Enzimologi Billy Harnaldo Putra /

Slides:



Advertisements
Presentasi serupa
Fermentasi dan Perbaikan Kultur
Advertisements

KINETIKA ENZIM.
Jakarta, 7 – 8 November 2013 Seminar Insentif Riset SINas, Kementerian Riset dan Teknologi “Membangun Sinergi Riset Nasional untuk Kemandirian.
ENSIM.
AMINA Senyawa yang mengandung gugus NH2 Struktur : RNH2
Fumarate hydratase (EC )
Penulis Purkan, Wiwin Retnowati, Dessy Natalia Asal Fakultas Sains dan Teknologi Sumber Dana DIPA-RM Tahun 2009 Bidang Ilmu Kesehatan MEKANISME RESISTENSI.
REAKSI-REAKSI SENYAWA KARBONIL TAK JENUH
Assalamu’alaikum Wr. Wb.
SIFAT ANTIOKSIDAN DARI DUA VARIETAS APEL SELAMA PENYIMPANAN JANGKA PANJANG Hendrawan Saputra
Aspek Umum Molekul Enzim. Figure 2-44 Molecular Biology of the Cell (© Garland Science 2008) Energi Aktivasi.
PROTEIN Pembentukan molekul protein Asam amino Protein.
ENZIM, PROTEIN DAN ASAM AMINO
Penentuan Interaksi dan Energi Pengikatan Enzim DNA Pol I Taq Terhadap DNA, dCTP, dan Ion Pirofosfat dengan Simulasi Dinamika Molekul Rabu, 26 Mei 2010.
KATALITIK PROTEIN (ENZIM)
STANDAR KOMPETENSI: 3. Memahami kinetika reaksi, kesetimbangan kimia, dan faktor-faktor yang mempengaruhinya, serta penerapannya dalam kehidupan sehari-hari.
Deana Wahyuningrum, S.Si, M.Si
PENGARUH SUHU PADA REAKSI ENZIMATIK
Oleh Rosmaya Dewi Nurul Widya
Sistiana Windyariani, Pend Bio UMMI
Enzim Karakteristik: kekuatan daya katalitik dan kespesifikan
ENZIM Enzim adalah bio katalisator , yang artinya dapat mempercepat reaksi – reaksi biologi tanpa mengalami perubahan struktur kimia. Menurut kuhne (1878),
Oleh : Gebby Citra (H ) ENZIM.
Bioanor OT 24a OrgTin Organotimah(IV) sebagai antimalaria Menurut Munoz et al. (2000) hasil uji aktivitas in vivo antimalaria dikategorikan menjadi 4 kategori.
KINETIKA ENZIM Penting untuk : Memahami fungsi katalitik
PROLINE-SPECIFIC AMINOPEPTIDASE ENZYME
Protein Engineering: Site-Directed Mutagenesis dan Directed Evolution
19 March 2014Rizky Nurhayati. #1 PENDAHULUAN Faktor timbulnya penyakit jantung koroner (PJK) adalah dislipidemia atau adanya peningkatan serum lipid,
GENETIKA MIKROORGANISME
METABOLISME SERANGKAIAN REAKSI KIMIA YANG TERJADI DI DALAM TUBUH ORGANISME HIDUP YANG DIBANTU OLEH SEKELOMPOK ENZIM DAN DIATUR DENGAN SANGAT KETAT TERBAGI.
Enzim.
KESIMPULAN Kesimpulan
Kelompok: H Nama Kelompok: Lailatul Hikmah
Genetika Bakteri dan Virus
ALDEHID & KETON.
PROTEIN.
Ir. Niken Astuti, MP. Prodi Peternakan, Fak. Agroindustri, UMB YOGYA
AMINA Senyawa yang mengandung gugus NH2 Strukrur : RNH2
ENZIM.
Bab 7 Beberapa Faktor yang Memengaruhi Reaksi Enzimatik
Enzim ( KLASIFIKASI ENZIM, STRUKTUR ENZIM DAN MEKANISME KERJA ENZIM )
ENZIM.
Asam Karboksilat & Turunannya
PEMULIAAN MIKROBA PRINSIP TEKNIK FERMENTASI PROGRAM STUDI MIKROBIOLOGI
ENZIM Burhannudin Ichsan.
ENZYME CATALYSIS KELOMPOK 6 Anisa Silvia ( )
STANDAR KOMPETENSI: 3. Memahami kinetika reaksi, kesetimbangan kimia, dan faktor-faktor yang mempengaruhinya, serta penerapannya dalam kehidupan sehari-hari.
Enzim sebagai Protein Katalis dr
BAB 8 Karbohidrat, Protein, dan Biomolekul Standar Kompetensi
Kelompok 3 : 1. Akbar Saitama 2. Listia Nur Afifi 3. Regina Pramitha
Kofaktor, Koenzim, Apoenzim & Proenzim dr
Struktur dan kinetika enzim
ENZIM Inti Mulyo Arti, STP, MSc.
ENZIM.
PENGERTIAN BIOKIMIA & LOGIKA MOLEKUL MAKHLUK HIDUP
ENZYM DAN COENZYM OLEH KELOMPOK 5 HAIRAN WALI KASMAWATI FATIMAH
GARAM DIAZONIUM & SENYAWA AZO
Assalamualaikum wr.wb NAMA KELOMPOK : - Dara Lailatul Marwah
Tata Nama Amina alifatik sederhana dinamakan dengan gugus alkil yang terikat pada atom N dan diberi akhiran amina.
ENZIM 15 November 2017.
Senyawa yang mempunyai 2 gugus organik melekat pada atom O tunggal
ALKIL HALIDA/HALO ALKANA
MEKANISME REAKSI KATALISIS
PENJADWALAN PERKULIAHAN MENGGUNAKAN ALGORITME GENETIKA
Klasifikasi enzim.
ENZIM INDRI KUSUMA DEWI,S.Farm.,M.Sc.,Apt..
Enzim Pangan Hasil Ternak-S1
Pokok Bahasan Laju reaksi Definisi, penentuan laju sesaat
4.3Mendeskripsikan struktur, tatanama, penggolongan, sifat dan kegunaan makromolekul (polimer, karbohidrat, dan protein). 4.4Mendeskripsikan struktur,
Powerpoint Templates LISOSOM Pengertian lisosom Pembentukan lisosom Enzim lisosom Fungsi dan peran lisosom Jenis lisosom.
Transcript presentasi:

