Presentasi sedang didownload. Silahkan tunggu

Presentasi sedang didownload. Silahkan tunggu

APLIKASI T4 DNA LIGASE DALAM MENINGKATKAN ADENILASI DNA HENNY WIDHYASTUTI 20512054 RISKI DWI MALIDA 20512045 PROGRAM MAGISTER KIMIA INSTUTUT TEKNOLOGI.

Presentasi serupa


Presentasi berjudul: "APLIKASI T4 DNA LIGASE DALAM MENINGKATKAN ADENILASI DNA HENNY WIDHYASTUTI 20512054 RISKI DWI MALIDA 20512045 PROGRAM MAGISTER KIMIA INSTUTUT TEKNOLOGI."— Transcript presentasi:

1

2 APLIKASI T4 DNA LIGASE DALAM MENINGKATKAN ADENILASI DNA HENNY WIDHYASTUTI RISKI DWI MALIDA PROGRAM MAGISTER KIMIA INSTUTUT TEKNOLOGI BANDUNG

3 Bakteriofaga T4 suatu virus dsDNA berukuran 169 Kb yang mengkode hampir 300 gen dalam menghasilkan protein virus

4 Bakteriofaga T4E. coli T4 DNA Ligase metabolisme virus, replikasi, rekombinasi dan perbaikan DNA, serta pada kloning molekuler

5 T4 DNA Ligase mengkatalisis pembentukan ikatan fosfodiester di antara 5-PO 4 dan 3-OH yang berdekatan dari dua fragmen dsDNA mengkatalisis pembentukan ikatan fosfodiester di antara 5-PO 4 dan 3-OH yang berdekatan dari dua fragmen dsDNA menggabungkan ujung tumpul (blunt end) maupun ujung lengket (sticky end) memerlukan suatu kation logam bivalen seperti Mg 2+, dan menggabungkan DNA menggunakan ATP sebagai koenzim

6 Mekanisme Katalisis T4 DNA Ligase

7 T4 DNA Ligase Aplikasi Peningkatan adenilasi DNA

8 DNA 5-adenilasi (5-AppDNA ) bentuk aktif intermediate dari reaksi yang dikatalisis oleh enzim yang dimodifikasi asam nukleat seperti DNA ligase

9 DNA 5-adenilasi (5-AppDNA ) Penelitian yang dilakukan oleh Chiuman dan Li pada tahun 2002 menjelaskan tentang prosedur 5-adenilasi oligonukleotida DNA menggunakan DNA ligase. Akan tetapi, aplikasi metode DNA adenilasi ini belum dapat digunakan untuk berbagai substrat oligonukleotida DNA Peningkatan prosedur DNA adenilasi dilakukan dengan menggunakan T4 DNA ligase serta strand akseptor dengan pemilihan ketidaksesuaian template akseptor C-T yang secara langsung berdekatan dengan sisi adenilasi (Patel et al., 2007) Peningkatan prosedur DNA adenilasi dilakukan dengan menggunakan T4 DNA ligase serta strand akseptor dengan pemilihan ketidaksesuaian template akseptor C-T yang secara langsung berdekatan dengan sisi adenilasi (Patel et al., 2007)

10

11 Modifikasi T4 DNA Ligase Modifikasi T4 DNA Ligase Isolasi enzim dari sumber (bakteri gram negatif, seperti E. coli) pada lingkungan yang berbeda. Perbedaan lingkungan dapat menyebabkan perbedaan aktivitas yang dihasilkan oleh suatu bakteri. Enrichment terhadap media pertumbuhan bakteri, sehingga ekspresi metabolit (misalnya enzim) yang dihasilkan memiliki aktivitas yang berbeda. Enzim yang dihasilkan kemudian diisolasi dan selanjutnya dilakukan karakterisasi untuk mengetahui aktivitas enzim tersebut.

12


Download ppt "APLIKASI T4 DNA LIGASE DALAM MENINGKATKAN ADENILASI DNA HENNY WIDHYASTUTI 20512054 RISKI DWI MALIDA 20512045 PROGRAM MAGISTER KIMIA INSTUTUT TEKNOLOGI."

Presentasi serupa


Iklan oleh Google