Presentasi sedang didownload. Silahkan tunggu

Presentasi sedang didownload. Silahkan tunggu

Loading.......... Ready … Click to Start [>>>]

Presentasi serupa


Presentasi berjudul: "Loading.......... Ready … Click to Start [>>>]"— Transcript presentasi:

1

2 Loading

3 Ready … Click to Start [>>>]

4

5 PIUS DIAN WIDI ANGGORO

6

7 00 / / PA / 08198

8

9 mempersembahkan

10

11 V I S U A L I S A S I T I G A D I M E N S I C I T R A T O M O G R A F I J A M A K

12

13

14 BAB I : PENDAHULUAN BAB I : PENDAHULUAN PENDAHULUANTINJAUAN PUSTAKADASAR TEORIMETODOLOGIPEMBAHASANKESIMPULAN > Rumusan Masalah > Tujuan Penelitian > Latar Belakang > Manfaat [x] LATAR BELAKANG Tujuan tomografi adalah untuk memberikan informasi tampang melintang 2-D atau profil obyek 3-D tanpa melakukan pembedahan, sehingga diperoleh struktur internal yang lebih jelas mengenai karakteristik internal obyek. Kebutuhan untuk pemetaan struktur internal obyek guna keperluan analisis informasi tentang obyek. Menganalisis dalam bentuk citra 2-D maupun citra 3-D lebih mudah daripada menganalisis sederetan angka yang merupakan pernyataan nilai besaran fisis, seperti koefisien pelemahan radiasi bahan. Untuk mengetahui profil internal obyek dalam bentuk 3-D Rekonstruksi berupa citra 2-D dari GRFC perlu dikonversi supaya sesuai dengan format DICOM dan dapat dikenali dengan program visualisasi 3-D seperti Matlab®

15 BAB I : PENDAHULUAN BAB I : PENDAHULUAN PENDAHULUANTINJAUAN PUSTAKADASAR TEORIMETODOLOGIPEMBAHASANKESIMPULAN > Rumusan Masalah > Tujuan Penelitian > Latar Belakang > Manfaat [x] RUMUSAN MASALAH 1.Bagaimanakah citra 3-D dapat disusun dari citra tomografi 2-D jamak? 2.Bagaimanakah struktur internal dan informasi dari obyek 3-D dapat dipresentasikan? 3.Bagaimanakan pengaruh filter rekonstruksi terhadap nilai dan profil citra 3-D hasil proses rekonstruksi?

16 BAB I : PENDAHULUAN BAB I : PENDAHULUAN PENDAHULUANTINJAUAN PUSTAKADASAR TEORIMETODOLOGIPEMBAHASANKESIMPULAN > Rumusan Masalah > Tujuan Penelitian > Latar Belakang > Manfaat [x] TUJUAN PENELITIAN 1.Merancang suatu perangkat lunak (software) yang digunakan untuk menampilkan informasi serangkaian citra 2-D sinogram dan citra hasil TK menjadi 3-D. 2.Melakukan proses simulasi sederhana TK terhadap suatu obyek 3-D dan kemudian mempresentasikan hasil TK melalui visualisasi 3-D menggunakan software Matlab®. 3.Mempresentasikan dan menganalisa profil citra 2-D dan 3-D dalam format standar DICOM maupun format citra GRFC UGM. 4.Membandingkan citra TK 3-D hasil rekonstruksi dengan citra TK 3-D asli (phantom) untuk berbagai pengaruh filter rekonstruksi seperti RamLak, SheppLogan, dan Hamming.

17 BAB I : PENDAHULUAN BAB I : PENDAHULUAN PENDAHULUANTINJAUAN PUSTAKADASAR TEORIMETODOLOGIPEMBAHASANKESIMPULAN > Rumusan Masalah > Tujuan Penelitian > Latar Belakang > Manfaat [x] MANFAAT PENELITIAN 1.Menjadi perangkat pengkajian tentang cara kerja sistem TK 3-D dan struktur internal serta dimensi fisis yang ada. 2.Presentasi 3-D dari citra TK jamak sehingga dapat diketahui secara fisiologi bentuk 3-D dari obyek yang telah di-scan. 3.Menjadi bagian dari perangkat medis dimana GRFC dapat membantu analisis citra medis secara anatomi yang sebelumnya dalam format DICOM. 4.Menjadi alat bantu analisis produk atau uji kelayakan (quality control) dalam bidang industri yang dapat dikembangkan menjadi uji keaslian produk industri. 5.Menjadi sarana penunjang studi, penelitian dan pengembangan sistem TK 3-D yang lebih lanjut, khususnya di Jurusan Fisika FMIPA UGM.

