EKSPRESI GEN II PERTEMUAN VI JUNI TRIASTUTI PROGRAM STUDI S-1 BUDIDAYA PERAIRAN UNIVERSITAS AIRLANGGA

BENTUK DNA EUKARYOT BAKTERI VIRUS - DNA kromosom inti linier - DNA kromosom mitokondria sirkular BAKTERI - DNA kromosom dan plasmid sirkular - DNA kromosom Berrellia burgdorferi B31 linier VIRUS - DNA sirkular dan linier

Gambar Bentuk Molekul DNA

FUNGSI BENTUK DASAR DNA SIRKULAR 1. melindungi DNA dari enzim endonuklease (Prokaryot) 2. sebagai syarat integrasi dalam kromosom bakteri (Virus) 3. sebagai syarat untuk replikasi (Virus) LINEAR - eukaryot akan berasosiasi dengan histon

JENIS UNTAIAN DNA DNA BERUTAS GANDA (HELIKS) - DNA yang tersusun atas sumbu yang sama DNA BERUTAS TUNGGAL (VIRUS) - satu molekul DNA terdiri atas satu rantai polinukleotida DNA SUPERHELIKS (HELIKS GANDA) - merupakan satu DNA virus yang memiliki dua bentuk (rileks dan tegang)  topoisomerase

Gambar Untaian DNA

FUNGSI UNTAIAN DNA DNA UTAS GANDA DNA UTAS TUNGGAL - melindungi diri dari kerusakan akibat kegiatan enzim dalam sel atau akibat perubahan kondisi sel - posisi basa stabil dari pengaruh luar karena terletak di dalam untai heliks ganda DNA UTAS TUNGGAL - basa terletak di luar sehingga rentan terhadap pengaruh kondisi sel - urutan basa bersifat komplemen sehingga dapat berpasangan  heliks DNA SUPERHELIKS / SUPERKOIL

RIBONUCLEIC ACID (RNA) ASAM NUKLEAT SELAIN DNA DIMILIKI OLEH SEBAGIAN VIRUS PEMBAWA SIFAT MAHLUK HIDUP PERTAMA STRUKTUR BERBEDA DENGAN DNA (GULA DAN BASA) UMUMNYA BERUTAS TUNGGAL

Gambar RNA

GENOM - GEN GENOM - gugus/himpunan gen yang lengkap dari suatu organisme, dapat mengendalikan keseluruhan metabolisme sehingga organisme tersebut dapat hidup dengan sempurna - ruas khas dan ruas berulang (repDNA)  palindrom GEN - bagian genom yang berperan dalam proses ekspresi gen (sebagai ruas model/template/penyandi dalam proses transkripsi  polimerase RNA)

Gambar Genom - Gen

FUNGSI RUAS KHAS GENOM FUNGSI RUAS BERULANG ciri prokaryot pembentuk keseluruhan protein selain histon pembentuk m-RNA FUNGSI RUAS BERULANG ciri eukaryot(40%) pembentuk histon pembentuk r-RNA DAN t-RNA

GENOM EUKARYOT DNA kromosomal (inti) DNA ekstrakromosomal (mitokondria dan plastida) Terbagi atas ploidi  1 ploid terdapat seluruh gen (terbagi dalam beberapa kromosom) untuk metabolisme

PENGEMASAN DNA EUKARYOT Kromosom  gulungan kromatin Kromatin  DNA + protein (histon – nirhiston)+ RNA Nukleosome  1 histon (+) dan 1 segmen DNA (-) Nirhiston  matriks pengikat pelipatan kromatin

Pengemasan DNA

GENOM VIRUS Ukuran genom terkecil Keragaman genom besar Virus DNA – virus RNA Genom utas tunggal (ut) – utas ganda (ug) 1 virus = 1 kromosom (linier / sirkular) Virus DNA dewasa = DNA ug linier & DNA ut sirkular Virus RNA dewasa = RNA ug linier & RNA ut linier

GENOM BAKTERI DNA kromosom  memiliki satu kromosom - sirkular DNA ekstrakromosomal / plasmid  jumlah berbeda-beda, DNA ug sirkular DNA kromosom Berrellia burgdorferi B31 linier Kromosom dikemas  nukleoid Protein penyusum kromosom : HU dan H

Gambar Pengemasan DNA Bakteri