KAMRIANTI RAMLI, S.Pd., M.Pd 085 255 582 876 MIKROBIOLOGI KAMRIANTI RAMLI, S.Pd., M.Pd 085 255 582 876
Pengertian Mikrobiologi Mikrobiologi berasal dari kata mikro (kecil atau renik) Bio (hidup) dan logos (ilmu) Mikrobiologi merupakan bidang ilmu yang yang mengkaji tentang mikrobia seperti virus, archaea, bakteri, fungi, algae, dan protozoa
? Antonie van Leeuwenhoek Penemu mikroskop 1632-1723 Penemu mikroskop Pertama melihat fungi, bakteri dan protozoa
Peranan Mikrobiologi Lingkungan Penelitian Bertanggungjawab memelihara kesuburan tanah Membersihkan lingkungan dari senyawa-senyawa toksik Ada yang bertindak sebagai bahan pengontrol biologis melawan penyakit tanaman Penelitian Model organisme untuk penelitian proses biokimia dan genetika
Kedokteran Makanan Bioteknologi Menghasilkan antibiotik dan berbagai obat-obatan Makanan Digunakan dalam pembuatan anggur dan minuman, keju dan roti Bioteknologi Mensintesis berbagai senyawa kimia, misalnya aseton, asam asetat, dan asam-asam organik lainnya
Kedudukan Mikrobiologi diantara ilmu-ilmu lainnya Botani Mikrobiologi Zoologi Bakteriologi Immunologi Mikologi Pikologi Protozologi Virologi
Sejarah Perkembangan Mikrobiologi Kontroversi doktrin Generasi Spontan Aristoteles (384-322 SM) MH hidup berasal dari tanah Samson dan Virgil (40 SM), mendukung teorinya dengan memaparkan temuannya membuat lebah dari madu Timbul doktrin generasi spontan yang menyatakan bahwa ulat merupakan penjelmaan daging Doktrin ini bertahan hingga abad ke 17
Reputasi Akhir doktrin Generasi Spontan Ilmuan yang menyanggah teori Generasi spontan Fransisco Redi (1626-1697) ulat yang ada didaging akibat telur lalat yang hinggap pada daging yang membusuk Lazzarro Spallanzani (1713-1781) mikrobia tumbuh pada bahan makanan bersumber dari udara yang mengandung mikrobia Louis Pasteur (1822-1895) udara terdapat banyak partikel-partikel kecil yang tidak tampak oleh mata telanjang
Penemuan Peran Mikrobia sebagai Penyebab Penyakit Tahun 1813 dibuktikan jamur tertentu dapat menyebabkan penyakit pada gandum Berkeley (1845) penyakit kentang di Irlandia membawa malapetaka 1836, Agustino Bassi de Lodi, jamur mempengaruhi penyakit khusus serangga. Penyakit ulat sutera disebabkan oleh jamur Beauveria bassiana Sconlein memaparkan penyakit kulit manusia akibat infeksi jamur
Koch dan Teori Kuman Penyebab Penyakit Koch menggunakan tikus rumah sebagai bahan penelitian mengenai penyakit antraks
Postulat Koch, berbunyi Organisme penyebab penyakit harus selalu ada pada hewan yang terkena penyakit dan tidak ditemukan pada hewan yang sehat Organisme yang terdapat dalam tubuh hewan tersebut harus dapat ditumbuhkan dalam biakan murni Biakan murni tersebut harus dapat diinokulasikan pada hewan yang sama dan menimbulkan gejala yang sama pula Penyebab penyakit tersebut harus dapat diisolasi kembali dari hewan percobaan dan dapat ditumbuhkan kembali di laboratorium, dan menunjukkan organisme yang sama dengan yang diperoleh sebelumnya
Postulat Rivers > Virus 1. Agen virus harus ditemukan dalam cairan tubuh inang yang sakit atau di dalam sel memperlihatkan lesi spesifik 2. Agen virus yang diperoleh dari inang terinfeksi harus menimbulkan penyakit spesifik pada hewan maupun tumbuhan atau menunjukkan bukti infeksi melalui pembentukan antibodi terhadap virus tersebut. 3. Virus yang diisolasi dari hewan percobaan harus dapat ditularkan ke hewan peka lainnya dan menimbulkan gejala penyakit yang sama
MORFOLOGI DAN ANATOMI PROKARIOTIK Pertemuan Kedua MORFOLOGI DAN ANATOMI PROKARIOTIK
