Sifat fisik asam nukleat oleh : dr

Presentasi berjudul: "Sifat fisik asam nukleat oleh : dr"— Transcript presentasi:

1 Sifat fisik asam nukleat oleh : dr
Sifat fisik asam nukleat oleh : dr.Syazili Mustofa Departemen Biokimia dan Biologi Molekuler FK Unila

2 Sifat umum Keasaman Viskositas Absorpsi optik
Molekul amfifilik. Normalnya asam (mengandung fosfat). Viskositas DNA padat: serat putih; RNA: bubuk putih. Tidak larut dalam pelarut organik,dapat dipresipitasi oleh etanol. Absorpsi optik Menyerap sinar UV (grup aromatik). Stabilitas terhadap panas Dissosiasi dsDNA  ssDNAs.

3 Faktor fisik yang mempengaruhi asam nukleat
Panas pH Konsentrasi garam Komposisi basa nitrogen.

4 The UV absorption spectra of the common ribonucleotides
1 Penyerapan UV Absorpsi spesifik pada 260nm. konjugasi ikatan rangkap dan sistem cincin dari purin dan pirimidin. Dapat digunakan untuk identifikasi asam nukleat. The UV absorption spectra of the common ribonucleotides

5 Efek hiperkromik & hipokromic DNA
Absorbsi single strand DNA (ssDNA)lebih besar double strand DNA (dsDNA)  efek hiperkromik Ikatan hidrogen antar basa nitrogen pada dsDNA membatasi resonansi cincin aromatik basa  penurunan absorbansi UV efek hipokromik ssDNA  basa dalam bentuk bebas (tidak terikat oleh ikatan hidrogen)  absorbansi lebih besar 40% ds DNA bentuknya bertumpuk  membentuk perlindungan dari cahaya   absorbansi berkurang

6 Denaturasi dan digesti

7 2 Denaturasi Konsep : Ikatan hidrogen putus , struktur 3-D hancur, the double helix  single strand irregular coil. hasilnya: Jumlah penyerapan pd 260nm meningkat; Kehilangan fungsi biologi.

8 denaturasi panas dan Tm
saat DNA dipanaskan pada temperatur tertentu, nilai absorbsi pada 260nm akan meningkat tajam， double strand helix DNA terpisah menjadi single strand. Tm (melting temperature of DNA): Suhu dimana absorbsi UV meningkat menjadi setengah dari nilai maksimum pada denaturasi DNA

9 Faktor yang mempernaruhi Tm:
kandungan G-C : Ada tiga ikatan hidrogen antara pasangan G-C. Makin banyak kandungan G-C, makin tinggi nilai Tm. Higher G+C Less G+C Temperature Tm of two DNA molecules with different G+C content

10 3.Renaturasi DNA Saat larutan denaturasi DNA didinginkan perlahan (Annealing), single strand DNA - double strands helix  pemulihan aktifitas biologi.

11 4.Hibridasi Molekul Selama proses penurunan dengan lambat suhu denaturasi, antara DNA yang berasal dari sumber lain atau DNA untai tunggal atau RNA dengan basa komplementer akan membentuk untai ganda menjadi hybrid DNA or DNA-RNA .  hibridasi molekul.

12 Kesimpulan Sifat asam nukleat Absorbsi UV Denaturasi Renaturasi
Hibridasi molekul