METABOLISME dan INFORMASI GENETIK

Presentasi berjudul: "METABOLISME dan INFORMASI GENETIK"— Transcript presentasi:

1 METABOLISME dan INFORMASI GENETIK
Bagian ke 1 dari KI-3161 Biokimia Dasar

2 Aturan Main & Buku Rujukan
Diasuh oleh: FM,SH,ZN Aturan Main: Kehadiran 80% Tiap dosen akan memberikan ujian max 2 kali Nilai Praktikum berbobot 25-30% Peserta praktikum harus hadir di pertemuan awal praktikum (31 Agustus 2006) pk di Lab. Biokimia Buku Rujukan: Mathews,van Holde and Ahern, “Biochemistry” Lehninger (1982). A, “Principles of Biochemistry”, Worth Publishers, Inc, New York. Stryer L. (1995), “Biochemistry”, 4th ed, W.H. Freeman Co, New York

3 Pokok Bahasan Kinetika Reaksi enzim Metabolisme :
Glukoneogenesis Glikogenolisis Glikogenesis Fotosintesis Katabolisme & Anabolisme Lipid b-oksidasi Biosintesis asam lemak Katabolisme protein Siklus urea Informasi genetik: pengendalian metabolisme : operon Kinetika Reaksi enzim Pendekatan kesetimbangan Pendekatan steady state Inhibisi enzim Metabolisme : Membran dan proses transport Hubungan katabolisme dan Anabolisme Katabolisme & Anabolisme Karbohidrat Glikolisis TCA Rantai Respirasi

4 Kinetika Reaksi Enzim Kerja enzim Model mekanisme kerja enzim:
Model ‘Kunci & anak kunci’ : Emil Fisher (1894) Model ‘Induced-fit’: Daniel Koshland (1958) Contoh: Hexokinase

5 Kinetika Reaksi: Pendekatan Kesetimbangan
Pendekatan Keadaan tunak, steady state

6 Pendekatan Kesetimbangan
Penyusunan ulang persamaan (1) dan substitusi persamaan (3) dihasilkan:

7 Cara kesetimbangan (lanjutan)

8 Pendekatan Keadaan tunak (steady state)
Prinsip: laju pembentukan senyawa antara sama dengan laju penguraiannya. d[ES]/dt = - d[ES]/dt [Etot]=[E]+[ES] Setelah mensubstitusi harga [E] dan dengan mengasumsikan harga tetapan laju kearah penguraian produk sangat kecil maka,akan deperoleh harga [ES]

9 Steady state

10 Penentuan KM & Vmax Berdasarkan pers Michaelis-Menten
Kurva antara V terhadap [S] Pada saat [V] = ½[Vmax], maka: [S]= Km Berdasarkan pers. Lineweaver-Burk kurva 1/V thd 1/[S] Pada 1/V = 0, 1/[S]=-1/Km Pada 1/[S]=0, 1/V= 1/Vmax

11 Kurva antara V vs [S]

12 Kurva 1/V – 1/[S]

13 Arti fisik besaran-besaran: KM, kcat dan kcat/KM
KM menyatakan : konsentrasi substrat yang diperlukan agar reaksi katalisis efektif. kcat adalah tetapan laju pada tahap penentu laju. Untuk tahapan reaksi enzim sbb: k2 adalah kcat Satuan kcat : s-1 → kebalikannya: waktu yang diperlukan untuk mengubah 1 molekul substrat oleh 1 molekul enzim → kcat : jumlah substrat yang dapat diubah (turned over) per detik. → turn over number Kcat/KM = turn over number/afinitas terhadap substrat→ merupakan ukuran efisiensi suatu enzim Contoh:

14 Nilai KM, kcat, kcat/KM berbagai enzim

15 Inhibisi Enzim Inhibisi Reversibel Inhibisi Irreversibel Kompetitif
Uncompetitive Non Kompetitif Inhibisi Irreversibel

16 Inhibisi Kompetitif

17 Inhibisi “uncompetitive”

18 Inhibisi Non-kompetitif- Mix Inhibition

19 Hukum Laju berbagai Jenis Inhibisi reversibel
Kompetitif Uncompetitive Nonkompetitif

20 Contoh Inhibitor tak reversibel

21 Membran Sel dan Proses Transport
Struktur Membran : Lipid ‘bilayer’ Protein Fluiditas Membran Proses transport 21 Lipid penyusun membran: gliserofosfolipids sfingolipid kolesterol

22 Struktur membran

23 Proses transport Transport pasif → Difusi Difusi dengan bantuan
pori pengemban (carrier) Transport aktif → dengan bantuan sumber energi, terjadi proses transport yang melawan arah gradien konsentrasi: pompa Ion sistem ko-tansport transport dengan modifikasi

24 Koefisien permeabilitas beberapa ion/senyawa

25 Pompa Na+-K+