Struktur Sel Prokariotik:Bakteri fili sitoplasma flagella ribosom Dinding sel mesosom
Ukuran Sel Prokariotik Secara umum berkisar dari 0,1 – 20 µm Paling kecil adalah Paramecium sp berkisar 200 nm Paling besar adalah Epulopiscium fishelsoni ukurannya 1 juta kali dari bakteri pada umummya. Cat: 1 µm = 1/1000 atau 0,001 mm atau 1/10.000 atau 0,0001 cm
Bentuk Sel Prokariotik Ferdinand Cohn membagi bakteri berdasarkan ciri morfologinya, yaitu: coccus, berbentuk bundar atau bulat Basil, berbentuk batang atau silinder Spiral, berbentuk batang bengkok atau melingkar Filamen, berbentuk benang atau filamen
Susunan Kelompok Sel Bakteri Monococcus, coccus sendiri-sendiri Diplococcus atau Diplococci, pembelahan bakteri yang tetap bertautan dan berpasang-pasangan Tetracoccus, membagi diri dalam dua arah yang membentuk sudut siku-siku dan tiap kelompok tersusun atas 4 sel
Sarcina, membagi diri ke arah 3 bidang, dengan sudut siku-siku satu sama lain, yaitu tiap-tiap kelompok bakteri tersusun sebagai kubus Streptococcus, coccus yang berantai, yaitu pembelahan sel terjadi konstan paralel sehingga membentuk rantai
Filamentus, kelompok bakteri yang membentuk hifa palsu, mis golongan Actinomycetes Bacillus, Streptobacillus, Spirillum yaitu pembelahan melintang terhadap axis longitudinal selnya, lalu terbentuk sel anakan
Struktur Sel Bakteri Struktur tidak tetap komponen yang dimiliki oleh beberapa sel bakteri tetapi tidak semua sel mis: dinding sel, flagel, fili, kapsul, lapisan lendir, vakuola gas, spora Struktur tetap komponen yang dimiliki oleh semua sel bakteri mis: membran sitoplasma, komponen genetik, ribosom
Dinding Sel Fungsinya memberi bentuk, memberi kekuatan sel, memelihara tekanan osmosis cairan intraseluler, komunikasi antar sel, pembelahan dan pertumbuhan sel Memiliki peptidoglikan yaitu homopolimer dengan komposisi dan struktur khusus yang disintesis oleh sel prokariotik
Perbedaan antara Dinding Sel Bakteri Gram negatif dan Gram positif Komponen Dinding sel gram + Dinding sel gram - Peptidoglikan Berlapis tebal Berlapis tipis Tetrapeptida peptidoglikan Kaya akan lisisn Semua mengandung meso-asam diaminopimelat Ikatan silang peptidoglikan Umumnya melalui pentapeptida Ikatan langsung Asam teikoat Ada Tidak ada Asam teikuronik Tidak Ada Lipoprotein LPS Membran luar Ruang periplasmik
Mekanisme Pengecatan Gram Mula-mula sel diwarnai dengan suatu zat warna basa yaitu kristal violet Dicuci dengan air mengalir Diberi iodium (lugol) sehingga terbentuk suatu kompleks kristal violet iodin dalam sel (warna sel semakin kuat) Lalu diberi alkohol aseton, untuk zat warna yang tidak kuat akan terlepas (gram -) sehingga transparan, gram + akan berwarna biru Lalu diberi warna safranin, akan diserap oleh gram – sehingga berwarna merah, gram + berwarna biru kristal violet
PERTEMUAN KETIGA
Membran Sitoplasma Tebal kira-kira 7,5 nm (0,0075 µm) Terdiri dari fosfolipid (20-30%) dan protein (50-70%) Fungsi permebialitas dan respirasi
Flagella Ukuran 20 nm Terdiri atas filamen, pencantel, dan badan dasar Berputar dengan kecepatan 3000 putaran permenit Fungsi : menjauh dari oksigen, menuju kearah cahaya, magnet, dan kemotaksis Flagella
Flagella dibedakan berdasar kedudukannya Monotrik, satu flagel melekat diujung sel Lopotrik, lebih dari dua flagel melekat diujung sel Amphitrik, satu flagel melekat dikedua ujung sel Kopotrik, banyak flagel melekat dikedua ujung sel Peritrik, banyak flagel menyebar pada permukaan sel Atrik , tidak mempunyai flagel
