Aminoacyl tRNA synthetase (aaRS) Oleh: Ertanti Rizki P. 20512033 Suci Rizki Nurul Aeni 20512044 KK Biokimia-Institut Teknologi Bandung

How kinetics parameter of aa RS ? Outline What is aa RS ? How kinetics parameter of aa RS ? What the development?

Terdapat dalam sel makhluk hidup, yaitu pada Ribosom Lokasi Fungsi defisiensi What is aa RS ? Terdapat dalam sel makhluk hidup, yaitu pada Ribosom Pengikatan asam amino spesifik ke tRNA Berperan dalam proses translasi RNA PL Kesalaham Koding Asam amino Protein berubah jenis dan fungsi

Tahapan pengikatan tRNA dengan asam amino Sisi aktif enzim mengikat asam amino dan molekul ATP. 2) ATP kehilangan dua gugus fosfat dan bergabung dengan asam amino sebagai AMP. 3) tRNA berikatan kovalen dengan asam amino menggeser AMP di sisi aktif enzim. 4) Enzim melepaskan tRNA-aminoasil, disebut juga “asam amino teraktivasi”

Mekanisme

Perbedaan Kelas Asam Amino

Kinetika

kinetic of Enzyme Suhu Konsentrasi enzim Konsentrasi Substrat Inhibitor Jumlah Pyrophosfat

What the development? Inhibitor enzim ini dapat berguna bagi treatment untuk beberapa penyakit antara lain Malaria dan HIV 1 Inhibitor enzim ini berpotensi untuk zat antibiotik

Spesific Enzyme Name of IUBMB EC 6 : Class Ligase EC 6.1 : Subclass Forming Carbon-Oxygen Bonds EC 6.1.1 : Ligases forming aminoacyl-tRNA and related compounds EC 6.1.1.11 : Serine-tRNA ligase Nama lain : seryl-tRNA synthetase; SerRS; seryl-transfer ribonucleate synthetase; seryl-Transfer RNA synthetase; seryl-transfer ribonucleic acid synthetase; serine translase Nama Sistematik : L-serine:tRNASer ligase (AMP-forming)

Serine-tRNA ligase Fungtion Mengakatalisis pengikatan kovalen dari serin ke gugus 3’-OH dari nukleotida tRNA-nya dalam suatu proses yang digerakan oleh hidrolisis ATP.

Reaction of Serine-tRNA ligase ATP + L-serine + tRNASer  AMP + diphosphate + L-seryl-tRNASer

Characteristic of Serine-tRNA ligase Terdapat dua domain yang terikat pada active side dan pada antikodon Domain N-terminal terdiri dari rantai yang sangat panjang Seryl-tRNA synthetase memiliki setidaknya lima spesies yang berbeda yang secara kolektif mengakui enam kodon berbeda untuk asam amino

Kinetic of Serine-tRNA ligase Suhu pH pI Konsentrasi Enzim Konsentrasi Substrat Konsentrasi Pyrophosfat

Application of Serine-tRNA ligase Sintesis Seryl-Adenylate Sintesis Diadenosine Tetraphosphate (Ap4A)

Modification of Serine-tRNA ligase Proses aminoasilasi Sintesis Selenocystein