18 BAB II : TINJAUAN PUSTAKA BAB II : TINJAUAN PUSTAKA PENDAHULUANTINJAUAN PUSTAKADASAR TEORIMETODOLOGIPEMBAHASANKESIMPULAN > TK 3-D > TK 2-D > Generasi TK [x] GENERASI TOMOGRAFI KOMPUTER z x y TK – G1 Citra Tomografi Komputer Bidang irisan Citra Radiografi Sumber Sinar-x Citra radiograf vs Citra TK TK – Helical TK – G2 TK – G3 TK – G4 TK – G5

19 BAB II : TINJAUAN PUSTAKA BAB II : TINJAUAN PUSTAKA PENDAHULUANTINJAUAN PUSTAKADASAR TEORIMETODOLOGIPEMBAHASANKESIMPULAN > TK 3-D > TK 2-D > Generasi TK [x] TOMOGRAFI KOMPUTER 2-D G roup R iset F isika C itra TK – G1TK – Scattering STOST TK – G2TK – G3

20 BAB II : TINJAUAN PUSTAKA BAB II : TINJAUAN PUSTAKA PENDAHULUANTINJAUAN PUSTAKADASAR TEORIMETODOLOGIPEMBAHASANKESIMPULAN > TK 3-D > TK 2-D > Generasi TK [x] TOMOGRAFI KOMPUTER 3-D Peralatan dan visualisasi kipas turbin (Bronnikov dan Killian, 1999) Manifold asli dan hasil visualisasi 3-D (Kumar ddk, 2000) Pemayaran TK 3-D berkas kerucut Tabung sinar-x microfocus (45-200kV)

21 BAB II : TINJAUAN PUSTAKA BAB II : TINJAUAN PUSTAKA PENDAHULUANTINJAUAN PUSTAKADASAR TEORIMETODOLOGIPEMBAHASANKESIMPULAN > TK 3-D > TK 2-D > Generasi TK [x] TOMOGRAFI KOMPUTER 3-D Elektroda Sensor Rangkaian Elektronik Akusisi Data Pemayar TK 4-D (ECVT) (Warsito dkk, 2004) Visualisasi Tengkorak manusia (Noel, 2004)Mumi mesir kecil di museum arkeologi Bologna, Italia (Rossi dkk, 2000)

22 BAB III : DASAR TEORI BAB III : DASAR TEORI PENDAHULUANTINJAUAN PUSTAKADASAR TEORIMETODOLOGIPEMBAHASANKESIMPULAN > Transformasi Radon > Proses Fisis & Matematis > Interaksi Radiasi > Format Data TK > Rekonstruksi [x] INTERAKSI RADIASI Hamburan Compton Efek Fotolistrik > Analisis Citra TK 3-D

23 BAB III : DASAR TEORI BAB III : DASAR TEORI PENDAHULUANTINJAUAN PUSTAKADASAR TEORIMETODOLOGIPEMBAHASANKESIMPULAN > Transformasi Radon > Proses Fisis & Matematis > Interaksi Radiasi > Analisis Citra TK 3-D > Rekonstruksi [x] PROSES FISIS & MATEMATIS xx ItIt IoIo  Line integral Ray-sum X-rays xx  ItIo    It Io x > Format Data TK

24 BAB III : DASAR TEORI BAB III : DASAR TEORI PENDAHULUANTINJAUAN PUSTAKADASAR TEORIMETODOLOGIPEMBAHASANKESIMPULAN > Transformasi Radon > Proses Fisis & Matematis > Interaksi Radiasi > Analisis Citra TK 3-D > Rekonstruksi [x] TRANSFORMASI RADON Ruang Radon Ruang Obyek P(  t) f(x,y) t  y x X-rays Sinogram t   -R+R0 Proyeksi = Semua jumlahan sinar dalam satu arah (sudut) Sinogram = Kumpulan dari proyeksi > Format Data TK

25 BAB III : DASAR TEORI BAB III : DASAR TEORI PENDAHULUANTINJAUAN PUSTAKADASAR TEORIMETODOLOGIPEMBAHASANKESIMPULAN > Transformasi Radon > Proses Fisis & Matematis > Interaksi Radiasi > Analisis Citra TK 3-D > Rekonstruksi [x] Citra Tomografi Komputer (TK) : rekonstruksi citra dari proyeksi REKONSTRUKSI CITRA TK Sinogram Citra Rekonstruksi Sinogram tersaring (filtered sinogram) Citra Proyeksi Balik > Format Data TK