Enzimologi Billy Harnaldo Putra / 20511305 Tugas Mata Kuliah Enzimologi Billy Harnaldo Putra / 20511305 Ridho Brilliantoro / 20512055

Teknik Rekayasa dan Karakterisasi Kristal Enzim Methylaspartate Ammonia Lyase untuk Sintesis Asimetris Unnatural Asam Amino

Teknik Rekayasa Enzim Latar Belakang Aktivitas Katalitik Enzim Lebih Baik Lebih Bervariasi

Biokatalis Reaksi Sintesis Asimetris Latar Belakang Enzim MAL Biokatalis Reaksi Sintesis Asimetris Isolat Mutan Q73A Rekayasa Enzim MAL (wild-type) (Raj et al., 2012) Isolat Mutan L843A

substrat non-native derivat as. fumarat (elektrofil) Latar Belakang Karakter Enzim sisi aktif pengikatan tunggal Enzim Q73A Enzim L843A substrat non-native senyawa amina (nukleofil) substrat non-native derivat as. fumarat (elektrofil) Sintesis Unnatural Asam Amino

Metodologi Preparasi & skrining library mutan Pemurnian, kristalisasi & penentuan struktur molekul Simulasi molecular docking Ekspresi enzim dan karakterisasi kinetik Identifikasi dan konfigurasi produk asam amino

Hasil dan Pembahasan Aktivitas katalitik enzim Q73A substrat mesconate & variasi amina (nukleofilik)

Hasil dan Pembahasan Karakteristik enzim mutan MAL Q73A mengkatalisis reaksi pada substrat nukleofilik (variasi senyawa amina –RNH2) dengan mesconate. Aktivitas katalitik enzim mutan MAL Q73A kemampuan konversi maksimum pada substrat ethoxyamine dengan persentase konversi sebesar 99%

Hasil dan Pembahasan Aktivitas katalitik wild-type dan enzim L384A substrat amonia dan variasi asam fumarat (elektrofilik)

Parameter kinetika reaksi katalisis wild-type & mutan MAL Hasil dan Pembahasan Parameter kinetika reaksi katalisis wild-type & mutan MAL Grafik diatas menunjukkan hubungan persentase konversi produk terhadap waktu reaksi sintesis pada kondisi optimum menggunakan: katalis Q73A pada substrat methylamine, cyclobutylamine dan ethoxyamine katalis L384A pada substrat fumarate, 2-hexyl fumaratedan 2-(benzyloxy) fumarate

Hasil dan Pembahasan Parameter kinetik katalisis dengan enzim wild-type MAL dan Q73A pada substrat nukleofilik

Mutan L384A menunjukkan aktivitas terhadap semua substrat yang diuji. Hasil dan Pembahasan Mutan L384A menunjukkan aktivitas terhadap semua substrat yang diuji. Hal ini diperlihatkan oleh nilai Km rendah maka afinitasnya lebih tinggi. Selain itu, nilai kcat menjadi lebih besar untuk substrat dengan rantai alkil panjang (1d-1g) dan dibandingkan dengan rantai alkil pendek (1a-1c).

Hasil dan Pembahasan Parameter kinetik katalisis dengan enzim wild-type MAL dan L384A pada substrat elektrofilik

Hasil dan Pembahasan Mutan Q73A menunjukkan tingkat katalitik tertinggi dalam penambahan metilamin pada mesaconate dan tingkat katalitik terendah dalam penambahan metilamin pada cyclobutylamin. Perbandingan nilai kcat/Km menunjukkan bahwa mutan Q73A 140 kali lipat lebih efisien dalam penambahan metilamin dibandingkan dengan wild-type MAL.

Perbandingan struktur Q73A dan L384A serta wild type MAL Hasil dan Pembahasan Analisis Docking Analisis situs aktif dari mutan Q73A dan L384A yang dimodelkan kembali untuk mengakomodasi substrat baru Perbandingan struktur Q73A dan L384A serta wild type MAL Hasil ini menunjukkan bahwa substrat diperluas spektrum mutan Q73A dan L384A dikarenakan dengan penggantian situs residu aktif yang besar dengan yang lebih kecil, sehingga situs aktif diperbesar & dapat mengakomodasi substrat baru Perbandingan wild-type MAL (a), Mutan Gln73Ala (b), Mutan Leu384Ala (c)

Hasil dan Pembahasan Situs aktif dari Q73A dan Mutan L384A dapat menampung substrat yang lebih besar daripada situs aktif wild type MAL, kami melakukan komparatif dengan simulasi docking. Molecular docking substrat pada sisi aktif wild-type MAL dan 2 Mutan MAL

Simpulan Rekayasa enzim melalui proses mutasi genetik dapat menghasilkan enzim mutan yang memiliki aktivitas katalitik dan sebaran substrat yang bervariasi, baik pada substrat nukleofilik maupun elektrofilik. Enzim MAL hasil mutasi dapat diaplikasikan dalam sintesis asimetris unnatural asam amino.