PENGANTAR KIMIA KOMPUTASI

Presentasi berjudul: "PENGANTAR KIMIA KOMPUTASI"— Transcript presentasi:

1 PENGANTAR KIMIA KOMPUTASI
niko p neax502.wordpress.com

2 Aplikasi dari kimia teori Why? Can you see your chemical system??
Kimia komputasi → cabang dari kimia yang menggunakan perangkat komputasi untuk memodelkan sistem kimia Aplikasi dari kimia teori Why? Can you see your chemical system?? Untuk membuka “black box” Tidak untuk menggantikan eksperimen Tidak setiap yg memakai komputer itu kimia komputasi

3 Sistem kimia → gas, cair, padat, biomolekular, katalisis, larutan dll.
Kimia komputasi → dibangun dari 3 pilar → sistem kimia, kimia teori dan resource komputasi Sistem kimia → gas, cair, padat, biomolekular, katalisis, larutan dll. Kimia teori → describe chemical system to math expression (quantum chemistry and molecular mechanic) Resource komputasi → to solve schrodinger equation

4 Kimia komputasi → molekul tunggal / kumpulan molekul.
Molekul tunggal → struktur, vibrasi, NMR, spin kopling,afinitas elektron, kerapatan elektron (yeah as usual) Kumpulan molekul → struktur, binding energy, koefisien ekstraksi, pelarut, sifat termodinamika dll. Reaksi molekul → relative constant rate, transition structure, dinamika molekular, reaction path

5 HyperChem, GAUSSIAN, ADF, MOPAC, TURBOMOLE, VASP dll.
Kimia komputasi → software / hardware Free software GAMESS, NWChem, Avogadro, FireFly, Espresso, Q-Chem,AutoDock,GROMACS dll. Software berbayar HyperChem, GAUSSIAN, ADF, MOPAC, TURBOMOLE, VASP dll. OS?? Windows, Linux, Mac

6 Disesuaikan dng kebutuhan
Kimia komputasi → hardware Disesuaikan dng kebutuhan PC cukup, atau untuk sistem yang lebih besar seperti protein, larutan bisa menggunakan cluster komputer atau HPC (high performance cluster) Biaya dan waktu komputasi

7 Disesuaikan dng kebutuhan
Kimia komputasi → hardware Disesuaikan dng kebutuhan PC cukup, atau untuk sistem yang lebih besar seperti protein, larutan bisa menggunakan cluster komputer atau HPC (high performance cluster) Biaya dan waktu komputasi

8 Mau belajar → teori, teknis penggunaan
Kimia komputasi →suka dng komputer. Mau belajar → teori, teknis penggunaan For chemist → how to see your chemical system And may be some time you need to write your own script

9 Mau belajar → teori, teknis penggunaan
Kimia komputasi →suka dng komputer. Mau belajar → teori, teknis penggunaan For chemist → how to see your chemical system For developer → how to create fast, accurate program And may be some time you need to write your own script