26 BAB III : DASAR TEORI BAB III : DASAR TEORI PENDAHULUANTINJAUAN PUSTAKADASAR TEORIMETODOLOGIPEMBAHASANKESIMPULAN > Transformasi Radon > Proses Fisis & Matematis > Interaksi Radiasi > Analisis Citra TK 3-D > Rekonstruksi [x] > Format Data TK FORMAT DATA TK Data type Element size Records length Trailer text … Format FileEkstensiIsi FilePerintah TeksMATSaved MATLAB workspaceload CSVComma-separated numberscsvread DLMDelimited textdlmread TABTab-separateddlmread Lmb kerjaXLSExcel worksheetxlsread CitraTIFFTIFF imageimread PNGPNG imageimread HDFHDF imageimread BMPBMP imageimread JPEGJPEG imageimread GIFGIF imageimread PCXPCX imageimread CURCursor imageimread DCMDCM imagedcmread ICOIcon imageimread SuaraWAVMicrosoft WAVE soundwavread MovieAVIAudio/videoaviread Format data GRFC Format data Matlab® Format Data DICOM

27 BAB III : DASAR TEORI BAB III : DASAR TEORI PENDAHULUANTINJAUAN PUSTAKADASAR TEORIMETODOLOGIPEMBAHASANKESIMPULAN > Transformasi Radon > Proses Fisis & Matematis > Interaksi Radiasi > Analisis Citra TK 3-D > Rekonstruksi [x] > Format Data TK ANALISIS CITRA TK 3-D Analisis KualitatifAnalisis Kuantitatif Citra dengan kontras gelapCitra dengan kontras terang - Histogram - Profil Citra I Resolusi

28 BAB IV : METODOLOGI PENELITIAN BAB IV : METODOLOGI PENELITIAN PENDAHULUANTINJAUAN PUSTAKADASAR TEORIMETODOLOGIPEMBAHASANKESIMPULAN > Analisis Hasil > Tata Laksana > Alat & Bahan [x] Nama File CTHead.dcmMRBrain.dcmCone.bmpCompx.bmpModul3d.dat Citra Resolusi 256x256x109128x128x76 256x256x36256x256x50256x256x17 Sumber DICOM Bitmap GRFC ALAT  Komputer dengan processor Intel Pentium 4 2,4GHz, DDR 256 Mb,  Operating System Microsoft® Windows XP Professional Service Pack 1  Software Borland® C++Builder™ version 6.0 Enterprise Suite untuk : - Software CTData-DICOM Conversion. - Software DICOM Comparator.  Software Matlab® version 7.01 Service Pack 2 Release 14.  Software CT Imager version 1.0 yang sudah tersedia di GRFC UGM. BAHAN

29 BAB IV : METODOLOGI PENELITIAN BAB IV : METODOLOGI PENELITIAN PENDAHULUANTINJAUAN PUSTAKADASAR TEORIMETODOLOGIPEMBAHASANKESIMPULAN > Analisis Hasil > Tata Laksana > Alat & Bahan [x] CT Scan (GRFC) MedicalImaging DICOM (*.dcm) Bitmap (*.bmp) CT Data (*.dat) CTData to DICOM Conversion* (BCB 6) Grayscale Colormap Contrass Edge Detection Multi Frame CT Image (*.cti) Visualization 3 Dimensional (Matlab ® ) Movie (*.avi) Three Dimensional Contour3d Visual3d SliceX SliceY Subvol3d Radonconv Sinogram (*.att) Matlab File Function** (*.m) TATA LAKSANA

30 BAB IV : METODOLOGI PENELITIAN BAB IV : METODOLOGI PENELITIAN PENDAHULUANTINJAUAN PUSTAKADASAR TEORIMETODOLOGIPEMBAHASANKESIMPULAN > Analisis Hasil > Tata Laksana > Alat & Bahan [x] End Radon Conversion** (Matlab ® ) CT Imager (BCB 4) Extract Slice ( x n-slice) Start Dicom References (*.dcm) Sinogram (*.att) RamLak (*.dat)SheppLogan (*.dat) Hamming (*.dat) RamLak (*.dcm) SheppLogan (*.dcm) Hamming (*.dcm) CTData to Dicom Conversion* (BCB 6) Dicom Compare* (BCB 6) ANALISIS HASIL

