* * * * * * Nonaromatik Aromatik Nonaromatik Aromatik Nonaromatik UJI COBA BERBAGAI MARKA AROMATIK Bradbury (Bradbury et al. 2005)  ekson 7 FM-E7 (Shi et al. 2008)  ekson 7 m Nonaromatik Aromatik Nonaromatik Aromatik N C IR F T M G RL P PM PK Si Gi w N C IR F T M G RL P PM PK Si Gi w * * * * 1 2 1 2 FM-E2A (Shi et al. 2008)  ekson 2 BADEX7-5 (Sakthivel et al. 2009)  ekson 7 Nonaromatik Aromatik Nonaromatik Aromatik N C IR F T M G RL P PM PK Si Gi w N C IR F T M G RL P PM PK Si Gi w 1 2 1 2 * * Padi Non-Aromatik : N = Nipponbare, C = Ciherang, IR = IR64, F = Fatmawati, T = Taipei 309 Padi Aromatik : M = Mentik Wangi, G = Gunung Perak, RL = Rojo Lele, P = Pandan Wangi, PM = Pulu Mandoti, PK = Pare Kembang, Si = Sintanur, Gi = Gilirang 2 kelompok tipe mutasi varietas aromatik Indonesia dan mutasi terjadi pada ekson 7 m = size marker; w = air (kontrol negatif); 1 dan 2 = kelompok 1 dan 2, * = sampel aromatik dengan pola amplifikasi berbeda dibandingkan sampel nonaromatik (kelompok 1)

FORWARD SEQUENCE COMPARISON badh2.7 gene of non-fragrant rices IFAP badh2.7 gene mutation/deletion IFAP IFAP Exon 7-badh2 gene of group 1fragrant rices: Mentik Wangi and Gunung Perak Exon 7-badh2 gene of group 2 fragrant rices: Pandan Wangi, Rojolele, Pulu Mandoti , Gilirang, and Pare Kembang GGT ATAT ATTTCAGCTGCTCCTATG IFAP(blk,kplm) Chr MW PW GT AACCGCCATGGTCACCG TGCT CTATG new IFAP ESP = TTGTTTGGAGCTTGCTGAGT INSP = CTGGTAAAAAGATTAGGCTTA IFAP = CATAGGAGCAGCTGAAATATATACC EAP = AGTGCTTTACAAAGTCCCGC ESP INSP IFAP EAP

REVERSE SEQUENCE COMPARISON INSP badh2.7 gene of non-fragrant rices badh2.7 gene mutation/deletion INSP INSP IFAP Exon 7-badh2 gene of group 1fragrant rices: Mentik Wangi and Gunung Perak Exon 7-badh2 gene of group 2 fragrant rices: Pandan Wangi, Rojolele, Pulu Mandoti , Gilirang, and Pare Kembang G originally T in Bradbury marker GAAGCCATAATCTTTTTACCAG INSP, blk, kplt Chr MW PW ESP = TTGTTTGGAGCTTGCTGAGT INSP = CTGGTAAAAAGATTAGGCTTA IFAP = CATAGGAGCAGCTGAAATATATACC EAP = AGTGCTTTACAAAGTCCCGC ESP INSP IFAP EAP

SISTEM MARKA MULTIPLEK DAN DUPLEK MULTIPLEK (4 PRIMER) DUPLEK (2 PRIMER) Aromatik InDel Nonaromatik

Resiko kegagalan panen Kualitas panen/aspek komersial TARGET PEMULIAAN TANAMAN PADI Pra Panen Panen Pasca Panen Toleransi biotik (hama dan penyakit): Produktivitas tinggi Rasa (pulen/pera) Serangga Ratoon tinggi Aromatik: Jamur Waktu tanam -Nilai Ekonomi Mikroorganisme (bakteri dan virus)  Peningkatan produktivitas Toleransi abiotik : Nontransgenik (GMO) Kekeringan Salinitas tinggi Genangan/banjir Lokasi (kondisi tanah, temperatur, dsb.)  Resiko kegagalan panen Kuantitas panen Kualitas panen/aspek komersial

PERBANDINGAN METODA PEMULIAAN TANAMAN PADI Uraian Persilangan konvensional/acak (Random crossing) Persilangan terarah (Site-directed crosing) Rekayasa Genetik Produk NonGMO GMO Stabilitas Puluhan tahun Belum teruji untuk waktu lama Introduksi sifat NonSpesifik/Selektif Spesifik/Selektif Tidak terarah Terarah Waktu pengerjaan 4-5 bulan hingga 8 – 10 bulan 2 – 3 tahun bila mulai dari awal 4 -5 bulan hingga 8 – 10 bulan bila tersedia BC4F1 2 – 3 tahun Efek negatif Tidak ada ? Pemasaran produk Tidak bermasalah Terhambat regulasi GMO      