REPLIKASI DNA Agustina Setiawati Microteaching USD 9/19/2018

REFERENSI Albert, B., Bray, D., Lewis, J., Rarr, M., Roberts, K. and Watson, J. O., 1994, Molecular Biology of The Cell, 3rd Ed., Garland Publishing, Inc., New York. Lodish, H., Arnold, B., Zipursky, S. L., Matsudara, P., David, B. and Darnell, J. E., 2000, Molecular Cell Biology, W. H. Freeman and Company, London. 9/19/2018 Microteaching USD

Aplikasi Replikasi DNA OVERVIEW MATERI Pendahuluan Prinsip Replikasi DNA Tahap Replikasi DNA Problem Replikasi DNA Aplikasi Replikasi DNA 9/19/2018 Microteaching USD

PENDAHULUAN DOGMA SENTRAL Replikasi Transkripsi Translasi Protein RNA DNA 9/19/2018 Microteaching USD

PENDAHULUAN TEORI REPLIKASI DNA konservatif semi konservatif dispersif Messelson and Stahl, 1958 9/19/2018 Microteaching USD

REPLIKASI PADA CELL CYCLE PENDAHULUAN REPLIKASI PADA CELL CYCLE 9/19/2018 Microteaching USD

Replikasi bersifat semi konservatif Prinsip Replikasi DNA Replikasi bersifat semi konservatif 9/19/2018 Microteaching USD

Prinsip Replikasi DNA Double strand DNA berperan sebagai template dengan leading strand dan lagging strand 9/19/2018 Microteaching USD

Prinsip Replikasi DNA Rantai DNA hasil replikasi mempunyai pasangan basa yg komplemen dengan DNA template (A=T, GC) Dalam replikasi, DNA polimerase membutuhkan primer 9/19/2018 Microteaching USD

Prinsip Replikasi DNA Replikasi dimulai dari ujung 5’ ke 3’ 9/19/2018 Microteaching USD

ENZIM REPLIKASI topoisomerase helicase ssDNA binding protein primase DNA polymerase III DNA polymerase I DNA ligase 9/19/2018 Microteaching USD

TAHAP REPLIKASI (1) Enzim topoisomerase mengendurkan DNA supercoil dengan memotong dan menyambung kembali rantai DNA Topoisomerase I Topoisomerase II 9/19/2018 Microteaching USD

TAHAP REPLIKASI (2) Pembukaan double strand DNA melalui pengrusakan ikatan H oleh enzim helikase helikase 5’ 3’ 9/19/2018 Microteaching USD

TAHAP REPLIKASI (3) ss binding protein menstabilkan ss DNA dan mencegah terbentuknya ikatan basa 5’ 3’ ssDNA binding protein 9/19/2018 Microteaching USD

TAHAP REPLIKASI (4) Enzim primase mensintesis primer pada DNA template ss binding protein 5’ 3’ 9/19/2018 Microteaching USD

Primer & Primase Primer adalah rantai RNA +/- 10 nukletida Primase : RNA polimerase Why does DNA replication need primer? from Alberts et al., Molecular Biology of the Cell, 4th ed., Fig 5-12 9/19/2018 Microteaching USD

TAHAP REPLIKASI (5) DNA polimerase III mensintesis DNA pada leading strand maupun lagging strand helicase ssDNA binding proteins primer 5' DN A polimerase III Leading strand 9/19/2018 Microteaching USD

TB 5' 3' Lagging strand Okazaki fragment primase helicase ssDNA binding proteins pol III 3' Okazaki fragment (~1000 bases) 5' Lagging strand DNA polimerase III mengoreksi kesalahan sintesis melalui aktivitas eksonuklease 3’-5’ (proofreading) 9/19/2018 Microteaching USD TB

Reaksi proofreading 9/19/2018 Microteaching USD

TAHAP REPLIKASI (6) DNA polimerase I menghilangkan primer melalui aktivitas eksonuklease 5’ - 3’ DNA polimerase I mengisi gap yang kosong pol I 5' 3' 9/19/2018 Microteaching USD

DNA POLIMERASE I & DNA POLIMERASE III Eksonuklease 5’- 3’ (untuk hidrolisis primer) Mengisi gap (kekosongan fragmen DNA) akibat hidrolisis primer Eksonuklease 3’ – 5’ untuk proofreading Sintesis DNA dengan inisiasi primer Eksonuklease 3’-5’ (untuk proofreading) 9/19/2018 Microteaching USD

TAHAP REPLIKASI (7) Ligasi (penyambungan) fragmen DNA oleh enzim ligase membentuk ikatan fosfodiester antara 3’-OH dan 5’-P fragmen 2 9/19/2018 Microteaching USD

Figure 11.7 9/19/2018 Microteaching USD Breaks the hydrogen bonds between the two strands Alleviates supercoiling Keep the parental strands apart Synthesizes an RNA primer 9/19/2018 Microteaching USD

PROBLEM REPLIKASI Rantai DNA yg baru lebih pendek dibandingkan dengan DNA template 9/19/2018

Telomerase solves the Replication Problem Its an RNA dependent DNA polymerase that synthesizes telomeric DNA sequences. Telomer DNA : sekuen DNA pada ujung berupa sekuen terulang 9/19/2018 Microteaching USD

Telomerase solves the Replication Problem primer 9/19/2018 Microteaching USD

POLYMERASE CHAIN REACTION (PCR) APLIKASI REPLIKASI POLYMERASE CHAIN REACTION (PCR) 9/19/2018 Microteaching USD

PCR mengamplifikasikan rantai DNA spesifik dengan menggunakan prinsip perubahan suhu 9/19/2018 Microteaching USD

9/19/2018 Microteaching USD

9/19/2018 Microteaching USD

DETEKSI VIRUS HIV 9/19/2018 Microteaching USD

DNA FINGERPRINT 9/19/2018 Microteaching USD

THANK YOU TERIMA KASIH 9/19/2018 Microteaching USD