31 BAB V : HASIL DAN PEMBAHASAN BAB V : HASIL DAN PEMBAHASAN PENDAHULUANTINJAUAN PUSTAKADASAR TEORIMETODOLOGIPEMBAHASANKESIMPULAN > Visualisasi 3-D > Sinogram 3-D > Software > Analisis Kuantitatif > Analisis Kualitatif [x] SOFTWARE Menu Utama Fast Conversion Button Bitmap Viewer Image Properties DICOM Viewer X-Y ProfileDICOM Properties DICOM Edit DICOM Properties Slices Slider Quick Button DICOM Viewer Menu Utama Cursor Position Compare Result Bmp2Dcm-400.exe DcmComp.exe

32 BAB V : HASIL DAN PEMBAHASAN BAB V : HASIL DAN PEMBAHASAN PENDAHULUANTINJAUAN PUSTAKADASAR TEORIMETODOLOGIPEMBAHASANKESIMPULAN > Visualisasi 3-D > Sinogram 3-D > Software > Analisis Kuantitatif > Analisis Kualitatif [x] for n = 1:zo; I = D(:,:,n); pro = xo*pi/2; dth = 180/pro; theta=0:dth:180; [R,xp] = radon(I,theta); C = rot90(R,3); B = fliplr(C); [ybi,xbi]=size(B); xi=round((xbi-xo)/2); B(:,1:xi)=[]; xp(1:xi,:)=[]; [ybo,xbo]=size(B); B(:,xo:xbo)=[]; xp(xo:xbo,:)=[]; d = size(B); str = int2str(n); Nm = [N,str,'.att']; dlmwrite(Nm, d, ' '); dlmwrite(Nm,B,'-append','delimiter', ' '); end SIMULASI TK 3-D Matlab.exe Track Bar Quick Access Command Window Main Menu Figure Layout

33 BAB V : HASIL DAN PEMBAHASAN BAB V : HASIL DAN PEMBAHASAN PENDAHULUANTINJAUAN PUSTAKADASAR TEORIMETODOLOGIPEMBAHASANKESIMPULAN > Visualisasi 3-D > Sinogram 3-D > Software > Analisis Kuantitatif > Analisis Kualitatif [x] SINOGRAM 3-D Brain.att Slice 1Slice 15Slice 40Slice 70 Head.att Slice 1Slice 20Slice 60Slice 100 Cone.att Slice 1Slice 5Slice 15Slice 30

34 BAB V : HASIL DAN PEMBAHASAN BAB V : HASIL DAN PEMBAHASAN PENDAHULUANTINJAUAN PUSTAKADASAR TEORIMETODOLOGIPEMBAHASANKESIMPULAN > Visualisasi 3-D > Sinogram 3-D > Software > Analisis Kuantitatif > Analisis Kualitatif [x] VISUALISASI 3-D Modul3d.dcm Cone.dcmBrain.dcm Head.dcm

35 BAB V : HASIL DAN PEMBAHASAN BAB V : HASIL DAN PEMBAHASAN PENDAHULUANTINJAUAN PUSTAKADASAR TEORIMETODOLOGIPEMBAHASANKESIMPULAN > Visualisasi 3-D > Sinogram 3-D > Software > Analisis Kuantitatif > Analisis Kualitatif [x] VISUALISASI 3-D Brain.dcm Slice 1Slice 5Slice 10Slice 15 Slice 20Slice 25Slice 30Slice 35 Slice 40Slice 45Slice 50Slice 55 Slice 60Slice 65Slice 70Slice 76 Head.dcm Modul3d.dcm

36 BAB V : HASIL DAN PEMBAHASAN BAB V : HASIL DAN PEMBAHASAN PENDAHULUANTINJAUAN PUSTAKADASAR TEORIMETODOLOGIPEMBAHASANKESIMPULAN > Visualisasi 3-D > Sinogram 3-D > Software > Analisis Kuantitatif > Analisis Kualitatif [x] VISUALISASI 3-D Cone.dcm Modul3d.dcmBrain.dcm Head.dcm

37 BAB V : HASIL DAN PEMBAHASAN BAB V : HASIL DAN PEMBAHASAN PENDAHULUANTINJAUAN PUSTAKADASAR TEORIMETODOLOGIPEMBAHASANKESIMPULAN > Visualisasi 3-D > Sinogram 3-D > Software > Analisis Kuantitatif > Analisis Kualitatif [x] ANALISIS KUALITATIF Brain.dcm Modul3d.dcm Z = 40 Y = 81 X = 81 Z = 14 Y = 162 X = 143

