ASAM AMINO & PROTEIN.

Presentasi berjudul: "ASAM AMINO & PROTEIN."— Transcript presentasi:

1 ASAM AMINO & PROTEIN

2 Unit dasar struktur protein
Asam -amino: asam organik yang mengandung: gugus amino gugus karboksil. atom hidrogen dan gugus R (rantai samping) pembeda Keempat substituen tsb terikat pada atom karbon  (atom C yang letaknya berdekatan dengan gugus karboksil)

3 Contoh:

4 Struktur 3D asam -amino Penulisan asam -amino

5 Asam amino dengan satu C asimetrik dapat menghasilkan 2 senyawa enansiomer Alanin memiliki enansiomer L dan D. Dua isomer optis aktif ini memiliki arah yang berlawanan dalam memutar bidang cahaya terpolarisasi.

6

7 Asam amino standar: asam amino penyusun protein dalam makhluk hidup
berbentuk L-asam - amino jumlahnya 20 buah

8 Karakter 20 asam amino standar

9

10

11

12

13

14

15 PDI 2 molekul sistein dapat bereaksi membentuk ikatan/jembatan disulfida  ikatan silang (cross link)

16 Asam amino merupakan molekul amfoter
Memiliki pK1, pK2 dan pKR Pada pI: semua molekul berbentuk zwitter ion Pada pH netral atau > pI: dominan bentuk anion Pada pH < pI: dominan bentuk kation

17 Kenaikan pH

18 Pembentukan ikatan peptida
Gugus peptida Ikatan peptida

19 Unit asam amino dalam rantai polipeptida= residu Konsensus :
ujung amino = residu asam amino awal ujung karboksil = residu asam amino akhir

20 Ikatan peptida berkarakter parsial ganda akibat adanya delokalisasi elektron dari oksigen gugus COO- ke ikatan C-N Gugus amidanya planar, dan berada dalam konfigurasi Trans. Rotasi hanya dapat terjadi pada dua ikatan yang dekat C di setiap residu asam amino.

21 Empat tingkat organisasi struktur dalam protein

22 Empat tingkat organisasi dalam protein
Struktur primer: menunjukkan jumlah, jenis dan urutan asam amino dalam protein Struktur sekunder: terjadi akibat pembentukan ikatan H antara gugus karboksil dan gugus amino pada residu asam amino tertentu, dan pembatasan rotasi bidang peptida di sekitar atom C menunjukkan pembentukan konformasi khas dalam rantai polipeptida molekul protein, meliputi: - heliks, -turn -sheet, random coil

23 -Heliks  -Sheet

24  Sheet antiparalel

25  Sheet paralel

26 Struktur tersier: Menunjukkan pembentukan lipatan (folding polypeptide), yang disebabkan oleh adanya interaksi antar gugus pada R. Jenis interaksi tersebut meliputi: ikatan H, ikatan elektrostatik, interaksi hidrofobik antar rantai samping non polar, interaksi dipol-dipol, dan pembentukan ikatan disulfida (ikatan kovalen). Struktur kuartener: Menunjukkan penggabungan 1 rantai polipeptida / subunit penyusun protein. Contoh protein yang memiliki beberapa rantai polipeptida adalah Hemoglobin.