VIRUS MATERI : CIRI-CIRI DASAR KLASIFIKASI REPLIKASI PENULARAN

(1) CIRI-CIRI UMUM VIRUS A SELULER: protein, as. Nukleat, partikel SIMPLE:Virus dapat berbentuk agregasi dari bahan-bahan kimia CARA HIDUP :Virus merupakan obligat parasit ( hanya dapat menggandakan diri pada sel inang. KISARAN INANG: menunjukkan luas tidaknya jenis sel inang yang dapat digunakan untuk menggandakan diri dapat berupa bakteri, fungi, tumbuhan, hewan (luas, sempit). Kisaran inang ditentukan oleh adanya tempat perlekatan yang spesifik yang berada pada permukaan sel inang dan juga ditentukan oleh faktor-faktor internal sel inang. SPESIFITAS INANG :Kebanyakan virus hanya menginfeksi sel inang tertentu UKURAN: diameter antara 10-300/400 nm,panjang 20-14,000 nm. Paling kecil : 20 nm (Papiloma virus); paling besar : virus cacar 100x240x300 nm,virus Coronavirus (penyakit SARS)

KOMPONEN KIMIA VIRUS Protein : enzim (replikasi,lisis sel), kapsid. Lipida : glikolipida, fosfolipida (pada sampul virus). Karbohidrat : RNA dan DNA (gula ribosa dan deoksiribosa)

DASAR KLASIFIKASI VIRUS siklus hidup, struktur kisaran inang, Ukuran Familia : nama diakhiri dengan ( VIRIDAE), genus ( VIRUS). SPESIES VIRUS adalah grup virus yang memilki kesamaan genetik dan niche.

a.Siklus hidup dan STRUKTUR VIRION : suatu struktur utuh virus yang disusun oleh asam nukleat yang dikelilingi oleh selubung (coat). MORFOLOGI : HELIKAL (virus ebola), berbentuk batang panjang dengan kapsid silendris menyelubungi asam nukleat. POLIHEDRAL: (Adenovirus),biasanya kapsid berbentuk isosahedral. VIRUS BERENVELOP : diselubungi oleh envelope dan spheris kasar dan sangat pleumorfik (Poxvirus). Ada juga virus berenvelope yang berbentuk helik. VIRUS KOMPLEK : memiliki struktur yang komplek (bacteriophage) dengan kapsid polihedral dengan ekor helik. Diluar inang /fase ekstraseluler: partikel, tidak dapat bereplikasi Di sel inang/fase intraseluler : parasit obligat Fase intrasel : litik dan lisogenik Litik : adsorbsi, penetrasi( uncouting), essembly, maturation, release

b. Inang dan ukuran inang ukuran Kisaran inang : (eukariot dan bacteria/prokariot). diameter antara 10-300/400 nm,panjang 20-14,000 nm. Paling kecil : 20 nm (Papiloma virus); paling besar : virus cacar 100x240x300 nm,virus Coronavirus (penyakit SARS) 1 nm = 0,001 µm 1 µm=0,001mm

C. Struktur BAKTERIOPHAGE DAN VIRUS MOSAIC (VIRUS TEMBAKAU)

Virus berenvelop dan tidak berenvelop

BENTUK-BENTUK VIRUS

ASAM NUKLEAT - KAPSID DAN ENVELOPE ASAM NUKLEAT : DNA (SS atau DS) atau RNA (SS atau SS) Perbandingan asam nukleat dan protein : 1 : 50%. KAPSID DAN ENVELOPE : selubung protein yang mengelilingi asam nukleat disebut KAPSID. Kapsid disusun oleh subunit KAPSOMER yang dapat bertipe protein tunggal atau beberapa tipe. Kapsid beberapa virus diselubungi oleh ENVELOPE yang terdiri atas lipida, protein dan karbohidrat. Beberapa envelope ditutupi oleh karbohidrat-protein komplek yang dinamakan SPIKE.