38 BAB V : HASIL DAN PEMBAHASAN BAB V : HASIL DAN PEMBAHASAN PENDAHULUANTINJAUAN PUSTAKADASAR TEORIMETODOLOGIPEMBAHASANKESIMPULAN > Visualisasi 3-D > Sinogram 3-D > Software > Analisis Kuantitatif > Analisis Kualitatif [x] ANALISIS KUALITATIF Head.dcm Slice 29Slice 30Slice 31Slice 32 Slice 33Slice 34Slice 35Slice 36 Slice 37Slice 38Slice 39Slice 40 Head.dcm Z = 58 Y = 130 X = 150

39 BAB V : HASIL DAN PEMBAHASAN BAB V : HASIL DAN PEMBAHASAN PENDAHULUANTINJAUAN PUSTAKADASAR TEORIMETODOLOGIPEMBAHASANKESIMPULAN > Visualisasi 3-D > Sinogram 3-D > Software > Analisis Kuantitatif > Analisis Kualitatif [x] ANALISIS KUANTITATIF DicomReferenceRamlakShepploganHamming NamaFileModul3d-t.dcmModul3d-r.dcmModul3d-s.dcmModul3d-h.dcm maximum255 minimum0000 mean total std-dev d r e rmsd-d e-max DicomReferenceRamlakShepploganHamming NamaFileHead-t.dcmHead-r.dcmHead-s.dcmHead-h.dcm maximum255 minimum0000 mean41888 total std-dev d r e rmsd-d e-max0100 DicomReferenceRamlakShepploganHamming NamaFileBrain-t.dcmBrain-r.dcmBrain-s.dcmBrain-h.dcm maximum255 minimum0000 mean total std-dev d r e rmsd-d e-max

40 BAB VI : KESIMPULAN DAN SARAN BAB VI : KESIMPULAN DAN SARAN PENDAHULUANTINJAUAN PUSTAKADASAR TEORIMETODOLOGIPEMBAHASANKESIMPULAN > Saran > Kesimpulan [x] KESIMPULAN 1.Software CTImage-Dicom Conversion yang dibuat, dapat digunakan untuk menampilkan informasi serangkaian citra 2-D hasil TK jamak menjadi 3-D. Dengan program tersebut, profil citra 2-D dan 3-D dalam format standar DICOM maupun GRFC UGM dapat dipresentasikan dan dianalisa dan saling dikonversi. 2.Proses simulasi sederhana TK terhadap obyek 3-D dilakukan dengan pemrograman Matlab® menghasilkan sinogram dengan format standar GRFC, kemudian direkonstruksi dengan CT Imager dengan filter rekonstruksi Ram-Lak, Shepp-Logan, dan Hamming. 3.Hasil TK jamak telah dapat dipresentasikan secara visualisasi 3-D menggunakan perangkat lunak Matlab® dengan fungsi contour3d, visual3d, sliceX, sliceY, dan subvol. 4.Citra tomografi jamak hasil tiga filter rekonstruksi dibandingkan dengan software DICOM Comparator secara kualitatif melalui profil dan histogram maupun secara kuantitatif dengan lima parameter uji statistik.

41 BAB VI : KESIMPULAN DAN SARAN BAB VI : KESIMPULAN DAN SARAN PENDAHULUANTINJAUAN PUSTAKADASAR TEORIMETODOLOGIPEMBAHASANKESIMPULAN > Saran > Kesimpulan [x] SARAN 1.Proses simulasi dan eksperimen pemayaran obyek 3-D untuk menghasilkan sederetan citra 2-D (radiograf), yang dilanjutkan dengan proses rekonstruksi secara simultan agar diperoleh citra TK jamak. 2.Visualisasi 3-D untuk saat ini masih menggunakan software Matlab®, sehingga pengolahan lanjutan atas citra 3-D belum dapat dilakukan. Karena itu, program CTImager-Dicom Conversion perlu dikembangkan agar sanggup menampilkan obyek 3-D secara langsung. 3.Pemanfaatan hasil penelitian mengenai visualisasi 3-D dapat diaplikasikan untuk keperluan medis di rumah sakit, terutama untuk menganalisis struktur internal atau anatomi dari obyek (pasien) maupun menganalisis secara fisiologi.

42 T E R I M A K A S I H Dr. Gede Bayu Suparta, Dosen Pembimbing Dr. Kusminarto, Dosen Penguji 1 Waskito Nugroho, M.Si., Dosen Penguji 2 Karyawan Fisika FMIPA UGM dan karyawan LPPT Unit III Teman – teman di GRFC dan teman – teman Fisika FMIPA UGM [v][x]


Download ppt "Loading.......... Ready … Click to Start [>>>]"

Presentasi serupa


Iklan oleh Google