Fili dan Fimbria Organel tambahan bagi bakteri garam – Fili adalah benang-benang pendek lurus dan kecil Fimbria adalah rambut Fungsi fili untuk pemindahan materi genetik, pelekatan inang (kawin), hanya jantan punya fili Fimbria berfungsi mencegah ditelan oleh fagositosis
Glikokaliks Mengelilingi dinding sel bakteri Terdiri atas Kapsul Lapisan slime Lapisan S
Kapsul Permukaan dinding sel ditutupi oleh suatu lapisan Fungsinya: Membantu mencegah kekeringan sel Bertindak sebagai penghalang ion-ion logam toksik masuk ke dalam sel Mencegah infeksi oleh bakteriofage Membantu perlekatan Membantu sel terhadap pagositosis
Lapisan Slime Tidak berikatan kuat dengan dinding sel Fungsinya melindungi sel terhadap kekeringan dan kehilangan nutrien
Lapisan S/protein kristallin Ditemukan pada beberapa jenis gram – dan + Fungsi belum diketahui
Bentuk Sel Dorman Bakteri Spora Spora dibentuk di dalam sel (endospora) dengan dinding yang tebal dan tahan pemanasan, mis: Clostridium dan Bacillus Systa dinding tebal, tidak tahan pemanasan, mis: Azotobacter vinelandii
Arhaea Membrannya mengandung protein tinggi dan lipida yang beragam Tidak mengandung peptidoglikan, hanya pseudopeptidoglikan Contoh: Sulfolobus sp, hidup diatas 90°C
PERTEMUAN KEEMPAT
MORFOLOGI DAN ANATOMI MIKROBIA EUKARIOTIK FUNGI KAPANG KHAMIR ALGA PROTOZOA
FUNGI Ciri-ciri fungi Mempunyai inti sel Membentuk spora Tidak berklorofil Heterospora Saprofit Berkembang biak secara sexual (plasmogami,karyogami) dan aseksual (pembelahan sel, pertunasan, fragmentasi)
Struktur Tubuh Fungi
Reproduksi secara seksual Plasmogami merupakan mekanisme peleburan antara dua protoplas yang kemudian diikuti dengan peleburan intinya Karyogami terjadi jika dua inti kompatibel bersama-sama melakukan fusi inti
Tipe Utama Fungi berdasar kebutuhan karbon dan energi Saprofitik menggunakan nutrien dan sisa-sisa tumbuhan/hewan mati Parasitisme memanfaatkan jaringan hidup tanaman/hewan sehingga dapat menganggu inang Simbiosis Hidup pada jaringan hidup dan memberi keuntungan pada inang
Klasifikasi dan sifat utama beberapa fungi Kelompok Nama Umum Tipe Hifa Genus Tipe spora seksual Ascomycetes Fungi kantung Septa Neurospora, Saccharomyces, Morcella Askospora basidiomycetes Jamur Amanita, agaricus Basidiospor Zygomycetes Jamur roti Senositik Mucor, Rhizopus Zygospor Oomycetes Jamur air Allomyces Oospor Deuteromycetes Fungi imperfekti septa Penicillium, Aspergillus, Candida Tidak diketahui
Senositik Septa
KELAS ASCOMYCOTA Ciri-Ciri Ada yang berjamur bersel satu, Saccharomyces sp ada yang bersel banyak dengan hifa bersekat dan berinti banyak, Penicillium sp Bersel banyak banyak membentuk tubuh buah, Xylaria sp dan Nectria sp Reproduksi aseksual membentuk spora, tunas Reproduksi seksual dengan membentuk askokarp
KELAS BASIDIOMYCOTA Tumbuh di musim penghujan Umumnya tumbuh di batang pohon lapuk/lembap Mempunyai tubuh buah Reproduksi seksual secara basidiospora
Contoh Zygomycetes
KELAS ZYGOMYCOTA/PHYCOMYCOTA Hifa tidak bersekat (senositik) Hidup saprofit, parasit Reproduksi aseksual membentuk sporangium Contoh: Rhizopus oryzae (jamur tempe)
KELAS OOMYCOTA Hifa tak bersekat Reproduksi aseksual : pembentukan zoospora Reproduksi seksual : peleburan sel telur haploid dan inti sperma haploid Contoh : Phytophthora nicotinae
KELAS DEUTEROMYCOTA Hifa bersekat Beberapa membentuk tubuh buah Ada yang hidup parasit Reproduksi aseksual dengan konidiospora, blastospora, artospora Reproduksi seksual belum diketahui Contoh : Epidermophyton floocosum (kurap)
Tugas Carilah peranan fungi baik yang merugikan maupun menguntungkan, sertai contoh spesiesnya.
