Presentasi sedang didownload. Silahkan tunggu

Presentasi sedang didownload. Silahkan tunggu

Oleh : Reza Aditama 20509022 PROLINE-SPECIFIC AMINOPEPTIDASE ENZYME.

Presentasi serupa


Presentasi berjudul: "Oleh : Reza Aditama 20509022 PROLINE-SPECIFIC AMINOPEPTIDASE ENZYME."— Transcript presentasi:

1 Oleh : Reza Aditama 20509022 PROLINE-SPECIFIC AMINOPEPTIDASE ENZYME

2 4/22/2015 2 Agenda Pendahuluan Tata Nama Struktur Mekanisme Reaksi Regulasi Purifikasi dan Karakterisasi Aplikasi

3 4/22/2015 3 Pendahuluan Aminopeptidase  Enzim yang mengkatalisis reaksi hidrolisis atau pemutusan asam amino terminal dari protein atau peptida Pada kingdom hewan dan tanaman banyak ditemukan aminopeptidase Aminopeptidase essensial untuk : - Protein maturation - Degradasi peptida hormonal dan non-hormonal

4 4/22/2015 4 Reaksi yang dikatalisis oleh Aminopeptidase aminopeptidase Peptida  Peptida (lebih pendek)

5 4/22/2015 5 Klasifikasi Aminopeptidase Terdapat beberapa klasifikasi untuk enzim aminopeptidase diantaranya adalah berdasarkan : - Jumlah asam amino yang diputus dari NH 2 terminal substrat. co / aminopeptidase, diaminopeptidase - Efisiensi dari asam amino yang diputus dari suatu protein atau peptida. co / Leucine aminopeptidase, prolin aminopeptidase - pH optimum untuk aktivitasnya (basa, asam, atau netral) - Ion atau logam yang diikat pada enzim

6 4/22/2015 6 Prolin Aminopeptidase Prolin Aminopeptidase  Enzim yang mengkatalisis reaksi hidrolisis atau pemutusan spesifik terhadap residu prolin pada suatu protein atau peptida Ukuran protein bervariasi  Isolasi dari E.Coli : 49.650 Da Jumlah residu : 440

7 4/22/2015 7 Distribusi Prolin Aminopeptidase D.F. Cunningham, B. O’ConnorrBiochimica et Biophysica Acta 1343 (1997) 160–186

8 4/22/2015 8 Tata Nama NC-IUBMB 3. Hydrolases 3.4 Acting on peptide bonds (peptidases) 3.4.11 Aminopeptidases 3.4.11.93.4.11.9 Xaa-Pro aminopeptidase

9 4/22/2015 9 Struktur Prolin Aminopeptidase -Homologi mirip dengan AMPM -4 subunit : A,B,C,D -Ion Mn 2+ - 440 residu asam amino Wilce et.al Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95 (1998)

10 4/22/2015 10 Folded Prolin Aminopeptidase Terdiri dari 2 domain : Domain I (1-174) : 6 β-sheet dan 4 α-helix Domain 2 (175-440) : 6 β-sheet dan 7 α-helix Wilce et.al Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95 (1998)

11 4/22/2015 11 Active Site Prolin Aminopeptidase Wilce et.al Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95 (1998)

12 4/22/2015 12 Stereoview Active Site Prolin Aminopeptidase Wilce et.al Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95 (1998)

13 4/22/2015 13 Mekanisme Katalisis Wilce et.al Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95 (1998)

14 4/22/2015 14 Mekanisme Katalisis SGAP (1) Y. Fundoiano-Hershcovitz et al. / FEBS Letters 571 (2004) 192–196

15 4/22/2015 15 Mekanisme Katalisis SGAP (2) Y. Fundoiano-Hershcovitz et al. / FEBS Letters 571 (2004) 192–196

16 4/22/2015 16 Fungsi Dinuclear Metal Hiroshi Sakiyama, et.al, Inorganica Chimica Acta 351 (2003) 256/260

17 4/22/2015 17 Inhibisi

18 4/22/2015 18 Substrat Ideal

19 4/22/2015 19 Inhibisi oleh bestatin Allen Taylor, FASEBJ. 7: 290-298; 1993.

20 4/22/2015 20 Inhibisi oleh bestatin Allen Taylor, FASEBJ. 7: 290-298; 1993.

21 4/22/2015 21 Purifikasi Ekstraksi dengan Tris-HCl buffer+NaCl 150mM, sentrifugasi dengan 13000 x g selama 20 menit Presipitasi dengan Asam Klorida lalu disentrifugasi dengan 13000 x g selama 20 menit Heat inactivation  inkubasi 45 o C selama 1 jam lalu disentrifugasi dengan 13000 x g selama 20 menit Fraksinasi dengan Amonium Sulfat Anion Exchange Chromatography (DEAE Sephadex) Gel Permeasi (Sephadex G-100) Adsorption Chromatography ( hydroxylapatite) F.C. Gollich et.al Protein Expression and Purification 47 (2006) 634-639

22 4/22/2015 22 Purifikasi F.C. Gollich et.al Protein Expression and Purification 47 (2006) 634-639

23 4/22/2015 23 Karakterisasi

24 4/22/2015 24 Aplikasi http://www.biotek.lipi.go.id/wartabiotek/warta11.pdf

25 4/22/2015 25 Aplikasi

26 Terima Kasih


Download ppt "Oleh : Reza Aditama 20509022 PROLINE-SPECIFIC AMINOPEPTIDASE ENZYME."

Presentasi serupa


Iklan oleh Google