REPLIKASI DNA Agustina Setiawati Microteaching USD 9/19/2018.

Presentasi berjudul: "REPLIKASI DNA Agustina Setiawati Microteaching USD 9/19/2018."— Transcript presentasi:

1 REPLIKASI DNA Agustina Setiawati Microteaching USD 9/19/2018

2 REFERENSI Albert, B., Bray, D., Lewis, J., Rarr, M., Roberts, K. and Watson, J. O., 1994, Molecular Biology of The Cell, 3rd Ed., Garland Publishing, Inc., New York. Lodish, H., Arnold, B., Zipursky, S. L., Matsudara, P., David, B. and Darnell, J. E., 2000, Molecular Cell Biology, W. H. Freeman and Company, London. 9/19/2018 Microteaching USD

3 Aplikasi Replikasi DNA
OVERVIEW MATERI Pendahuluan Prinsip Replikasi DNA Tahap Replikasi DNA Problem Replikasi DNA Aplikasi Replikasi DNA 9/19/2018 Microteaching USD

4 PENDAHULUAN DOGMA SENTRAL Replikasi Transkripsi Translasi Protein RNA
DNA 9/19/2018 Microteaching USD

5 PENDAHULUAN TEORI REPLIKASI DNA konservatif semi konservatif dispersif
Messelson and Stahl, 1958 9/19/2018 Microteaching USD

6 REPLIKASI PADA CELL CYCLE
PENDAHULUAN REPLIKASI PADA CELL CYCLE 9/19/2018 Microteaching USD

7 Replikasi bersifat semi konservatif
Prinsip Replikasi DNA Replikasi bersifat semi konservatif 9/19/2018 Microteaching USD

8 Prinsip Replikasi DNA Double strand DNA berperan sebagai template dengan leading strand dan lagging strand 9/19/2018 Microteaching USD

9 Prinsip Replikasi DNA Rantai DNA hasil replikasi mempunyai pasangan basa yg komplemen dengan DNA template (A=T, GC) Dalam replikasi, DNA polimerase membutuhkan primer 9/19/2018 Microteaching USD

10 Prinsip Replikasi DNA Replikasi dimulai dari ujung 5’ ke 3’ 9/19/2018
Microteaching USD

11 ENZIM REPLIKASI topoisomerase helicase ssDNA binding protein primase
DNA polymerase III DNA polymerase I DNA ligase 9/19/2018 Microteaching USD

12 TAHAP REPLIKASI (1) Enzim topoisomerase mengendurkan DNA supercoil dengan memotong dan menyambung kembali rantai DNA Topoisomerase I Topoisomerase II 9/19/2018 Microteaching USD

13 TAHAP REPLIKASI (2) Pembukaan double strand DNA melalui pengrusakan ikatan H oleh enzim helikase helikase 5’ 3’ 9/19/2018 Microteaching USD

14 TAHAP REPLIKASI (3) ss binding protein menstabilkan ss DNA dan mencegah terbentuknya ikatan basa 5’ 3’ ssDNA binding protein 9/19/2018 Microteaching USD

15 TAHAP REPLIKASI (4) Enzim primase mensintesis primer pada DNA template
ss binding protein 5’ 3’ 9/19/2018 Microteaching USD

16 Primer & Primase Primer adalah rantai RNA +/- 10 nukletida
Primase : RNA polimerase Why does DNA replication need primer? from Alberts et al., Molecular Biology of the Cell, 4th ed., Fig 5-12 9/19/2018 Microteaching USD

17 TAHAP REPLIKASI (5) DNA polimerase III mensintesis DNA pada leading strand maupun lagging strand helicase ssDNA binding proteins primer 5' DN A polimerase III Leading strand 9/19/2018 Microteaching USD

18 TB 5' 3' Lagging strand Okazaki fragment
primase helicase ssDNA binding proteins pol III 3' Okazaki fragment (~1000 bases) 5' Lagging strand DNA polimerase III mengoreksi kesalahan sintesis melalui aktivitas eksonuklease 3’-5’ (proofreading) 9/19/2018 Microteaching USD TB

19 Reaksi proofreading 9/19/2018 Microteaching USD

20 TAHAP REPLIKASI (6) DNA polimerase I menghilangkan primer melalui aktivitas eksonuklease 5’ - 3’ DNA polimerase I mengisi gap yang kosong pol I 5' 3' 9/19/2018 Microteaching USD

21 DNA POLIMERASE I & DNA POLIMERASE III
Eksonuklease 5’- 3’ (untuk hidrolisis primer) Mengisi gap (kekosongan fragmen DNA) akibat hidrolisis primer Eksonuklease 3’ – 5’ untuk proofreading Sintesis DNA dengan inisiasi primer Eksonuklease 3’-5’ (untuk proofreading) 9/19/2018 Microteaching USD

22 TAHAP REPLIKASI (7) Ligasi (penyambungan) fragmen DNA oleh enzim ligase membentuk ikatan fosfodiester antara 3’-OH dan 5’-P fragmen 2 9/19/2018 Microteaching USD

23 Figure 11.7 9/19/2018 Microteaching USD
Breaks the hydrogen bonds between the two strands Alleviates supercoiling Keep the parental strands apart Synthesizes an RNA primer 9/19/2018 Microteaching USD

24 PROBLEM REPLIKASI Rantai DNA yg baru lebih pendek dibandingkan dengan DNA template 9/19/2018

25 Telomerase solves the Replication Problem
Its an RNA dependent DNA polymerase that synthesizes telomeric DNA sequences. Telomer DNA : sekuen DNA pada ujung berupa sekuen terulang 9/19/2018 Microteaching USD

26 Telomerase solves the Replication Problem
primer 9/19/2018 Microteaching USD

27 POLYMERASE CHAIN REACTION (PCR)
APLIKASI REPLIKASI POLYMERASE CHAIN REACTION (PCR) 9/19/2018 Microteaching USD

28 PCR mengamplifikasikan rantai DNA spesifik dengan menggunakan prinsip perubahan suhu
9/19/2018 Microteaching USD

29 9/19/2018 Microteaching USD

30 9/19/2018 Microteaching USD

31 DETEKSI VIRUS HIV 9/19/2018 Microteaching USD

32 DNA FINGERPRINT 9/19/2018 Microteaching USD

33 THANK YOU TERIMA KASIH 9/19/2018 Microteaching USD