Penggunaan CSSLs untuk pencarian lokasi gen dalam kromosom

Slides:



Advertisements
Presentasi serupa
APLIKASI BIOTEKNOLOGI DALAM PENINGKATAN PRODUKSI LIVESTOCK Drs
Advertisements

Prof. Drs. Sutarno, MSc., PhD.
Genetika Molekuler.
Genetika (Genetics).
Organel Sel Organel sel : suatu struktur di dalam sitoplasma yang mempunyai tugas khusus Organel sel : suatu struktur di dalam sitoplasma yang mempunyai.
Biokontrol.
Genetika terapan.
Pengelolaan Perubahan Dibawakan pada Musyawarah Nasional Muslim Information Technology Association ke-2 di Bogor, 8 Februari 2003 Oleh: Bayu Waspodo, SE,
STRUKTUR DAN FUNGSI DAUN STRUCTURE & FUNCTION OF LEAF
OLEH SUDRAJAT FMIPA UNMUL Struktur Sel Bakteri.
by: IDA RIANAWATY Januari 2010
RFLP= Restriction fragment length polymorphism
Hukum Ampere.
1. Properties of Electric Charges 2. Coulomb’s law 3. The Electric Fields 4. Electrics Field of a Continuous Charge Distribution 5. Electric Field Lines.
1 Pertemuan 02 Ukuran Pemusatan dan Lokasi Matakuliah: I Statistika Tahun: 2008 Versi: Revisi.
GENETIKA DASAR.
Fuzzy for Image Processing
Teknologi dna rekombinan
TEORI DAN STRUKTUR SEL (Sub Bab : INTI & PEMBELAHAN SEL) Bagian IV
Kuliah Pengelolaan Air untuk Pertumbuhan Tanaman
1 Pertemuan 03 Konsep Perencanaan Tag, Tag Price, Label, Casing Display Matakuliah: UO276 / Desain Komunikasi Visual III Tahun: 2006.
Kegagalan Material pada Peristiwa Titanic Arfah Gunawan P Juni 2016.
Hemofilia hnz11.
KOMUNIKASI DATA Materi Pertemuan 3.
HUKUM AMPERE.
MENDEL LAW AND ITS DEVIATIONS
PATHOGENESIS Pathogenesis is the development of disease, from the initial appearance of disease all the way to its end stages This is important for forest.
LIMIT FUNGSI LIMIT FUNGSI ALJABAR.
REKAYASA GENETIKA.
Matakuliah : I0014 / Biostatistika Tahun : 2005 Versi : V1 / R1
RKPS: 2015 KONTRAK KULIAH (MATERI) GENETIKA
Program Studi S-1 Teknik Informatika FMIPA Universitas Padjadjaran
COMPOUND NOMENCLATURE AND EQUATION OF REACTION
Matakuliah : I0014 / Biostatistika Tahun : 2005 Versi : V1 / R1
METABOLISME PROTEIN.
HASIL YANG TELAH DICAPAI
New Generation Tempe Indonesia Nutrisi Sehat Tinggi Kalori dan Protein
VECTOR VECTOR IN PLANE.
Pertemuan 24 Teknik Searching
MENGAPA PERLU PELAJARI GENETIKA?
KONSTRUKSI TEBU TRANSGENIK PS-IPB1
SELEKSI MASSA Bogor Agricultural University Institut Pertanian Bogor.
Mendelian Genetics 5/25/2018 Genetika Mendel.
KETAHANAN TERIMBAS (INDUCED RESISTANCE).
Pilih Menu :. Pilih Menu : Standar Kompetensi Menggunakan aturan statistika dalam menyajikan dan meringkas data dengan berbagai cara: memberi tafsiran,
Pendugaan Parameter (II) Pertemuan 10
Unsur-unsur visual Garis dalam media visual dapat menghubungkan unsur-unsur menjadi suatu kesatuan atau memandu mengikuti urutan. Bentuk yang tidak biasa.
FACTORING ALGEBRAIC EXPRESSIONS
FOOD DAMAGE PREVENTION
KEEFEKTIVAN PADI TRANSGENIK TERHADAP HAMA PENGGEREK BATANG PADI KUNING SCIRPOPHAGA INCERTULAS (WALKER) (LEPIDOPTERA: CRAMBIDAE)
Copyright © 2010 Academic Press Inc. Chapter 1 Basic Genetics Molecular Biology Author: Clark.
Filogenetik Siti K. Chaerun.
LIPOSOM Agustina Setiawati.
Comparing Monocot and Dicot Pants
Genetika (Genetics) (AGR-202) Tujuan : Pada akhir semester mahasiswa diharapkan memahami dan.
Database User Account.
Biologi Sel Bagian III: Nucleus &Nucleolus
Self-Organizing Network Model (SOM) Pertemuan 10
GENETIKA DAN PEMULIAAN TANAMAN
Figure 8. Burn injuries © The Author(s) Published by Science and Education Publishing. OLAOYE. O. J. et al. Occupational Hazards and Injuries Associated.
External Structure of the Plant – Parts of the plant on the outside. The Root  Types of Root Systems  Functions of the Root System  Specialized Root.
Magnitude and Vector Physics 1 By : Farev Mochamad Ihromi / 010
PENYEDIAAN ANTISERUM POLIKLONAL TERHADAP COAT PROTEIN (CP) DARI TOMATO CHLOROSIS VIRUS (ToCV) YANG DIEKSPRESIKAN PADA Escherichia coli Gede Suastika &
Is it different ? HEREDITY SUBSTANCES HEREDITY SUBSTANCES.
FORCES. A force is an influence on a system or object which, acting alone, will cause the motion of the system or object to change. If a system or object.
By Yulius Suprianto Macroeconomics | 02 Maret 2019 Chapter-5: The Standard of Living Over Time and A Cross Countries Source: http//
Ilmu Tanaman Pakan Ternak
Al Muizzuddin F Matematika Ekonomi Lanjutan 2013
Transcript presentasi:

Penggunaan CSSLs untuk pencarian lokasi gen dalam kromosom Bogor, 21 Februari 2013

? ? Apakah CSSLs itu? ?

Strategi dasar pemetaan QTL (lokus sifat kuantitatif) Fenotipe: kerapatan trikoma daun Populasi: RILs (recombinant inbred lines) Mauricio, Nature Reviews Genetics, 2001

Metode pemetaan QTL (lokus sifat kuantitatif) Fenotipe: kerapatan trikoma daun Populasi: F2 Mauricio, Nature Reviews Genetics, 2001

Pemetaan awal mencari lokasi Istana Bogor

Pemetaan halus mencari lokasi Istana Bogor

Tahap-tahap berurutan dalam kloning gen-gen QTL Semua tahap ini makan banyak waktu dan tenaga Ashikari & Matsuoka, Trends in Plant Science, 2006

Produksi Introgression Lines (ILs) atau CSSLs Ashikari & Matsuoka, Trends in Plant Science, 2006

Chromosome Segment Substitution Lines (CSSLs) Ebitani et al., Breeding Science , 2005

Pemetaan QTL menggunakan Introgression Lines (ILs) atau CSSLs Paran & Zamir, Trends in Genetics, 2003

Introgression lines of L Introgression lines of L. pennellii in cultivated tomato for QTL mapping FM = fruit mass Left: a fruit from the wild tomato species L. pimpinellifolium Right: a fruit from L. esculentum cv. Giant Red, bred to produce extremely large tomatoes Eshed & Zamir, Genetics, 1995

Figure 2 High-resolution mapping of the fw2.2 QTL. A Frary et al. Science 2000;289:85-88 Published by AAAS

Phenotypic effect of the fw2.2 transgene in L. esculentum pCLD04541 Fruit from R1 progeny of fw107 segregating for the presence (+) or absence (-) of cos50 The exact molecular function of fw2.2 is not known, although it shares homology with the human RAS oncogenes in protein structure and contains two predicted transmembrane-spanning domains. fw2.2 acts as a negative regulator of cell division in the fruit, perhaps via some role in cell-to-cell communication. A Frary et al. Science 2000;289:85-88 Published by AAAS

Positions of QTLs for field resistance to rice blast in Japanese upland rice qBR4-2 146 F4 lines (NipponbarexOwarihatamochi) 111 RFLP markers pi21, a recessive gene encoding a proline-rich protein (Fukuoka et al., Science, 2009) Fukuoka & Okuno, TAG, 2001

Pengembangan bahan tanaman Sub-CSSLs Fukuoka et al., TAG, 2012

Graphical genotypes dari Sub-CSSLs sekitar qBR4-2 Fukuoka et al., TAG, 2012

Graphical genotypes dari Sub-CSSLs sekitar qBR4-2a dan qBR4-2b Fukuoka et al., TAG, 2012

Pyramiding qBR4-2a, qBR4-2b, dan qBR4-2b Fukuoka et al., TAG, 2012

Perbandingan sekuen qBR4-2a antara Nipponbare dan Owarihatamochi Fukuoka et al., TAG, 2012

Peranan protein NBS-LRR dalam ketahanan tanaman terhadap patogen Spoel & Dong, Nat Rev Immunology, 2012

Analisis filogenetik qBR4-2a dan 30 gen R yang lain Fukuoka et al., TAG, 2012

Terima kasih Terima kasih