Upload presentasi
Presentasi sedang didownload. Silahkan tunggu
1
Selamat Datang di dunia Biokimia
**** Pengantar Biokimia “Mengajar tidak bertujuan mengisi botol kosong, tetapi mengajar adalah untuk menyulut api dari suatu obor" – Michel de Montaigne 29 Jan 2006
2
Bahan Acuan Lehninger’s Principles of Biochemistry 4rd Edition (2004) - by David Nelson & Michael Cox. 29 Jan 2006
3
Tujuan Perkuliahan Memperkenalkan bahasa biokimia: Kosakata (istilah dan struktur), tatabahasa (reaksi-reaksi), struktur kalimat (jalur-jalur metabolisme), dan pengertian (hubungan-hubungan metabolisme) Mengajarkan cara mengambil intisari proses kehidupan Menyarikan kesatuan konsep yang mendasari proses kehidupan Menularkan hasrat mencari tahu atas hal yang akan dipelajari dan hal yang perlu diketahui 29 Jan 2006
4
Cara Belajar Baca bab yang akan dikuliahkan sebelum perkuliahan
Belajar 3-5 jam untuk setiap jam perkuliahan Latihan pemecahan masalah Ingat istilah-istilah, struktur, dan jalur-jalur metabolisme Belajar berkelompok 29 Jan 2006
5
Filosofi Pembelajaran
Menjelaskan, bukan mengindoktrinasi Menunjukkan hal yang perlu diketahui dan yang tidak perlu diketahui Menghargai pertanyaan tentang hal yang belum diketahui Mempelajari semua hal adalah tidak mungkin, tetapi yang lebih penting adalah mengorganisir hal yang kita ketahui agar dapat digunakan 29 Jan 2006
6
Tentang Struktur Struktur biokimia yang rumit tidak akan pernah dapat ditiru, akan tetapi hal yang perlu dipikirkan tentang struktur tersebut adalah: Bagaimana konsentrasinya berubah sebagai tanggapan atas kondisi metabolisme tertentu Bagaimana struktur tersebut berperan terhadap aktifitas biologisnya Dalam jalur metabolisme mana senyawa dengan struktur tersebut ditemukan (dari apa/mana asal senyawa tersebut dan menjadi apa selanjutnya?) 29 Jan 2006
7
Ciri-Ciri Kehidupan Keragaman biologis: mikroba, ganggang, lumut, tanaman, serangga, burung, monyet, kamu Kesatuan kimiawi: sistem kehidupan (di bumi) mengikuti hukum fisika-kimia organik– tidak ada aturan khusus 29 Jan 2006
8
3 Kebutuhan Kehidupan: (1) ENERGI, perlu diketahui bagaimana:
Memperolehnya Mengubahnya Menggunakannya Fig. 1-28 29 Jan 2006
9
(2) MOLEKUL SEDERHANA, perlu diketahui bagaimana:
Mengubahnya Mempolimerasinya Menghancurkannya 29 Jan 2006
10
(3) MEKANISME KiMIA, untuk:
Memperoleh energi Mengendalikan reaksi kimia yang berurutan Mensintesis & mendegradasi makromolekul Mempertahankan kesetimbangan yang dinamis Swa-susun struktur yang kompleks Mengganda secara akurat & efisien Mempertahankan keteraturan proses biokimia dalam lingkungan yang berubah-ubah 29 Jan 2006
11
Strategi 1: Mahluk hidup menggunakan pasangan kimia untuk mengendalikan proses kimia yang normalnya tidak dapat terjadi 29 Jan 2006 Fig. 1-26b
12
Strategi 2: Mahluk hidup menggunakan enzim untuk memacu reaksi yang biasanya lambat
29 Jan 2006
13
Bagaimana enzim memacu reaksi, penjelasan termodinamikanya?
Fig. 1-11 29 Jan 2006
14
Bagaimana enzim memacu reaksi, penjelasan mekanismenya??