TYPE ASAM NUKLEAT

Virus bakteri atau bakteriofage Virus M13 Mu MS2

bakteriofage

Cara infeksi virus ke sel inang : 1.Dengan menginjeksikan asam nukleatnya saja (bakteriofage) 2.Dengan fusi virion dengan membran sel 3.Dengan endositosis

MASUKNYA VIRUS HEWAN

replikasi Sintesis protein kapsid Sintesis inti asam nukleat

Fase litik-lisogenik

KLASIFIKASI VIRUS hewan (DNA)

VIRUS TUMBUHAN PENYEBARAN : DENGAN CARA KONTAK MELALUI BIJI DAN ORGAN VEGETATIF (UMBI, RIZOMA,TUNAS). MELALUI HEWAN : NEMATODA, INSEKTA. MELALUI FUNGI. INANG TIDAK DILENGKAPI TEMPAT UNTUK MELEKAT. CONTOH : VIRUS TMV VIRUS PISANG VIRUS KENTANG

GEJALA PATOLOGIS SERANGAN VIRUS

Topografi perkembang biakan Setelah masuk ke sel : Replikasi genon Perakitan pematangan

Fase litik

RETROVIRUS ( HIV) REVERSE TRNASKRIPTASE (R.T) RIBONUKLEASE R.T - DNA TRANSKRIPSI +RNA/-DNA - DNA +RNA ±PROVIRUS DNA + RNA VIRION +RNA +RNA (inti) VIRION PROTEIN (kapsid)

Familia Asam Nukleat Contoh Penularan penyakit ADENOVIRIDAE Ds DNA TAK BERENVELOPE pernafasan Demam faringitis pneumonia HEPESVIRIDAE DS DNA BERENVELOPE Alphavirinae : HVS I HVS II Betavirinae : herpesvirus simiae (kera) Pernafasan Seksual→ bayi (neonatal) Gigitan Varicella stomatitis Servisitis Cytomegalovirus Herpeslympotropik (co HIV) POXVIRIDAE ENVELOPE VARIOLA PAPOVARIRIDAE Tidak BERENVELOPE Human papiloma virus poliomavirus Kulit (epitel permukaan/mucosa columner) Pernafasan/saluran cerna Karsinoma/tumor alami Ginjal, hati, otak (transformasi) HEPADNAVIRIDAE EVELOPE Hepatitis B RETROVIRIADE + RNA HIV suntikan AIDs TOGAVIRIDAE Rubella virus (virus saluran nafas) Saluran nafas Rubella

Lanjutan..... familia Asam nukleat Contoh Penularan penyakit FLAVIVIRIDAE + RNA berenvelope Yellow fever virus Dengue fever virus Hepatitis C virus arthopoda injeksi Demam kuning Dengue fever Hepatitis C PICONAVIRIDAE +RNA TAK BERENVELOPE POIOVIRUS Rhinovirus Hepatitis A virus POLIO Common cold Hepatitis A ORTHOMYXOVIRI- DAE _ RNA BERENVELOPE VIRUS INFLUENZA PERNAFASAN INFLUENZA RHABDOVIRIDAE _RNA VIRUS RABIES RABIES PARAMYCOVIRIDAE ENVELOPE VIRUS PARAINFLUENZA pernafasan bronchitis REOVIRIDAE DS RNA ROTAVIRUS DIARRHEA

SINGLE STRANDED +RNA /SS RNS (PICOVIRUS) REPLIKASE VIRUS PROTEIN (KAPSID) SS RNA (+RNA) VIRION ± RNA + RNA (INTI)

DOUBLE STRANDED ± RNA/DS RNA (REOVIRUS) TRANSKRIPTASE REPLIKASE + RNA ± RNA ± RNA (INTI) PROTEIN ± RNA VIRION

SINGLE STRANDED -RNA /SS RNA (VIRUS ENFLUENZA) TRANKRIPTASE REPLIKASE VIRUS - RNA +RNA PROTEIN ± RNA RNA VIRION

REPRODUKSI SS DNA FAGE (+ DNA) DNA POLIMERASE REPLIKASI ±DNA +DNA + DNA + RNA + DNA (INTI) PROTEIN VIRION + DNA

REPRODUKSI SINGLE STRANDED RNA FAGE (SS +RNA) RNA REPLIKASE + RNA ±RNA + RNA +RNA (INTI VIRION) PROTEIN VIRION (+ RNA)

REPRODUKSI VIRUS HIV

FASE ADSORBSI Tidak bersifat random . Ada reseptor spesifik pada bagian sel inang : lapisan lipopolisakharida (LPS),as. Techoad, flagella,pili. Bacteriopgahe (E.coli) : lap. Lipopolisakharida dan protein. Menempelnya ekor adalah karena daya elektromagnetik da n pengaruh ion Mg2 +, Ca2+ dan pH. Kontraksi ekor didukung oleh adanya ATP → DNA keluar (masuk ke sel inang)

