MASTURA NIM : Seminar Penelitian (KI-70Z2), 29 Agustus 2007

 Latar Belakang  Tujuan  Tinjauan Pustaka  Metodologi  Hasil dan Pembahasan  Kesimpulan

 Peneliti terdahulu telah menggunakan metode RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism ) untuk menentukan haplogroup mtDNA manusia  Penelitian mengenai polimorfisme mtDNA manusia berdasarkan enzim restriksi telah berhasil mengelompokkan populasi asli Amerika menjadi haplogroup A, B, C, dan D (Torroni, et., al 1992).

 Metode RFLP tidak menggunakan urutan nukleotida mtDNA manusia lengkap ( pb) dalam menentukan haplogroup  Penentuan haplogroup dengan RFLP hanya menggunakan daerah-daerah tertentu dari urutan nukleotida mtDNA  Contoh : daerah HVS I dan HVS II, daerah pengode (Coding region)  Reanalisis untuk haplogroup RFLP Latar Belakang

 Untuk melihat kesesuaian antara haplogroup RFLP dengan haplogroup yang ditentukan berdasarkan posisi mutasi dari urutan nukleotida lengkap menggunakan empat belas enzim restriksi endonuklase secara insilico

 Mitokondria : organel sel eukariot organ respirasi ATP  Mitokondria Sifat genetik sendiri (mtDNA)  Polimorfisme yang tinggi laju mutasi tinggi  Pola pewarisannya spesifik, hanya dari ibu  Sistem kode genetik mtDNA berbeda dengan kode genetik DNA inti

 DNA mitokondria manusia telah ditentukan urutannya secara lengkap oleh Anderson, 1981  Urutan ini dijadikan referensi atau acuan bagi penelitian- penelitian mtDNA : Cambridge Reference Sequence (CRS).  mtDNA manusia tersusun atas bp.  Genom mtDNA mengandung 37 gen yang terdiri atas 13 gen penyandi protein yang terlibat dalam fosforilasi oksidatif, 22 gen menyandi tRNA dan 2 gen menyandi rRNA (Arderson et al., 1981). Tinjauan Pustaka

 RFLP : analisis urutan DNA yang dipotong oleh enzim restriksi yang diketahui, enzim restriksi akan memeotong DNA pada lokasi yang tidak saling berhubungan.  Mutasi RFLP dilihat : hilangnya sisi pemotongan dari enzim restriksi tertentu(Loss) atau munculnya sisi pemotongan baru dari enzim restriksi (gain), yang dibandingkan dengan CRS  Haplogroup :cara pengelompokan berdasarkan perbedaan panjang pendeknya fragmen mtDNA yang dipotong oleh enzim resriksi Tinjauan Pustaka

1. 2. Program MMA Metode RFLP Loss (-) Gain (+) Haplogroup Urutan nukleotida lengkap mtDNA Jenis dan posisi mutasi Haplogroup Teoritis Informasi tentang RFLP Informasi ttng RFLP

Jumlah HaplogroupJenis haplogroupJumlah individuSama dengan RFLPTidak sama dengan RFLP Satu haplogroup H dan F H=120 & F = Dua haplogroup EH, HL, HV, HI, HU, HX, FH, DE ( 48, 46, 21, 5, 2, 2, 2, 2, 1 ) Tiga haplogroup HJT, HIL, EHL, DEH, CEH FHI, ( 80, 16, 15, 5, 2, 1) Empat haplogroup FHJT, HJLT, EHIL, EHJT, AEHL, FHIL (19, 4, 3, 1, 1, 1) individu

Dari 584 individu yang dianalisis :  Yang sama dengan haplogroup RFLP :344 individu  Yang tidak sama dengan haplpgroup RFLP :66 individu  Yang tidak termasuk kehaplogroup manapun : 97 individu  Terdapat 77 individu yang belum diketahui suku bangsanya  Dari semua sampel yang dianalisis yang paling sesuai adalah individu yang memiliki satu haplogroup, yang lainnya tidak menunjukkan hasil yang spesifik