Fig. 1-22 29 Jan 2006
15
Biomolekul - Komposisi
99% dari sel tersusun dari unsur H, O, N, and C Unsur Elektron tanpa pasangan Jumlah relatif H 1 2/3 O 2 1/4 N 3 1/70 C 4 1/10 29 Jan 2006
16
Atom Karbon yang Fleksibel adalah Tulang Punggung Kehidupan
* Atom Karbon yang Fleksibel adalah Tulang Punggung Kehidupan Fig. 1-14 29 Jan 2006
17
Isomer Kimia Rumus kimia sama, bentuk berbeda
Fig. 1-18a 29 Jan 2006
18
Molekul Khiral bentuk putaran berbeda dengan bentuk bayangan
Fig. 1-19a 29 Jan 2006
19
Stereoisomer Rumus dan bentuk kimia sama – fungsi biologis
Fig. 1-23a 29 Jan 2006
20
Perubahan Biokimia Dapat Dikelompokkan dalam 5 kategori
* Perubahan Biokimia Dapat Dikelompokkan dalam 5 kategori Reaksi pemindahan gugus Reaksi oksidasi-reduksi Penataan kembali (isomerisasi) Reaksi pemotongan Reaksi kondensasi 29 Jan 2006
21
Struktur Biomolekul Senyawa penyusun Gula sederhana Asam amino
Anabolik Senyawa penyusun Gula sederhana Asam amino Nukleotida Asam lemak Makromolekul Polisakarida Protein (peptida) RNA atau DNA Lipida Katabolik 29 Jan 2006
22
Biosintesis Membutuhkan Molekul Sederhana untuk Digabung secara Kovalen melalui Berbagai Cara …
3eFig. 3-25 29 Jan 2006
23
Kekuatan ikatan kimia tergantung pada 1
Kekuatan ikatan kimia tergantung pada 1. Kelektronegativan relatif dari dua atom yang berikatan Keelectronegativan tinggi = Afinitas elektron tinggi O 3.5 Cl 3.0 N 3.0 C 2.5 P 2.1 H 2.1 Na 0.9 K 0.8 From 3eTable 3-4 29 Jan 2006
24
2. Jumlah elektron pengikat
* See Fig. 1-13 29 Jan 2006
25
Kekuatan ikatan yang umum
Approx. Avg. Triple: kJ/mole Double: kJ/mole Single: 350 kJ/mole 29 Jan 2006
26
Gugus Fungsional yang Umum
* Fig. 1-15 29 Jan 2006
27
Nukleofil Biologis yang Penting: gugus fungsional kaya elektron
* Nukleofil Biologis yang Penting: gugus fungsional kaya elektron 3eTable 3-4 29 Jan 2006
28
Ringkasan… Atom karbon tetrahedral memiliki sifat ikatan yang fleksibel Senyawa-senyawa beratom banyak dapat memiliki beberapa bentuk isomerik Pengubahan bentuk membutuhkan pemutusan ikatan-ikatan kimia Molekul-molekul besar disusun dari molekul- molekul kecil melalui pembentukan ikatan kimia baru 29 Jan 2006
29
Staf Pengajar Drs. Winarto Hariadi, M.Si.
Ir. Sedyo Hartono, M.P., Ph.D. Dr. Ir. Arman Wijonarko, M.Sc. Ir. Irfan D. Prijambada, M.Eng., Ph.D. 29 Jan 2006
30
29 Jan 2006 No. Topik Perkuliahan Tanggal Pengajar 1. Pendahuluan
Konsep dasar biokimia Reaksi-reaksi biokimia Ir. Irfan D. Prijambada, M.Eng., Ph.D. 2. Air dan Buffer Drs. Winarto Hariadi, M.Si. 3. Karbohidrat I Tinjauan umum Monosakarida Disakarida Polisakarida Dr. Ir. Arman Wijonarko, M.Sc. 4. Karbohidrat II Reaksi monosakarida Ikatan glikosida Fungsi karbohidrat 5. Asam Amino dan Protein I Asam amino Biosintesis asam amino 6. Asam Amino dan Protein II Peptida Struktur protein Fungsi asam amino dan protein Biosintesis protein 7. UJIAN SISIPAN Semua dosen (topik 1 s/d 6) 29 Jan 2006
31
29 Jan 2006 No. Topik Perkuliahan Tanggal Pengajar 7. Lipida I
Tinjauan umum Asam lemak jenuh dan tak jenuh Reaksi asam lemak Drs. Winarto Hariadi, M.Si. 8. Lipida II Fungsi asam lemak dan lipida Biosintesis asam lemak 10. Asam nukleat I Nukleosida dan nukleotida Ir. Sedyo Hartono, M.P., Ph.D. 11. Asam nukleat II Struktur DNA dan RNA 12. Enzim Klasifikasi enzim Koenzim dan kofaktor Mekanisme dan kinetika kerja enzim Penghambatan kerja enzim Ir. Irfan D. Prijambada, M.Eng., Ph.D. 14. Metabolisme I Jalur metabolisme 15. Metabolisme II Bioenergetika Pengendalian metabolisme 16. UJIAN AKHIR Jadual Fakultas Semua dosen (topik 8 s/d 14) 29 Jan 2006
32
Tugas Tuliskan 5 hal yang sebelumnya tidak kamu ketahui atau lupa dan dipelajari hari ini 29 Jan 2006
Presentasi serupa
© 2024 SlidePlayer.info Inc.
All rights reserved.