Ciri-ciri Khamir Lebar 1-5 µm dan panjangnya 5-30 µm atau lebih Bentuk uniseluler, bulat, oval, silinder, ogival, segitiga melengkung, berbentuk botol, lemon/apikulat, pseudomiselium, dsb Tidak punya flagella Koloni halus tampak berkilauan Tidak dapat melakukan fotosintesis Dinding sel kaku
Bentuk-bentuk sel Khamir BULAT OVAL SILINDER OGINAL BOTOL TRIANGULAR PSEUDOMISELIUM APIKULAT
Reproduksi Khamir: Pertunasan Suatu saluran terbentuk dari vakuola didekat nukleus menuju dinding sel, dinding sel mengalami penipisan, sehingga protoplasma akan tersembul keluar lalu membesar dan diisi dengan komponen-komponen nukleus dan sitoplasma dari induknya melalui saluran yang terbentuk. Tunas tumbuh dan membentuk dinding sel baru
Tugas Carilah manfaat dari Khamir
Kapang Kapang merupakan fungi multiseluler yang mempunyai filamen dan pertumbuhannya pada substrat mudah dilihat karena penampakannya yang berserabut seperti kapas
REPRODUKSI KAPANG Askospora Basidiospora zygospora Spora kapang Spora seksual Spora aseksual Konidiospora Sporangiospora Oidium/arthrospora Klamidiospora blastospora Askospora Basidiospora zygospora
Konidiospora yaitu spora yang dibentuk diujung Sporangiospora terbentuk di dalam kantung spora Oidium terjadi karena segmentasi pada ujung-ujung hifa Klamidiospora terbentuk pada sel-sel vegetatif Blastospora terbentuk dari tunas pada miselium yang kemudian tumbuh menjadi spora
Macam-Macam Spora Aseksual
Macam-Macam Spora Seksual
Askospora yaitu spora yang dibentuk diaskus Basidiospora yaitu spora yang dibentuk dalam basidium Zygospora terbentuk apabila ujung-ujung dua hifa yang seksual
ALGA Ciri-ciri Alga Mengandung klorofil Ada yang berukuran mikro dan makroskopik Bersifat uniseluler, koloni Bersifat motil (dpt bergerak)/non motil Seksual (konjugasi gamet sel) aseksual (pembelahan biner)
Jenis-Jenis Alga Chlorophyceae/alga hijau uniseluler motil hingga lembaran, filamen, senositik. Reproduksi seksual konjugasi Contoh: Clamydomonas Chrysophyta/alga coklat keemasan umumnya berflagella, ada yang amuboid, uniseluler, koloni, filamen, reproduksi seksual isogami contoh: Navicula
Dinoflagellata uniseluler, reproduksi aseksual dengan pembelahan sel secara memanjang Contoh: Noctiluca miliaris Euglenophyta uniseluler, hidup heterotrof dan autotrof, ukuran panjang sel 10 µm – 500 µm Contoh: Euglena sp
Protozoa Ciri-ciri Tidak punya dinding sel Membran plasma dua lapis Punya dua atau lebih inti
4 filum Protozoa Mastigophora (flagellata) memiliki flagellata secara umum Contoh : Euglena viridis Sarcodina (membentuk pseudopodia) tidak memiliki sifat tetap, berkembang biak dengan pembelahan biner Contoh : Entamoeba hystolica
Ciliata bentuknya bulat, terompet, dan ginjal berkembangbiak aseksual dengan pembelahan melintang, seksual dengan konjugasi Contoh: Paramecium caudatum Sporozoa bersifat parasit obligat, tidak punya alat gerak Contoh : Plasmodium vivax