut sebagai “DNA Barcode”. Barcode DNA Barcode Barang

7 Habitat Characteristics and DNA Barcode of Mantis Shrimp in the Waters of the Lemon Island
Identifikasi Masalah Udang mantis cenderung memilih habitat yang sesuai dengan kehidupannya, namun saat ini belum diketahui secara pasti kharakteristik habitat dan jenis udang mantis yang terdapat di perairan Pulau Lemon. Bagaimanakah kondisi habitat udang mantis di perairan Pulau Lemon saat ini ? Jenis udang mantis apa saja yang terdapat di perairan Pulau Lemon ? Apakah data kharateristiik habitat udang mantis dapat menunjang pengamatan & penelusuran identitas udang mantis dengan metode/teknik barcode DNA di perairan Pulau Lemon ?

8 Habitat Characteristics and DNA Barcode of Mantis Shrimp in the Waters of the Lemon Island
Batasan Masalah Berdasarkan identifikasi masalah maka masalah hanya berbatas pada biota yang diteliti adalah udang mantis dari ordo (Stomatopoda) yang hidup di perairan Pulau Lemon. dan bagaimana kharakteristik habitat udang mantis di perairan Pulau Lemon serta penentuan udang mantis menggunakan Barcode DNA.

9 Habitat Characteristics and DNA Barcode of Mantis Shrimp in the Waters of the Lemon Island
Perumusan Masalah Kurangnya penelitian & informasi tentang kharakteristik habitat dan penentuan spesies udang mantis adalah bagian dari permasalahan yang belum terungkap. Apakah udang mantis yang ada di perairan Pulau Lemon hanya terdiri atas satu spesies saja ? Terdapat beberapa karakteristik habitat di perairan Pulau Lemon, apakah karakteristik habitat yang berbeda dapat menentukan spesies udang mantis yang berbeda pula atau tidak ? Bagaimanakah barcode DNA dapat menjawab/ menggungkap identitas spesies udang mantis diperairan Pulau Lemon menggunakan prosedur yang telah baku ?

10 Habitat Characteristics and DNA Barcode of Mantis Shrimp in the Waters of the Lemon Island
Tujuan Mengetahui dan mengenal kharakteristik habitat udang mantis (Stomatopoda) di perairan Pulau Lemon. Bagaimana penggunaan barcode DNA dalam mengungkap identitas spesies udang mantis (Stomatopoda) di perairan Pulau lemon.

11 Manfaat 1. Secara Teoritis 2. Secara Praktis
Habitat Characteristics and DNA Barcode of Mantis Shrimp in the Waters of the Lemon Island Manfaat 1. Secara Teoritis Diharapkan dapat menyajikan informasi tentang karakteristik habitat udang mantis dan jenis udang mantis yang teridentifikasi menggunakan metode barcode DNA, sebagai sumbangan perkembangan informasi mengenai udang mantis di perairan Pulau Lemon dan dapat menjadi sumbangan pemikirian bagi peneliti lainnya yang akan melakukan penelitian lebih lanjut. 2. Secara Praktis Bagi masyarakat di Pulau Lemon diharapkan sebagai masukan untuk pemanfaatan semberdaya uang mantis yang hidup di perairan Pulau lemon.

12 Gambar. Peta Lokasi Penelitian
Habitat Characteristics and DNA Barcode of Mantis Shrimp in the Waters of the Lemon Island Metode Waktu & Lokasi Penelitian akan dilaksanakan dalam kurun waktu 3 bulan yaitu dimulai pada bulan September – November Untuk analisis Lab. akan dilaksanakan di laboratorium Genetika, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan – Universitas Papua Manokwari. Pengembilan sample udang mantis berlokasi di perairan Pulau Lemon. Gambar. Peta Lokasi Penelitian

13 Habitat Characteristics and DNA Barcode of Mantis Shrimp in the Waters of the Lemon Island
ANALISIS HABITAT Analisis Kharakteristik Habitat, dilakukan Pengukuran beberapa parameter lingkungan perairan dititik lokasi udang Mantis tersebut hidup. Parameter yang di Amati antara lain : Suhu, Oksigen terlarut, Kecepatan Arus, kedalaman, Salinitas dan pH air Alat – alat yang digunakan untuk pengamatan dilapangan antara lain : Salino meter/Refraktometer pH Meter DO Meter Curren Meter Roll Meter Termometer suhu

14 ANALISIS LABORATORIUM
Habitat Characteristics and DNA Barcode Mantis Shrimp in the Waters of the Lemon Island ANALISIS LABORATORIUM Objek, Alat & Bahan Objek dalam penelitian ini adalah udang mantis dari ordo stomatopoda yang terdapat di perairan Pulau Lemon. Alat & Bahan 1 set alat Snorkling Kertas label Plastik sampel Sarung tangan ATK Camera waterproof Selengkapnya Alat & Bahan Laboratorium Teman-teman bisa melihat pada ringkasan…!!!!