Masa inkubasi dan cara penularan penyakit Masa inkubasi -sindrom penularan influenza 1-2 hr Pernafasan (batuk, bersin) Common cold 1-3 hr Pernafasan(epitel ) Demam berdarah 5-8 hr (lesi setempat/kulit) Inokulasi (nyamuk) poliomielitis 2-5 hr (sistem syaraf) Per oral Morbili (campak) 9-12 hr (kulit) pernafasan Variola (cacar air) 12-14 hr (kulit) Varicella ( cacar bernanah) 13-17 hr (kulit) Rubella * Cytomegalovirus* * Abnormalitas pd bayi 17-20 hr (kulit) Hepatitis A 15-40 hr Hepatitis B 50-150 hr inokulasi rabies 30-100 hr Gondong herpes→ simplek tipe 2 penyebab abnormalitas cerebral 1-2 minggu placenta

Diagnosis TORCh→ pd bayi (sukar dilakukan krn. Menyebabkan anemia) T = toxoplasmosis R = Rubella C = Cytomegalovirus H = Herpes simplex

REPRODUKSI VIRUS INFLUENZA

Sintesis as. Nukleat dan protein virus Setelah DNA dinjeksikan ke sel iang , sintesis DNA,RNA dan protein inang dihentikan, dan sel dipacu utk mensisntesis konstituen virus. mRNA polimerase (E.coli) mulai mensintesis mRNA virus yg dibentuk DNA fage dibetuk. mRNA dibentuk dg. Bantuan enzim dan protein yang dihasilkan oleh metabolisme dan as.nukleat inang.

Fase lisogenik dan fase litik (lambda ) Terjadinya fase ini karena AKTIFNYA/TDK AKTIFNYA protein represor (lambda represor (cI) dan Cro represor). Fase lisogenik terjadi jika terjadi represi siklus litik. Fase lisogeni terjadi/dimungkinkan oleh : kopi genom λ masuk ke genom inang sehingga menekan pembentukan protein yang dikode oleh genom labmda. Prot Cro meregulasi fase lisogeni dengan menekan ekspresi cII dan cIII, dengan merangsang sintesis cI, maka fase lisogeni yang terjadi. Kalau Cro disintesis dlm jumlah banyak, maka virus akan mengikuti fase litik.

Tipe-tipe replikasi type Virus Lanjut I dsDNA Transkripsi strand (-) mRNA(+) II ssDNA Sintesis pita lain → ds DNA III dsRNA (± RNA) mRNA (+) IV ssRNA (+) Dipakai sbg. mRNA V ssRNA(-) Transkripsi strand (-) VI ssRNA (‘+) Reverse transcriptase → DNA ds

AIDs (Acquired Immune Deficiency syndrome) Penyebab : HUMAN T-Cell Lymphotropic Virus-III (Virus SS +RNA). Virus ini dapat memacu sel inang untuk memperbanyak gen virus dg. Enzim reverse-transcriptase. Membunuh sel –T : sehingga menyebabkan hilangnya kekebalan tubuh. DIY : peringkat 17. 455 kasus : 14 (< 5 th), 15 (17-30 th),245 (20-29 th),92 (30-39 th), 38 (40-49 th), 9 (50 th),36 (tdk.diketahui). Januari-September 2007 : 15 meninggal. 80 % usia produktif. SEBAB : heteroseksual, injecting drug user (IUD) , narkoba dg. Jarum suntik.

REPRODUKSI BAKTERIOFAGE

CANCER (PADA SISTEM IMUNE) Penyebab : HTLV- I , HTLV-II. Merupakan RETROVIRUS : virus RNA yang menginfeksi inang dengan menginduksi sintesiis DNA dari RNA virus . Banyak menimbulka pertumbuhan ubnormal. Memproduksi virus baru dan inang baru (sel-T). Diaktivasi oleh gen yang terletak pada ujung genom. Dapat terjadi transformasi sel. Normal ke sel kanker. Virus yang mampu menghasilkan sel tumor disebut virus onkogen. Beberapa virus DNA dan RETROVIRUS adalah onkogen.

VIRUS ONKOGEN (VIRUS YANG MAMPU MENGHASILKAN SEL TUMOR) VIRUS DNA ONKOGENIK VIRUS RNA ONKOGENIK ADENOVIRIDAE, HERPESVIRIDAE,POXVIRIDAE, PAPOVIRIDAE. KARSINOMA NASOFARING,KANKER HATI. RETROVIRUS : HTLV-I, HTLV-II (leukemia). VIRUS ONKOGEN (VIRUS YANG MAMPU MENGHASILKAN SEL TUMOR)

PEMURNIAN VIRUS

SELAMAT BELAJAR