ANALISA SIKUEN GEN CP POTYVIRUS

Presentasi berjudul: "ANALISA SIKUEN GEN CP POTYVIRUS"— Transcript presentasi:

1 ANALISA SIKUEN GEN CP POTYVIRUS
[HOMOLOGI DENGAN SIKUEN CP VIRUS LAIN] Isolat Virus Homologi (%) 1 2 3 4 5 6 7 8 PStV.Indo1 PStV.India 93,5 TeMV.Hanoi 75,9 74,5 Pangda12-1 76,8 88.7 Pangda15-1 77,1 76,2 89,0 99,0 Pasaman 72,6 69,8 85,6 85,1 84,9 Garut 74,3 73,6 90,8 87,1 87,4 86,9 Ciamis 90,3 87,6 97,7 PatMMV.R2 37,3 37,5 36,6 38,2 37,9

2 ANALISA SIKUEN GEN CP POTYVIRUS
[HUBUNGAN KEKERABATAN DENGAN VIRUS LAIN] Potyvirus Fabavirus Filogenetika kekerabatan 3 isolat asal nilam Indonesia (Pasaman, Garut, Ciamis) terhadap isolat dari Gene Bank. Pangda12-1 isolat Thailand=Passionfruit woodiness potyvirus Pangda12 (inang purple passionfruit), Pangda15-1 isolat Thailand=Passionfruit woodiness potyvirus Pangda15 (inang purple passionfruit), TeMV.Hanoi=Telosma mosaic virus isolat Hanoi (inang Telosma cordata), PStV.Indo1=Peanut stripe virus isolat Indonesia (inang Pogostemon cablin (Hartono,2008)), PStV.India=Peanut stripe virus isolat India (inang Pogostemon cablin) dan PatMMV.R2=Patchouli mild mosaic virus.RNA2 isolat Jepang (inang Pogostemon cablin) menggunakan Program Mega 4.1 Beta.

3 KLONING GEN CP POTYVIRUS
[KE DALAM PLASMID pJET1.2] Plasmid rekombinan pJET1.2-JPG12 yang mengandung gen CP Potyvirus [800 bp]; marker adalah 1kb DNA Ladder

4 VERIFIKASI INSERSI GEN CP POTYVIRUS PADA PLASMID pJET1.2 MELALUI PCR
Produk PCR sesuai dengan ukuran gen CP yang disisipkan menandakan gen CP Potyvirus berhasil dikloning

5 PENYISIPAN GEN CP POTYVIRUS PADA VEKTOR EKSPRESI pCAMBIA1301
Produk PCR sesuai dengan ukuran gen CP yang disisipkan menandakan gen CP Potyvirus berhasil dikloning