15 Teknik Pengumpulan Data
Habitat Characteristics and DNA Barcode Mantis Shrimp in the Waters of the Lemon Island Jenis Penelitian Penelitian bersifat desriptif eksploratif observational yaitu pengamatan langsung ke lokasi penelitian dengan menelusuri keberadaaan udang mantis di perairan Pulau Lemon & mengamati habitat udang mantis secara langsung kemudian analisis laboratorium (DNA) dan analisis barcode DNA. Teknik Sampling Menggunakan teknik survei jelajah eksploratif, mencari udang mantis di tempat persembunyiannya. sample yang ditemukan belum diketahui identitas jenisnnya. Teknik Pengumpulan Data Teknik pengumpulan data dilakukan dengan cara observasi langsung, dimana peneliti ikut terlibat dalam pengamatan dan pengambilan sampel di lapangan.

16 Gambar. Tahapan Prosedur Penelitian
Habitat Characteristics and DNA Barcode Mantis Shrimp in the Waters of the Lemon Island Prosedur Penelitian Penelitian akan dilakukan dalam 4 tahap yaitu pengambilan sampel di lapangan, analisis sampel DNA di Lab. dan selanjutnya penentuan barcode DNA udang mantis, yang meliputi beberapa tahapan sebagai berikut : Gambar. Tahapan Prosedur Penelitian

17 Hasil Tahapan Analisis Laboratorium
Habitat Characteristics and DNA Barcode Mantis Shrimp in the Waters of the Lemon Island Hasil Tahapan Analisis Laboratorium CONTOH SAMPEL YANG DI PASTIKAN POSITIF..!!! DI TANDAI DGN GARIS LINGKARAN MERAH DAN CONTOH SAMPEL DIPASTIKAN NEGATIF..!!!

18 Habitat Characteristics and DNA Barcode Mantis Shrimp in the Waters of the Lemon Island
Analisis Data Hasil Sekuensing kemudian dikirim kembali dalam bentuk file berupa urutan nukleotida (A G T C) setelah itu dilakukan editing sequen (Mengedit data hasil sequensing) untuk memudahkaan dalam proses pembuatan pohon filogeni atau asal-usal objek penelitian serta identitas spesies udang mantis. Untuk menganalisis data sequencing (editing) dilakukan pengeditan menggunakan Software MEGA 7.0. Pengeditan data sequen harus benar- benar teliti karena berpengaruh terhadap hasil. Untuk proses identifikasi dilakukan dengan mencocokkan sepuen satu/satu ke dalam dengan data Gane bank.

19 Prosedur Penggunaan Sofeware Mega
Habitat Characteristics and DNA Barcode Mantis Shrimp in the Waters of the Lemon Island Prosedur Penggunaan Sofeware Mega KLIK MEGA MASUKAN DATA HASIL SEQUENSING

20 Penentuan Identitas Udang Mantis dengn BOLD
Habitat Characteristics and DNA Barcode Mantis Shrimp in the Waters of the Lemon Island Penentuan Identitas Udang Mantis dengn BOLD OPEN SALAH SATU GENE BANK (BOLD) KLIK IDENTIFIKASI REQUEST MASUKAN DATA HASIL SEQUEN & EDITING KE DALAM KOLOM LINGKARAN MERAH KLICK SAUBMIDT

21 Tahapan Penentuan Identitas Sampel
Habitat Characteristics and DNA Barcode Mantis Shrimp in the Waters of the Lemon Island Tahapan Penentuan Identitas Sampel

22 Habitat Characteristics and DNA Barcode Mantis Shrimp in the Waters of the Lemon Island
IDENTITAS DI TEMUKAN…!!!

23 Habitat Characteristics and DNA Barcode Mantis Shrimp in the Waters of the Lemon Island
  