Presentasi sedang didownload. Silahkan tunggu

Presentasi sedang didownload. Silahkan tunggu

DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB. Asam nukleat merupakan makromolekul dlm inti sel yg mengandung semua informasi untuk aktivitas maupun reproduksi sel. Berperan:

Presentasi serupa


Presentasi berjudul: "DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB. Asam nukleat merupakan makromolekul dlm inti sel yg mengandung semua informasi untuk aktivitas maupun reproduksi sel. Berperan:"— Transcript presentasi:

1 DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

2 Asam nukleat merupakan makromolekul dlm inti sel yg mengandung semua informasi untuk aktivitas maupun reproduksi sel. Berperan: a) Menyimpan informasi genetik b) Proses replikasi dan transkripsi DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

3 FUNGSI NUKLEOTIDA Penting untuk semua sel Komponen cofaktor enzim : CoA; FAD; NAD; NADP Pembawa energi kimia (Energy Carriers): ATP, ADP, GTP Precursor sintesis DNA Precursor sintesis RNA

4 DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB -- Except for some animal virus, DNA is genetic material. -- RNAs have more diverged functions: -- structural RNAs: e.g. rRNA -- enzymatic RNAs: e.g. ribozymes -- genetic materials: e.g. HIV virus. -- others: e.g. tRNA, gRNA, etc. -- (deoxy)ribonucleotides are the building blocks of nucleic acids: 3 characteristic components: -- due to the acidity of phosphate => called nucleic “acid” -- also due to phosphate: DNA and RNA are highly negatively charged. -- phosphate and ribose are hydrophilic

5 Asam nukleat dibentuk dari nukleotida yg memiliki suatu gula, basa nitrogen, dan fosfat. DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB Sugar Base PO 4 Nukleosida

6 DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB Ribosa merupakan molekul gula pada RNA 2-Deoksiribosa merupakan molekul gula pada DNA Ikatan gula ribosa dengan basa nitrogen (pada atom karbon nomor 1). Ikatan gula ribosa dengan gugus fosfat (pada atom karbon nomor 5). Gugus hidroksil pada atom karbon nomor 2 Perhatikan:

7

8 DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

9 Struktur Primer DNA dan RNA A, G, T, C  DNA A, G, U, C  RNA DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

10 Pasangan Basa A-T dan G-C yang Berikatan Hidrogen A-T memiliki 2 ikt. Hidrogen G-C memiliki 3 Ikt. Hidrogen DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB “ Two strands” harus saling komplementer satu sama lain

11 Knowing sequence of one strand, we will know the sequence of the other strand. e.g. 5’-GCATCGACCTTT-3’ 3’-?????????????????-5’ if 5’-GCATCGACCTTT-3’ ---- Sense, (+), nontemplate, coding strand 3’-CGTAGCTGGAAA-5’ --- Nonsense, (-), template, noncoding strand transcription RNA 5’-GCAUCGACCUUU-3’ DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

12 Model struktur DNA Watson-Crick DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

13 supercoiled relaxed Molekul DNA sirkular dan superkoil DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

14  mRNA (messenger RNA)  Membawa informasi genetik dari DNA ke ribosom untuk sintesis protein  rRNA (ribosomal RNA)  Penyusun 65 % ribosom, sisanya protein  Mengenali mRNA  tRNA (transfer RNA)  Menterjemahkan kode genetik dari mRNA menjadi asam amino tertentu

15

16

17 Replikasi DNA Semikonservatif DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

18 Proses Replikasi DNA DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

19 Struktur ribosom pada prokariot dan eukariot DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

20 1. Anabolisme Asam Nukleat  Biosintesis Purin  Biosintesis Pirimidin 2. Katabolisme Asam Nukleat  Degradasi Purin  Degradasi Pirimidin Created by WARAS NURCHOLIS DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB

21

22 5-Phospho- -D-ribosyl-1-pyrophosphate 5-Phospho- -D-ribosyl-1-pyrophosphate (PRPP) Intermediet untuk baik proses de novo and salvage pathway Berasal dari ribosa 5 phosphat

23 Biosintesis De Novo Purines

24

25

26 GAR synthetase GAR transformylase FGAR amidotransferase FGAM cyclaseAIR karboksilase SAICAR synthetase SAICAR lyase AICAR transformylase IMP synthase

27 Hal-hal penting dalam sintesis de novo purin: 1. Sangat tergantung pada “pool” ribosa 2. Gugus amina  didonor oleh glutamin dgn enzim amidotransferase 3. Glisin dan fumarat  donor ring dlm nukleotida 4. Daur reaksi  dikontrol secara alosterik dgn AMP, ADP, GMP dan GDP.  bekerja pada PRPP amidotransferasePRPP amidotransferase

28 Daur diawali dgn perubahan PRPP  IMP IMP = Inosine monofosfat mrpkn bentuk nukleotida purin yang pertama dibentuk dlm daur ini Sebagai basa adalah hypoxanthin

29 DAUR dr IMP  AMP & GMP IMP dehidrogenase XMP aminase Adenilosuksinat synthetase Adenilosuksinat lyase

30 Metabolisme de novo nukleotida pirimidine CP synthetase Aspartat transcarbomoylase dihydrorotase Dihidrooratate DH

31 Orotat fosforibosiltransferas e Orotidilate dekarboksilase UMP kinase CTP synthetase Nukleosida diphosphat kinase

32 Hal-hal penting dalam sintesis de novo pirimidine: cincin pirimidine disintesis terpisah dr gula ribosa nya Daur pirimidine de novo tidak bercabang  produk akhir dr daur adalah UMP yang mrpkn bahan dari CMP Reaksi pertama  pembtkan karbamoyl aspartate dr asp dan carbomoyl-P  titik regulasi yg penting dlm daur tsb Aspartat transcarbomoylase (ATCase)  diaktivasi oleh ATP dan dihambat oleh CTP sbg produk akhir

33 Degradasi purine Produk akhir katabolisme purin : asam urat

34 Vertebrata terestrial  urea  ureotelic Burung & reptil  asam urat  uricotelic Binatang di air  ammonia  ammonotelic

35 Degradasi pirimidin

36 Terimakasih DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB


Download ppt "DEPARTEMEN BIOKIMIA FMIPA IPB. Asam nukleat merupakan makromolekul dlm inti sel yg mengandung semua informasi untuk aktivitas maupun reproduksi sel. Berperan:"

Presentasi serupa


Iklan oleh Google